Genetyka ewolucyjna

Badania genetyki ewolucyjnej mają na celu zrozumienie trajektorii ewolucyjnej populacji z wykorzystaniem informacji o polimorfizmach w sekwencjach genomowych. BMKCloud Evolutionary Genetics Pipeline został zaprojektowany do analizy danych WGS lub SLAF (Specific-Locus Amplified Fragment) z dużych populacji. Po kontroli jakości surowych danych, odczyty są porównywane z genomem referencyjnym, a warianty są wywoływane. Pipeline obejmuje konstrukcję drzewa filogenetycznego, analizę głównych składowych (PCA), analizę struktury populacji, analizę nierównowagi sprzężeń (LD), selektywną analizę przemiatania oraz analizę genów kandydujących.