Resekwencjonowanie całego genomu bakterii i grzybów
Projekty resekwencjonowania całego genomu bakterii i grzybów mają kluczowe znaczenie dla rozwoju genomiki mikrobiologicznej, umożliwiając kompletowanie i porównywanie genomów mikroorganizmów. Ułatwia to inżynierię fermentacyjną, optymalizację procesów przemysłowych i badanie szlaków metabolizmu wtórnego. Ponadto, resekwencjonowanie grzybów i bakterii ma kluczowe znaczenie dla zrozumienia adaptacji środowiskowej, optymalizacji szczepów i ujawnienia dynamiki ewolucji genetycznej, co ma szerokie implikacje w medycynie, rolnictwie i naukach o środowisku.
Zalety usługi
●Analiza bioinformatyczna obejmuje wywoływanie wariantów:Dostarczanie spostrzeżeń funkcjonalnych na temat ponownie sekwencjonowanych genomów.
● Szeroka wiedza specjalistyczna:Corocznie realizujemy tysiące projektów ponownego sekwencjonowania mikroorganizmów, co daje nam ponad 10 lat doświadczenia, wysoko wykwalifikowany zespół analityków, wszechstronne treści i doskonałe wsparcie posprzedażowe.
●Wsparcie posprzedażowe:Nasze zaangażowanie wykracza poza ukończenie projektu i obejmuje 3-miesięczny okres obsługi posprzedażowej. W tym czasie oferujemy monitorowanie projektu, pomoc w rozwiązywaniu problemów oraz sesje pytań i odpowiedzi, aby odpowiedzieć na wszelkie pytania dotyczące wyników.
Specyfikacje usług
| Platforma sekwencjonowania | Strategia sekwencjonowania | Zalecane dane | Kontrola jakości |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Głębokość 100x | Q30≥85% |
Przykładowe wymagania
| Stężenie (ng/µl) | Całkowita ilość (ng) | Objętość (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterie: ≥1x107 komórki
Grzyby jednokomórkowe: ≥5x106-1x107 komórki
Grzyby makro: ≥4g
Przepływ pracy serwisowej
Dostawa próbek
Budowa biblioteki
Sekwencjonowanie
Analiza danych
Usługi posprzedażowe
Zawiera następującą analizę:
- Kontrola jakości danych sekwencjonowania
- Dopasowanie do genomu referencyjnego
- Wywołanie wariantowe: SNP i InDel
- Adnotacja wariantu
Wywołanie wariantowe: typy SNP
Wywołanie wariantu: rozkład długości InDel
Zapoznaj się z postępem technicznym, jaki osiągnięto dzięki usługom resekwencjonowania genomu mikrobiologicznego firmy BMKGene, przeglądając starannie dobrany zbiór publikacji.
Jia, Y. i in. (2023) „Połączenie transkryptomu i ponownego sekwencjonowania całego genomu w celu przebadania genów oporności na choroby związane z łuszczycą karłowatą pszenicy”,Międzynarodowe czasopismo nauk molekularnych, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. i in. (2023) „Metabolizm glukozy kontrolowany ampicyliną wpływa na przejście bakterii od tolerancji do oporności”,Postępy nauki, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. i in. (2022) „Aliidomarina halalkaliphila sp. nov., bakteria haloalkalifilowa wyizolowana z jeziora sodowego w regionie autonomicznym Mongolii Wewnętrznej w Chinach”, Int. J. Syst. Evol.Mikrobiologia, 72, s. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. i Wang, G.-H. (2024) „Sekwencja genomu Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, wyizolowanego z Nasonia vitripennis”,Ogłoszenia dotyczące zasobów mikrobiologicznych. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
