条形 Banner-03

Produkty

Sekwencjonowanie DNA/RNA - sekwencer nanoporu

Sekwencjonowanie ONT jest technologią sekwencjonowania sygnałów elektrycznych w czasie rzeczywistym opartym na nanoporach, zasada sekwencjonowania każdej platformy jest taka sama. Dwucianiowy DNA/RNA będzie wiązał się z nanoporowatym białkiem osadzonym w biofilmie i odwijaniu pod przewodem białka motorycznego, pod działaniem różnicy napięcia z obu stron biofilmu, nici DNA/RNA przechodzą przez białko kanału nanopore wskaźnik. Ze względu na różnice właściwości chemicznych różnych zasad na nici DNA/RNA, gdy jedna podstawa lub cząsteczka DNA przechodzi przez kanał nanoporowy, spowoduje zmianę różnych sygnałów elektrycznych. Wykrywając i odpowiadając tym sygnałom, można obliczyć odpowiednie typy podstawowe, a wykrywanie sekwencji w czasie rzeczywistym można zakończyć.


Szczegóły dotyczące usługi

Wynik demo

Funkcje szczegółów serwisowych

Platforma

Rozmiar biblioteki

Dane teoretyczne (na komórkę)

Dokładność pojedynczej bazy

Zastosowania

Nanopore

8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, cDNA-PCR

70-90 GB/komórka

85-92%

SV Calling, de novo, sekwencjonowanie pełnej długości, sekwencjonowanie ISO, adnotacja genów, wykrywanie metylacji DNA

Zalety serwisowe

● Ponad 5 -letnie doświadczenie na platformie sekwencjonowania Pacbio z tysiącami zamkniętych projektów z różnymi gatunkami.
● BMKGENE jest oficjalnym partnerem Oxford Nanopore, z certyfikatem RNA/DNA z podwójną platformą.
● Istnieją główne modele sekwencerów z kompletnym sprzętem i wystarczającą przepustowością sekwencjonowania.
● W oparciu o platformę nanoporską ponad 10 badań dla zwierząt i roślin Denovo zostało opublikowanych w czasopismach znanych na całym świecie.

Wymagania przykładowe


Typ próbki

Kwota

Stonintion (Qubit ®)

Tom

Czystość

Inni

Genomowy DNA

Zależy od wymagań danych

 ≥20ng/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2.2;

OD260/230 ≥1,5 ;

Wyraźny pik przy 260 nm, bez zanieczyszczeń

Stężenie musi być mierzone za pomocą qubit i qubit/nanoporu ≤ 2

Całkowity RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ; Brak zanieczyszczeń

Wartość RIN ≥7,5

 

Przepływ pracy serwisowej

Przygotowanie próbki

Przygotowanie próbki

Przygotowanie biblioteki

Konstrukcja biblioteki

Sekwencjonowanie

Sekwencjonowanie

Analiza danych

Analiza danych

Próbka QC

Dostawa projektu


  • Poprzedni:
  • Następny:

  • Ocena jakości danych próbki DNA

    Tabela 1. Statystyki dotyczące czystych danych.

    Bmkid

    rawseqnum

    Rawsumbase

    CleanSeqnum

    Cleinsumbase

    CleanN50len

    CleanN90len

    CleanMeanlen

    CleanMaxlen

    CleanMeanqual

    DNA_BMK01

    1 218 239

    26,37

    1 121 736

    25,90

    28 014

    15 764

    23 090

    143 181

    9

    Ocena jakości danych próbki RNA

    Tabela 1. Statystyki dotyczące czystych danych.

    Nazwa pliku

    ClientId

    Readnum

    Basenum

    N50

    Średnia długość

    Maksymalna długość

    MeanqScore

    RNA_BMK001

    C2

    8 947 708

    4 047,230,083

    398

    452

    129 227

    Q12

    Rysunek 1. Rozkład długości odczytu

    A3

    Rysunek 2. Rozkład wyników jakości czystych danych

    A4

    Rysunek 3. Długość i jakość wyników czystych danych

    A5

    Zdobądź wycenę

    Napisz swoją wiadomość tutaj i wyślij ją do nas

    Wyślij do nas swoją wiadomość: