-
PacBio-pełnej długości transkryptom (brak odniesienia)
Platforma Amplicon (16S/18S/ITS) została opracowana dzięki wieloletniemu doświadczeniu w analizie projektów dotyczących różnorodności drobnoustrojów, która zawiera ustandaryzowaną analizę podstawową i analizę spersonalizowaną: analiza podstawowa obejmuje treść analizy głównego nurtu bieżących badań mikrobiologicznych, treść analizy jest bogata i wszechstronna, a wyniki analiz prezentowane są w formie raportów projektowych;Treść spersonalizowanej analizy jest zróżnicowana.Próbki można wybierać, a parametry można elastycznie ustawiać zgodnie z podstawowym raportem analitycznym i celem badawczym, aby zrealizować spersonalizowane wymagania.System operacyjny Windows, prosty i szybki.
-
PacBio-pełnej długości transkryptom (brak odniesienia)
Biorąc jako dane wejściowe dane sekwencjonowania izoform Pacific Biosciences (PacBio), ta aplikacja jest w stanie zidentyfikować sekwencje transkrypcji pełnej długości (bez składania).Przez mapowanie sekwencji o pełnej długości w stosunku do genomu referencyjnego, transkrypty mogą być optymalizowane przez znane geny, transkrypty, regiony kodujące itp. W tym przypadku można osiągnąć dokładniejszą identyfikację struktur mRNA, taką jak alternatywny splicing itp.Wspólna analiza z danymi sekwencjonowania transkryptomu NGS umożliwia bardziej kompleksowe przypisywanie i dokładniejsze oznaczenie ilościowe ekspresji na poziomie transkryptu, co w dużej mierze przynosi korzyści w dalszej ekspresji różnicowej i analizie funkcjonalnej.
-
Zestawy narzędzi
BMKCloud to wiodąca platforma bioinformatyczna zapewniająca kompleksowe rozwiązanie dla programów genomicznych, która cieszy się dużym zaufaniem naukowców z różnych dziedzin, w tym medycznych, rolniczych, środowiskowych itp. BMKCloud zobowiązuje się do świadczenia zintegrowanych, niezawodnych i wydajnych usług, w tym platform i narzędzi do analizy bioinformatycznej , zasoby komputerowe, publiczna baza danych, bioinformatyczne kursy online itp. BMKCloud ma różne często używane narzędzia bioinformatyczne, w tym adnotacje genów, ewolucyjne narzędzia genetyczne, ncRNA, kontrolę jakości danych, montaż, wyrównanie, ekstrakcję danych, mutacje, statystyki, generator figur, sekwencje analiza itp.
-
małe RNA
Małe RNA to rodzaj krótkich niekodujących RNA o średniej długości 18-30 nt, w tym miRNA, siRNA i piRNA.Powszechnie donoszono, że te małe RNA są zaangażowane w różne procesy biologiczne, takie jak degradacja mRNA, hamowanie translacji, tworzenie heterochromatyny itp. Analiza sekwencjonowania małych RNA jest szeroko stosowana w badaniach nad rozwojem zwierząt/roślin, chorobami, wirusami itp. Małe RNA Platforma analizy sekwencjonowania składa się ze standardowej analizy i zaawansowanej eksploracji danych.Na podstawie danych RNA-seq, standardowa analiza może zapewnić identyfikację i przewidywanie miRNA, przewidywanie docelowych genów miRNA, analizę adnotacji i ekspresji.Zaawansowana analiza umożliwia spersonalizowane wyszukiwanie i ekstrakcję miRNA, generowanie diagramów Venna, budowanie miRNA i sieci genów docelowych.
-
NGS-WGS (Podświetlenie/BGI)
NGS-WGS to platforma do analizy resekwencjonowania całego genomu, która została opracowana w oparciu o bogate doświadczenie w technologiach Biomarker.Ta łatwa w użyciu platforma umożliwia szybkie przesłanie zintegrowanego przepływu pracy analizy poprzez proste ustawienie kilku podstawowych parametrów, które pasują do danych sekwencjonowania DNA generowanych zarówno z platformy Illumina, jak i platformy sekwencjonowania BGI.Platforma ta jest wdrożona na wysokowydajnym serwerze obliczeniowym, który umożliwia bardzo wydajną analizę danych w bardzo ograniczonym czasie.Spersonalizowana eksploracja danych jest dostępna w oparciu o standardowe analizy, w tym zapytanie o zmutowane geny, projektowanie starterów PCR itp.
