page_head_bg

Produkty

Sekwencjonowanie eukariotycznego mRNA – Illumina

Sekwencjonowanie mRNA umożliwia profilowanie wszystkich mRNA transkrypowanych z komórek w określonych warunkach.Jest to potężna technologia ujawniania profilu ekspresji genów, struktur genów i mechanizmów molekularnych niektórych procesów biologicznych.Do tej pory sekwencjonowanie mRNA było szeroko stosowane w badaniach podstawowych, diagnostyce klinicznej, opracowywaniu leków itp.

Platforma: Illumina NovaSeq 6000


Szczegóły usługi

Bioinformatyka

Wyniki demonstracyjne

Zalety

ØDuże doświadczenie: W BMK przetworzono ponad 200 000 próbek obejmujących różne typy próbek, w tym hodowle komórkowe, tkanki, płyny ustrojowe itp., a ponad 7000 projektów mRNA-Seq zamkniętych obejmujących różne obszary badawcze.

ØŚcisły system kontroli jakości: Główne punkty kontroli jakości na wszystkich etapach, w tym przygotowanie próbki, przygotowanie biblioteki, sekwencjonowanie i bioinformatyka, są ściśle monitorowane w celu zapewnienia wysokiej jakości wyników.

ØDostępnych jest wiele baz danych do analizowania adnotacji funkcji i wzbogacania w celu spełnienia różnych celów badawczych.

ØUsługi posprzedażowe: usługi posprzedażowe ważne przez 3 miesiące po zakończeniu projektu, w tym monitorowanie projektów, rozwiązywanie problemów, pytania i odpowiedzi dotyczące wyników itp.

Przykładowe wymagania i dostawa

Biblioteka Strategia sekwencjonowania Zalecane dane Kontrola jakości
Wzbogacony poli A Ilumina PE150

6 GB

Q30≥85%

Przykładowe wymagania:

Nukleotydy:

Czystość Integralność Ilość
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Ograniczone lub brak zanieczyszczenia białkiem lub DNA widoczne na żelu. Dla roślin: RIN≥6,5;Dla zwierząt: RIN≥7;28S/18S≥1,0;ograniczone lub brak wzrostu wyjściowego Stęż.≥30 ng/μl;Objętość ≥ 10 μl;Razem ≥ 1,5 μg

Tkanka: Waga (sucha):≥1 g
*W przypadku tkanki mniejszej niż 5 mg zalecamy przesłanie próbki tkanki zamrożonej (w ciekłym azocie).

Zawiesina komórek:Liczba komórek = 3×106- 1×107
*Zalecamy wysłanie mrożonego lizatu komórkowego.W przypadku, gdy liczba komórek jest mniejsza niż 5×105, zaleca się błyskawiczne zamrożenie w ciekłym azocie, co jest preferowane do mikroekstrakcji.

Próbki krwi:Objętość ≥1 ml

Mikroorganizm:Masa ≥ 1 g

Zalecana dostawa próbek

Pojemnik: probówka wirówkowa 2 ml (folia aluminiowa nie jest zalecana)

Etykietowanie próbek: Grupa+replikacja np. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Wysyłka:

  1. Suchy lód: Próbki należy zapakować w worki i zakopać w suchym lodzie.
  2. Probówki RNAstable: Próbki RNA można suszyć w probówkach do stabilizacji RNA (np. RNAstable®) i wysyłać w temperaturze pokojowej.

Przebieg prac serwisowych

logo_01

Projekt eksperymentu

logo_02

Przykładowa dostawa

logo_03

Ekstrakcja RNA

logo_04

Budowa biblioteki

logo_05

Sekwencjonowanie

logo_06

Analiza danych

logo_07

Usługi posprzedażowe


  • Poprzedni:
  • Następny:

  • Bioinformatyka

    2(1)

    Eukariotyczny Przepływ pracy analizy sekwencjonowania mRNA

    Bioinformatyka

    ØKontrola jakości surowych danych

    ØDopasowanie genomu referencyjnego

    ØAnaliza struktury transkrypcji

    ØKwantyfikacja ekspresji

    ØAnaliza ekspresji różnicowej

    ØAdnotacja i wzbogacenie funkcji

    1.Krzywa nasycenia danych mRNA

    3(1)

    2.Analiza różnicowa ekspresji – wykres wulkanu

    4(1)

    3.Adnotacja KEGG na DEG

    5(1)

    4.Klasyfikacja GO na DEG

    6(1)

    uzyskać wycenę

    Napisz tutaj swoją wiadomość i wyślij ją do nas

    Wyślij do nas wiadomość: