Eukaryotic mRNA sequencing-Illumina

Sekwencjonowanie eukariotycznego mRNA – Illumina

Sekwencjonowanie mRNA umożliwia profilowanie wszystkich mRNA transkrypowanych z komórek w określonych warunkach.Jest to potężna technologia ujawniania profilu ekspresji genów, struktur genów i mechanizmów molekularnych niektórych procesów biologicznych.Do tej pory sekwencjonowanie mRNA było szeroko stosowane w badaniach podstawowych, diagnostyce klinicznej, opracowywaniu leków itp.

Platforma: Illumina NovaSeq 6000

Skontaktuj się z nami

Szczegóły usługi

Bioinformatyka

Wyniki demonstracyjne

Zalety

ØDuże doświadczenie: W BMK przetworzono ponad 200 000 próbek obejmujących różne typy próbek, w tym hodowle komórkowe, tkanki, płyny ustrojowe itp., a ponad 7000 projektów mRNA-Seq zamkniętych obejmujących różne obszary badawcze.

ØŚcisły system kontroli jakości: Główne punkty kontroli jakości na wszystkich etapach, w tym przygotowanie próbki, przygotowanie biblioteki, sekwencjonowanie i bioinformatyka, są ściśle monitorowane w celu zapewnienia wysokiej jakości wyników.

ØDostępnych jest wiele baz danych do analizowania adnotacji funkcji i wzbogacania w celu spełnienia różnych celów badawczych.

ØUsługi posprzedażowe: usługi posprzedażowe ważne przez 3 miesiące po zakończeniu projektu, w tym monitorowanie projektów, rozwiązywanie problemów, pytania i odpowiedzi dotyczące wyników itp.

Przykładowe wymagania i dostawa

Biblioteka	Strategia sekwencjonowania	Zalecane dane	Kontrola jakości
Wzbogacony poli A	Ilumina PE150	6 GB	Q30≥85%

Przykładowe wymagania:

Nukleotydy:

Czystość	Integralność	Ilość
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Ograniczone lub brak zanieczyszczenia białkiem lub DNA widoczne na żelu.	Dla roślin: RIN≥6,5;Dla zwierząt: RIN≥7;28S/18S≥1,0;ograniczone lub brak wzrostu wyjściowego	Stęż.≥30 ng/μl;Objętość ≥ 10 μl;Razem ≥ 1,5 μg

Tkanka: Waga (sucha):≥1 g
*W przypadku tkanki mniejszej niż 5 mg zalecamy przesłanie próbki tkanki zamrożonej (w ciekłym azocie).

Zawiesina komórek:Liczba komórek = 3×10⁶- 1×10⁷
*Zalecamy wysłanie mrożonego lizatu komórkowego.W przypadku, gdy liczba komórek jest mniejsza niż 5×105, zaleca się błyskawiczne zamrożenie w ciekłym azocie, co jest preferowane do mikroekstrakcji.

Próbki krwi:Objętość ≥1 ml

Mikroorganizm:Masa ≥ 1 g

Zalecana dostawa próbek

Pojemnik: probówka wirówkowa 2 ml (folia aluminiowa nie jest zalecana)

Etykietowanie próbek: Grupa+replikacja np. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Wysyłka:

Suchy lód: Próbki należy zapakować w worki i zakopać w suchym lodzie.
Probówki RNAstable: Próbki RNA można suszyć w probówkach do stabilizacji RNA (np. RNAstable®) i wysyłać w temperaturze pokojowej.