Baner-03

Produkty

Biblioteki gotowe DNBSEQ

DNBSEQ, opracowana przez MGI, to innowacyjna technologia NGS, która pozwoliła na dalsze obniżenie kosztów sekwencjonowania i zwiększenie przepustowości. Przygotowanie bibliotek DNBSEQ obejmuje fragmentację DNA, przygotowanie ssDNA oraz amplifikację metodą toczącego się koła w celu uzyskania nanokul DNA (DNB). Następnie są one ładowane na powierzchnię stałą, a następnie sekwencjonowane metodą kombinatorycznej syntezy sonda-kotwica (cPAS). Technologia DNBSEQ łączy zalety niskiego współczynnika błędów amplifikacji z wykorzystaniem wzorców błędów o wysokiej gęstości z wykorzystaniem nanokul, co zapewnia sekwencjonowanie o wyższej przepustowości i dokładności.

Nasza usługa sekwencjonowania gotowych bibliotek umożliwia klientom przygotowanie bibliotek sekwencjonowania Illumina z różnych źródeł (mRNA, cały genom, amplikony, biblioteki 10x i inne), które są następnie konwertowane do bibliotek MGI w naszych laboratoriach w celu sekwencjonowania w DNBSEQ-T7, co pozwala na uzyskanie dużych ilości danych przy niższych kosztach.


Szczegóły usługi

Wynik demonstracyjny

Cechy

●Platforma:MGI-DNBSEQ-T7

●Tryby sekwencjonowania:PE150

●Przeniesienie bibliotek Illumina doMGI:umożliwiając sekwencjonowanie dużych ilości danych przy niskich kosztach.

●Kontrola jakości bibliotek przed sekwencjonowaniem.

●Kontrola jakości i dostarczanie danych sekwencjonowania:dostarczanie raportu QC i surowych danych w formacie fastq po demultipleksowaniu i filtrowaniu odczytów Q30.

 

Zalety

●Wszechstronność usług sekwencjonowania:Klient może wybrać kolejność według pasa lub ilości danych.

●Wysoka wydajność danych:1500 Gb/pasmo

●Dostarczenie raportu kontroli jakości sekwencjonowania:z metrykami jakości, dokładnością danych i ogólną wydajnością projektu sekwencjonowania.

●Proces sekwencjonowania dojrzałego:z krótkim czasem realizacji.

●Rygorystyczna kontrola jakości:stosujemy surowe wymogi kontroli jakości, aby zagwarantować dostarczanie wyników o niezmiennie wysokiej jakości.

 

Przykładowe wymagania

 

Ilość danych (X)

Stężenie (qPCR/nM)

Tom

Częściowy pas ruchu

   

X ≤ 10 Gb

≥ 1nM

≥ 25 μl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 GB < X ≤ 100 GB

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 GB

≥ 4 nM

 

Pojedynczy pas ruchu

Na pas ruchu

≥ 1,5 nM / Pula bibliotek

≥ 25 μl / Pula bibliotek

Oprócz stężenia i całkowitej ilości, wymagany jest także odpowiedni wzór szczytowy.

Uwaga: Sekwencjonowanie ścieżek w bibliotekach o niskiej różnorodności wymaga wprowadzenia impulsu PhiX w celu zapewnienia niezawodnego wywoływania zasad.

Zalecamy przesłanie wstępnie skompletowanych bibliotek jako próbek. Jeśli chcesz, aby BMKGENE przeprowadził skompletowanie bibliotek, zapoznaj się z wymaganiami dotyczącymi bibliotek w zakresie sekwencjonowania częściowego.

Rozmiar biblioteki (mapa szczytowa)

Główny pik powinien mieścić się w granicach 300–450 pb.

Biblioteki powinny mieć pojedynczy główny pik, nie powinny zawierać zanieczyszczeń adaptera ani dimerów starterów.

Przepływ pracy serwisowej

przygotowanie-próbek-
Sekwencjonowanie
Analiza danych
Próbka-QC

  • Poprzedni:
  • Następny:

  • Raport kontroli jakości biblioteki

    Przed sekwencjonowaniem sporządzany jest raport na temat jakości biblioteki, oceniający ilość biblioteki i stopień fragmentacji.

     

    Raport kontroli jakości sekwencjonowania

     

    Tabela 1. Statystyki danych sekwencjonowania.

    Identyfikator próbki

    BMKID

    Surowe odczyty

    Surowe dane (bp)

    Czyste odczyty (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22 870 120

    6 861 036 000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14 717 867

    4 415 360 100

    96,00

    98,95

    93,89

    37.08

    Rysunek 1. Dystrybucja jakości wzdłuż odczytów w każdej próbce

    A9

    Rysunek 2. Dystrybucja zawartości bazowej

    A10

    Rysunek 3. Dystrybucja odczytanej zawartości w danych sekwencjonowania

    A11

    uzyskaj wycenę

    Napisz tutaj swoją wiadomość i wyślij ją do nas

    Wyślij nam swoją wiadomość: