-
Integracja ATAC-seq i RNA-seq w celu odkrycia mechanizmów regulacyjnych stojących za ekspresją genów
Integracja ATAC-seq i RNA-seq w celu odkrycia mechanizmów regulacyjnych stojących za ekspresją genów. Od ekspresji genów do regulacji genów. Zrozumienie, w jaki sposób ekspresja genów zmienia się w różnych warunkach biologicznych, jest podstawowym celem współczesnej genomiki. Sekwencjonowanie RNA (RNA-seq) zapewnia potężne...Przeczytaj więcej -
Zastosowania multiomiczne w biotechnologii: od odkryć biologicznych do rozwiązań inżynieryjnych
Zastosowania multiomiczne w biotechnologii: od odkryć biologicznych do rozwiązań inżynieryjnych Biotechnologia wykorzystuje żywe organizmy, komórki, społeczności biologiczne i biocząsteczki do opracowywania wartościowych produktów, rozwijania technologii i stawiania czoła wyzwaniom przemysłowym, środowiskowym i zdrowotnym.Przeczytaj więcej -
SLAF-seq: narzędzie do wykrywania zmienności genetycznej w populacjach
SLAF-seq: Elastyczne podejście do badań genetycznych w skali populacji Czym jest SLAF-seq? Sekwencjonowanie fragmentów amplifikowanych w określonym locusie (SLAF-seq) to technika sekwencjonowania genomu o zredukowanej reprezentacji, wykorzystywana do odkrywania markerów genetycznych w całym genomie bez konieczności posiadania genomu referencyjnego...Przeczytaj więcej -
Odblokowywanie cech roślin poprzez epigenomikę w hodowli roślin poliploidalnych
Odkrywanie cech roślin poprzez epigenomikę w hodowli roślin poliploidalnych 1. Wstęp: paradoks poliploidalny i więcej sekwencji DNA Wiele z najważniejszych upraw świata, w tym pszenica chlebowa (Triticum aestivum), bawełna (Gossypium hirsutum), rzepak (Brassica napus) i ziemniak (Solanum t...Przeczytaj więcej -
Błąd genomu referencyjnego: dlaczego wybór właściwego genomu referencyjnego ma znaczenie
Błąd genomu referencyjnego: dlaczego wybór właściwego genomu referencyjnego jest ważny Niezależnie od tego, czy wykonujesz sekwencjonowanie całego genomu (WGS), sekwencjonowanie RNA (RNA-seq), czy sekwencjonowanie o zredukowanej reprezentacji, takie jak SLAF-seq, jednym z pierwszych kroków analizy danych jest dopasowanie odczytów sekwencjonowania do genomu referencyjnego...Przeczytaj więcej -
Strategie omics w badaniach nad zwierzętami wodnymi
Strategie omics w badaniach nad zwierzętami wodnymi. Zwierzęta wodne obejmują ryby, mięczaki, skorupiaki, bezkręgowce bentoniczne i kręgowce morskie. Charakteryzują się niezwykłą różnorodnością gatunkową, unikalnymi cechami genomowymi i silną plastycznością fenotypową w reakcji na zmiany środowiskowe...Przeczytaj więcej -
Od genów markerowych do DNA całej społeczności: kompleksowe porównanie amplikonów i sekwencjonowania metagenomicznego metodą shotgun
Od genów markerowych do DNA całej społeczności: kompleksowe porównanie amplikonów i sekwencjonowania metagenomicznego metodą shotgun. Badania nad społecznościami mikroorganizmów stanowią fundamentalną podstawę do odkrywania ukrytych interakcji w glebie, wodzie, jelitach i innych ekosystemach środowiskowych. Aby zdekodować...Przeczytaj więcej -
Epigenetyka w czasie rzeczywistym: odkrywanie modyfikacji RNA za pomocą bezpośredniego sekwencjonowania nanoporowego
Epigenetyka w czasie rzeczywistym: odkrywanie modyfikacji RNA za pomocą bezpośredniego sekwencjonowania nanoporowego Aby w pełni zrozumieć funkcjonowanie komórek, ich rozwój i postęp choroby, musimy wyjść poza samą sekwencję DNA i zbadać dodatkowe warstwy informacji biologicznej, które regulują aktywność genów...Przeczytaj więcej -
Łączenie taksonomii, funkcji i metabolizmu poprzez integrację multiomiczną
Łączenie taksonomii, funkcji i metabolizmu poprzez integrację multiomiczną Coraz powszechniejsze wykorzystanie technologii multiomicznych do badania chorób i systemów środowiskowych stworzyło rosnącą potrzebę integracji zbiorów danych z różnych warstw biologii. W badaniach mikrobiomu ta integracja...Przeczytaj więcej -
Od próbki do sekwencji: najlepsze praktyki przygotowania próbek środowiskowych w badaniach mikrobiomu
Od próbki do sekwencji: najlepsze praktyki w zakresie przygotowania próbek środowiskowych w badaniach mikrobiomu. Mikrobiologia środowiskowa zrewolucjonizowała nasze rozumienie ekosystemów mikrobiologicznych – od gleby i wody po ludzkie ciało. Jednak w najlepszych praktykach badań mikrobiomu jedna prawda pozostaje oczywista...Przeczytaj więcej -
Studium przypadku: Konstrukcja największego i najbardziej zróżnicowanego genetycznie pangenomu grafu bawełny górskiej
Studium przypadku: Konstrukcja największego i najbardziej zróżnicowanego genetycznie pangenomu grafu bawełny górskiej 2026. Wczesny przełom: Skonstruowano największy i najbardziej zróżnicowany genetycznie pangenom grafu bawełny górskiej (Gossypium hirsutum). BMKGENE współpracowało przy sekwencjonowaniu genomu (PacBio...Przeczytaj więcej -
Sekwencjonowanie ultradługich odczytów: kluczowe narzędzie do montażu genomu wysokiej jakości na poziomie T2T
Sekwencjonowanie ultradługiego odczytu: kluczowe narzędzie do wysokiej jakości składania genomu na poziomie T2T Ciągły rozwój genomów referencyjnych Genomy referencyjne stanowią podstawę analizy danych genomicznych i multiomicznych, a wysokiej jakości genomy referencyjne mają kluczowe znaczenie dla dogłębnej analizy gatunków...Przeczytaj więcej -
Jak zaawansowana analiza hWGS/WES wspiera badania nad precyzyjną onkologią
Jak zaawansowana analiza hWGS/WES wspiera precyzyjne badania onkologiczne? Genomy nowotworów są wyjątkowo złożone. W przeciwieństwie do próbek linii zarodkowej, tkanki nowotworowe mogą zawierać mutacje somatyczne, zmiany liczby kopii, rearanżacje strukturalne, heterogeniczność klonalną i odrębne sygnatury mutacji, które odzwierciedlają…Przeczytaj więcej
