-
Sekwencjonowanie immunoprecypitacji chromatyny (ChIP-seq)
ChIP-Seq zapewnia profilowanie całego genomu celów DNA pod kątem modyfikacji histonów, czynników transkrypcyjnych i innych białek związanych z DNA.Łączy selektywność immunoprecypitacji chromatyny (ChIP) w celu odzyskania określonych kompleksów białko-DNA z mocą sekwencjonowania nowej generacji (NGS) do wysokoprzepustowego sekwencjonowania odzyskanego DNA.Dodatkowo, ponieważ kompleksy białko-DNA są odzyskiwane z żywych komórek, miejsca wiązania można porównywać w różnych typach komórek i tkankach lub w różnych warunkach.Zastosowania obejmują regulację transkrypcji, ścieżki rozwojowe, mechanizmy chorób i nie tylko.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekwencjonowanie wodorosiarczynu całego genomu
Metylacja DNA na piątej pozycji w cytozynie (5-mC) ma fundamentalny wpływ na ekspresję genów i aktywność komórkową.Nieprawidłowe wzorce metylacji są związane z kilkoma stanami i chorobami, takimi jak rak.WGBS stał się złotym standardem w badaniu metylacji całego genomu w rozdzielczości pojedynczej zasady.
Platforma: Illumina NovaSeq6000
-
Test chromatyny dostępnej dla transpozazy z sekwencjonowaniem o wysokiej przepustowości (ATAC-seq)
ATAC-seq to wysokowydajna metoda sekwencjonowania do analizy dostępności chromatyny w całym genomie, która jest ważna dla globalnej epigenetycznej kontroli ekspresji genów.Adaptery do sekwencjonowania są wstawiane w otwarte regiony chromatyny przez nadaktywną transpozazę Tn5.Po amplifikacji PCR konstruowana jest biblioteka do sekwencjonowania.Wszystkie otwarte regiony chromatyny można uzyskać w określonych warunkach czasoprzestrzennych, nie tylko ograniczonych do miejsc wiązania czynnika transkrypcyjnego lub określonego regionu zmodyfikowanego histonami.
-
Sekwencjonowanie wodorosiarczynów o zmniejszonej reprezentacji (RRBS)
Badania nad metylacją DNA zawsze były gorącym tematem w badaniach nad chorobami i są ściśle związane z ekspresją genów i cechami fenotypowymi.RRBS to dokładna, wydajna i ekonomiczna metoda badań metylacji DNA.Wzbogacenie regionów promotora i wysp CpG przez rozszczepienie enzymatyczne (Msp I), w połączeniu z sekwencjonowaniem wodorosiarczynem, zapewnia wykrywanie metylacji DNA o wysokiej rozdzielczości.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
