د لوړ تروپټ ترتیب سره د ټرانسپوزاس-لاسرسي وړ کروماتین لپاره ارزونه (ATAC-seq)
د خدماتو ځانګړتیاوې
● د DNA-پروټین تعاملاتو د ساتنې لپاره، د استخراج شوي نیوکلیک اسیدونو پرځای، د نسجونو نمونو ته اړتیا ده.
● د ATAC میتود کې د نسجونو جلا کول، ورپسې د هستې جلا کول، د Tn5 درملنه او پاکول، د PCR پراخول، د اندازې انتخاب او ترتیب شامل دي.
● په ایلومینا نووا سیک کې ترتیب کول
د خدماتو ګټې
●لوړ حساسیت:د کتابتون د چمتووالي او ترتیب لپاره د پیل شوي حجرو ټیټ مقدار کافي دی.
●ډېر معلوماتي تخنیک: په ورته وخت کې د خلاص کروماتین جینومیک موقعیتونه او فعال تنظیمي عناصر لکه د ټرانسکرپشن فکتور پابند سایټونه څرګندوي.
●ښه تجربوي تکثیر وړتیا: تخنیکي نقلونه غوره تکرار وړتیا ښیې.
●پراخه تخصص: د ATAC د ترتیب کولو سلګونو پروژو په بریالیتوب سره بشپړیدو سره، BMKGENE د یوې لسیزې څخه ډیر تجربه، یو لوړ مهارت لرونکی تحلیلي ټیم، جامع مینځپانګه، او د پلور وروسته غوره ملاتړ راوړي.
●د ټرانسکرپټومکس تحلیل سره د یوځای کیدو امکان: د ATAC seq د نورو اومیک معلوماتو لکه RNA-seq سره د مدغم تحلیل لپاره اجازه ورکوي.
● جامع بایو انفارمیټک تحلیل: نه یوازې د کروماتین د خلاصو سیمو او د هغوی اړوند فعالیت (ترویج کونکي، UTs، exons، introns) پیژندلو ته اجازه ورکوي بلکه د نمونو ترمنځ د کروماتین خلاصو سیمو ترمنځ د توپیرونو تحلیل هم کوي.
د خدماتو مشخصات
| کتابتون | د ترتیب کولو ستراتیژي | د معلوماتو وړاندیز شوی محصول | د کیفیت کنټرول |
| د ATAC-seq | ایلومینا PE150 | > ۲۰ ملیونه لوستل شوي د جینوم اندازې پورې اړه لري (انسان: ۵۰ متره لوستل) | د Q30≥85٪ |
د نمونې اړتیاوې
د نمونو ډول: نسجونه، ژوندي یا کنګل شوي حجرات، وینه
● د حجرې شمېره: ≥ ۱۰6حجرې
● د نسج وزن: ≥ 200 ملی ګرامه تازه نسج
● وینه: ≥ ۴ ملی لیتره
د خدماتو کاري جریان
د تجربې ډیزاین
د نمونې تحویلي
د ډي این اې استخراج
د کتابتون جوړول
د ترتیب ترتیب
د معلوماتو تحلیل
د خرڅلاو وروسته خدمتونه
لاندې تحلیلونه شامل دي:
● د خامو معلوماتو د کیفیت کنټرول؛
● د حوالې جینوم ته د نقشې پر بنسټ د لوړ غږ پورته کول؛
● د جین تشریح د لوړوالي په موقعیت کې؛
● د شکل تحلیل: د نقل کولو فکتور د تړلو ځایونو پیژندنه (TFBS)؛
● د توپیري چوکۍ تحلیل او تشریح.
۱. په ATAC کې د تودوخې نقشه په TSS او نږدې سیمو کې ویش لوستل کیږي (±۳ kb)
۲. د جینوم په مختلفو برخو کې د خلاص کروماتین سیمې ویش
۳. د ډلو ترمنځ توپیر لرونکی لوړ غږ
د BMKGene د ATAC ترتیب خدماتو لخوا د خپرونو د یوې جوړې شوې ټولګې له لارې د څیړنې پرمختګونه وپلټئ.
فو، اې.او نور.(۲۰۲۳) 'د ترخې خټکي د ټیلومیر څخه تر ټیلومیر جینوم پورې راټولول (مومورډیکا چارانتیا ایل. var. abbreviata Ser.) د میوو پراختیا، جوړښت او د پخیدو جینیاتي ځانګړتیاوې څرګندوي'،د باغدارۍ څیړنه, 10 (1). doi: 10.1093/HR/UHAC228.
ګونګ، بي.او نور.(۲۰۲۳) 'په ګلیوما کې د آنکوجین په توګه د سیکریټري کایناز FAM20C ایپی جینیټیک او ټرانسکرپشنل فعالول'،د جینیات او جینومکس ژورنال50(6)، مخونه 422-433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
هغه، Y.او نور.(۲۰۲۳) 'بوټیریټ د کولوریکټل سرطان کې د فیروپټوسس مقاومت بیرته راګرځوي د c-Fos پورې تړلي xCT فشار هڅولو سره'،د ریډوکس بیولوژي، ۶۵، مخ ۱۰۲۸۲۲. doi: ۱۰.۱۰۱۶/J.REDOX.۲۰۲۳.۱۰۲۸۲۲.
