Pacbio Pełnej długości transkryptom

Sekwencjonowanie transkryptomu pełnej długości (Isoseq) PacBio umożliwia dokładną identyfikację izoform transkryptów, rzucając światło na alternatywną poliadenylację i splicing oraz prowadząc do dokładniejszej analizy ekspresji genów. System BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome został zaprojektowany do analizy bibliotek cDNA sekwencjonowanych w trybie sekwencjonowania konsensusu kołowego (CCS) i identyfikacji sekwencji niechimerycznych pełnej długości (FLNC), które są następnie grupowane w nieredundantne transkrypty. Późniejsza analiza BUSCO ocenia kompletność montażu transkryptomu. Na podstawie złożonego transkryptomu przeprowadza się wiele analiz: alternatywny splicing, proste powtórzenia sekwencji (SSR), przewidywanie lncRNA i odpowiadających mu genów docelowych, przewidywanie nowych genów, analizę rodzin genów, analizę czynników transkrypcyjnych oraz funkcjonalną adnotację transkryptów.