Produkty

Sekwencjonowanie DNA/RNA – Sekwenser Nanoporów

Sekwencjonowanie DNA/RNA – obraz przedstawiający sekwencer nanoporowy

Sekwencjonowanie ONT to technologia sekwencjonowania sygnału elektrycznego w czasie rzeczywistym pojedynczej cząsteczki, oparta na nanoporach. Zasada sekwencjonowania każdej platformy jest taka sama.Dwuniciowy DNA/RNA zwiąże się z nanoporowatym białkiem osadzonym w biofilmie i rozwijając się pod przewodnictwem białka motorycznego, pod wpływem różnicy napięcia po obu stronach biofilmu nici DNA/RNA przechodzą przez białkowy kanał nanoporowy w określonej temperaturze wskaźnik.Ze względu na różnice we właściwościach chemicznych różnych zasad nici DNA/RNA, przejście pojedynczej zasady lub cząsteczki DNA przez kanał nanoporów powoduje zmianę różnych sygnałów elektrycznych.Wykrywając i odpowiadając tym sygnałom, można obliczyć odpowiednie typy zasad i zakończyć wykrywanie sekwencji w czasie rzeczywistym.

Skontaktuj się z nami

Szczegóły usługi

Wynik demonstracyjny

Szczegóły usługi Funkcje

Platforma	Rozmiar biblioteki	Teoretyczna wydajność danych (na komórkę)	Dokładność pojedynczej podstawy	Aplikacje
Nanopor	8 kb, 10 kb, 20 kb, ultradługie, cDNA-PCR	70-90 Gb/komórkę	85-92%	Wywołanie SV, De novo, Sekwencjonowanie pełnej długości, Iso-Seq, Adnotacja genu, Wykrywanie metylacji DNA

Zalety serwisu

● Ponad 5 lat doświadczenia na platformie sekwencjonowania PacBio z tysiącami zamkniętych projektów z różnymi gatunkami.
● BMKGENE jest oficjalnym partnerem Oxford Nanopore, posiadającym podwójną platformę certyfikacji RNA/DNA.
● Istnieją główne modele sekwencerów z kompletnym wyposażeniem i wystarczającą przepustowością sekwencjonowania.
● W oparciu o platformę Nanopore opublikowano ponad 10 badań Denovo na zwierzętach i roślinach w czasopismach o międzynarodowej renomie.

Przykładowe wymagania

Typ próbki

Kwota

Stężenie (Qubit ®)

Tom

Czystość

Inni

Genomowe DNA

Zależy od wymagań dotyczących danych

≥20 ng/µl

≥15µl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Wyraźny pik przy 260 nm, brak zanieczyszczeń

Stężenie należy mierzyć za pomocą Qubitu i Kubitu/Nanoporu ≤ 2

Całkowity RNA

≥1,2 µg

≥100 μg/μl

≥15µl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; brak zanieczyszczeń

Wartość RIN ≥7,5

Przepływ pracy w serwisie

przygotowanie próbki

Budowa biblioteki

Sekwencjonowanie

Analiza danych

Dostawa projektu

Poprzedni: Sekwencjonowanie DNA/RNA – Illumina Sequencer

Następny: Sekwencjonowanie fragmentów amplifikowanych w specyficznym locus (SLAF-Seq)

Ocena jakości danych próbki DNA

Tabela 1. Statystyki dotyczące czystych danych.

BMKID	surowyNrSekw	surowaSumaBase	cleanSeqNum	czystaSumaBase	czysteN50Len	czysteN90Len	czystyŚredniLen	czystyMaxLen	czystaŚredniaJakość
DNA_BMK01	1 218 239	26.37	1 121 736	25,90	28014	15764	23090	143181	9

Ocena jakości danych próbki RNA

Tabela 1. Statystyki dotyczące czystych danych.

Nazwa pliku	Identyfikator klienta	PrzeczytajNum	BaseNum	N50	Średnia długość	Maksymalna długość	Średni wynik Q
RNA_BMK001	C2	8947708	4 047 230 083	398	452	129227	Pytanie 12