-
mRNA (odniesienie)
Transkryptom jest łącznikiem między genomową informacją genetyczną a proteomem funkcji biologicznej.Regulacja poziomu transkrypcji jest najważniejszym i najszerzej badanym sposobem regulacji organizmów.Sekwencjonowanie transkryptomu może sekwencjonować transkryptom w dowolnym momencie lub w dowolnych warunkach, z rozdzielczością z dokładnością do jednego nukleotydu. Może dynamicznie odzwierciedlać poziom transkrypcji genów, jednocześnie identyfikować i określać ilościowo rzadkie i normalne transkrypty oraz dostarczać informacji strukturalnych próbki konkretnych transkryptów.
Obecnie technologia sekwencjonowania transkryptomów jest szeroko stosowana w agronomii, medycynie i innych dziedzinach badawczych, w tym regulacji rozwoju zwierząt i roślin, adaptacji środowiskowej, interakcji immunologicznych, lokalizacji genów, ewolucji genetycznej gatunków oraz wykrywania nowotworów i chorób genetycznych.
-
Metagenomika (NGS)
Ta platforma analityczna jest przeznaczona do analizy danych metagenomicznych shotgun w oparciu o wieloletnie doświadczenie.Składa się ze zintegrowanego przepływu pracy zawierającego różne powszechnie potrzebne analizy metagenomiczne, w tym przetwarzanie danych, badania na poziomie gatunku, badania na poziomie funkcji genów, łączenie metagenomów itp. Ponadto w standardowym przepływie pracy dostępne są niestandardowe narzędzia do eksploracji danych, w tym zapytania dotyczące genów i gatunków , ustawienie parametrów, spersonalizowane generowanie figur itp.
-
LncRNA
Długie niekodujące RNA (lncRNA) to rodzaj transkryptów o długości większej niż 200 nt, które nie są w stanie kodować białek.Zgromadzone dowody sugerują, że większość lncRNA z dużym prawdopodobieństwem będzie funkcjonalna.Wysokowydajne technologie sekwencjonowania i narzędzia do analizy bioinformatycznej pozwalają nam skuteczniej ujawniać sekwencje lncRNA i informacje o pozycjonowaniu oraz prowadzą nas do odkrywania lncRNA o kluczowych funkcjach regulacyjnych.BMKCloud z dumą dostarcza naszym klientom platformę do analizy sekwencjonowania lncRNA w celu uzyskania szybkiej, niezawodnej i elastycznej analizy lncRNA.
-
GWAS
Badanie asocjacyjne całego genomu (GWAS) ma na celu identyfikację wariantów genetycznych (genotyp) powiązanych z określonymi cechami (fenotypem).Badania GWA badają markery genetyczne w całym genomie dużej liczby osób i przewidują związki genotyp-fenotyp poprzez analizę statystyczną na poziomie populacji.Resekwencjonowanie całego genomu może potencjalnie wykryć wszystkie warianty genetyczne.W połączeniu z danymi fenotypowymi, GWAS można przetwarzać w celu identyfikacji SNP, QTL i genów kandydujących związanych z fenotypem, co silnie wspiera nowoczesną hodowlę zwierząt/roślin.SLAF to opracowana przez siebie strategia uproszczonego sekwencjonowania genomu, która umożliwia odkrycie markerów rozproszonych w całym genomie, SNP.Te SNP, jako molekularne markery genetyczne, mogą być przetwarzane do badań asocjacyjnych z ukierunkowanymi cechami.Jest to opłacalna strategia identyfikacji złożonych cech związanych z wariacjami genetycznymi.
-
Transkryptomika Nanopore pełnej długości
Złożone i zmienne alternatywne izoformy w organizmach są ważnymi mechanizmami genetycznymi regulującymi ekspresję genów i różnorodność białek.Dokładna identyfikacja struktur transkryptów jest podstawą do dogłębnych badań wzorców regulacji ekspresji genów.Platforma do sekwencjonowania Nanopore z powodzeniem doprowadziła badania transkryptomiczne do poziomu izoform.Ta platforma analityczna jest przeznaczona do analizowania danych RNA-Seq wygenerowanych na platformie Nanopore na podstawie genomu referencyjnego, który umożliwia analizy jakościowe i ilościowe zarówno na poziomie genów, jak i na poziomie transkryptów.
