●Platforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Tryby sekwencjonowania:PE150
●Przeniesienie bibliotek Illumina doMGI:umożliwiając sekwencjonowanie dużych ilości danych przy niskich kosztach.
●Kontrola jakości bibliotek przed sekwencjonowaniem.
●Kontrola jakości i dostarczanie danych sekwencjonowania:dostarczanie raportu QC i surowych danych w formacie fastq po demultipleksowaniu i filtrowaniu odczytów Q30.
●Wszechstronność usług sekwencjonowania:Klient może wybrać kolejność według pasa lub ilości danych.
●Wysoka wydajność danych:1500 Gb/pasmo
●Dostarczenie raportu kontroli jakości sekwencjonowania:z metrykami jakości, dokładnością danych i ogólną wydajnością projektu sekwencjonowania.
●Proces sekwencjonowania dojrzałego:z krótkim czasem realizacji.
●Rygorystyczna kontrola jakości:stosujemy surowe wymogi kontroli jakości, aby zagwarantować dostarczanie wyników o niezmiennie wysokiej jakości.
| Ilość danych (X) | Stężenie (qPCR/nM) | Tom | |
| Częściowy pas ruchu
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 GB < X ≤ 100 GB | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 GB | ≥ 4 nM | ||
| Pojedynczy pas ruchu | Na pas ruchu | ≥ 1,5 nM / Pula bibliotek | ≥ 25 μl / Pula bibliotek |
Oprócz stężenia i całkowitej ilości, wymagany jest także odpowiedni wzór szczytowy.
Uwaga: Sekwencjonowanie ścieżek w bibliotekach o niskiej różnorodności wymaga wprowadzenia impulsu PhiX w celu zapewnienia niezawodnego wywoływania zasad.
Zalecamy przesłanie wstępnie skompletowanych bibliotek jako próbek. Jeśli chcesz, aby BMKGENE przeprowadził skompletowanie bibliotek, zapoznaj się z wymaganiami dotyczącymi bibliotek w zakresie sekwencjonowania częściowego.
Główny pik powinien mieścić się w granicach 300–450 pb.
Biblioteki powinny mieć pojedynczy główny pik, nie powinny zawierać zanieczyszczeń adaptera ani dimerów starterów.
Przed sekwencjonowaniem sporządzany jest raport na temat jakości biblioteki, oceniający ilość biblioteki i stopień fragmentacji.
Tabela 1. Statystyki danych sekwencjonowania.
| Identyfikator próbki | BMKID | Surowe odczyty | Surowe dane (bp) | Czyste odczyty (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Rysunek 1. Dystrybucja jakości wzdłuż odczytów w każdej próbce
Rysunek 2. Dystrybucja zawartości bazowej
Rysunek 3. Dystrybucja odczytanej zawartości w danych sekwencjonowania