-
PacBio - د بشپړ اوږدوالی ټرانسکریټوم (بې حواله)
امپلیکون (16S/18S/ITS) پلیټ فارم د مایکروبیل تنوع پروژې تحلیل کې د کلونو تجربې سره رامینځته شوی ، کوم چې معیاري لومړني تحلیلونه او شخصي تحلیلونه لري: بنسټیز تحلیل د اوسني مایکروبیل څیړنې اصلي جریان تحلیل مینځپانګه پوښي ، د تحلیل مینځپانګه بډایه او پراخه ده ، او د تحلیل پایلې د پروژې راپورونو په بڼه وړاندې کیږي؛د شخصي تحلیل منځپانګه متنوع ده.نمونې غوره کیدی شي او پیرامیټونه د لومړني تحلیلي راپور او څیړنې هدف سره سم په انعطاف سره تنظیم کیدی شي ، ترڅو شخصي اړتیاوې درک کړي.د وینډوز عملیاتي سیسټم، ساده او چټک.
-
PacBio - د بشپړ اوږدوالی ټرانسکریټوم (بې حواله)
د پاسیفیک بایوسینس (PacBio) Isoform ترتیب کولو ډیټا د ان پټ په توګه اخیستل ، دا ایپ د دې وړتیا لري چې د بشپړ اوږدوالي لیږد ترتیبونه وپیژني (پرته له مجلس څخه).د حوالې جینوم په وړاندې د بشپړ اوږدوالي ترتیبونو نقشه کولو سره، لیږدونه د پیژندل شوي جینونو، ټرانسکریپټونو، کوډ کولو سیمو او نورو په واسطه اصلاح کیدی شي. پدې حالت کې، د mRNA جوړښتونو ډیر دقیق پیژندنه، لکه د بدیل جلا کول، او نور، ترلاسه کیدی شي.د NGS ټرانسکریپټوم ترتیب کولو ډیټا سره ګډ تحلیل د لیږد په کچه په بیان کې ډیر جامع تشریح او ډیر دقیق مقدار کول وړتیا ورکوي ، کوم چې په لویه کچه د لاندې جریان توپیر څرګندولو او فعال تحلیلونو څخه ګټه پورته کوي.
-
Toolkits
BMKCloud یو مخکښ بایو انفارماتیک پلیټ فارم دی چې د جینومیک برنامو لپاره یو تمځای حل چمتو کوي ، کوم چې په پراخه کچه د څیړونکو لخوا په بیلابیلو برخو کې د طبي ، کرنې ، چاپیریال او نورو په شمول د څیړونکو لخوا باور لري. د کمپیوټینګ سرچینې، عامه ډیټابیس، بایو انفارمیټیک آنلاین کورسونه، او داسې نور. BMKCloud ډیری وختونه کارول شوي بایو انفارماتیک وسیلې لري چې پکې د جین تشریح، تکامل جینیکیک اوزار، ncRNA، د معلوماتو کیفیت کنټرول، مجلس، ترتیب، د معلوماتو استخراج، تغیرات، احصایې، ارقام جنریټر، ترتیب تحلیل، او داسې نور
-
کوچنی RNA
کوچني RNAs د لنډ غیر کوډ کولو RNA ډول دي چې اوسط اوږدوالی یې 18-30 nt دی، پشمول miRNA، siRNA او piRNA.دا کوچني RNAs په پراخه کچه راپور شوي چې په مختلفو بیولوژیکي پروسو کې ښکیل دي لکه د mRNA تخریب، د ژباړې مخنیوی، د هیټروکروماتین جوړښت، او داسې نور. د کوچنیو RNA ترتیب تحلیل په پراخه توګه د څارویو/نباتاتو پراختیا، ناروغۍ، ویروس او نور په مطالعاتو کې کارول شوي. د ترتیب کولو تحلیل پلیټ فارم د معیاري تحلیلونو او پرمختللي ډیټا کان کیندنې څخه جوړ دی.د RNA-seq ډیټا په اساس، معیاري تحلیل کولی شي د miRNA پیژندنه او وړاندوینه، د miRNA هدف جین وړاندوینه، تشریح او بیان تحلیل ترلاسه کړي.پرمختللی تحلیل د دودیز miRNA لټون او استخراج ، د وین ډیاګرام نسل ، miRNA او هدف جین شبکې رامینځته کول وړوي.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS د بشپړ جینوم بیا ترتیب کولو تحلیل پلیټ فارم دی ، کوم چې د بایومارکر ټیکنالوژیو کې د بډایه تجربې پراساس رامینځته شوی.دا د کارولو اسانه پلیټ فارم په ساده ډول د یو څو لومړني پیرامیټرو تنظیم کولو سره د مدغم تحلیل کاري فلو ګړندي سپارلو ته اجازه ورکوي ، کوم چې د DNA ترتیب کولو ډیټا لپاره فټ کیږي چې دواړه د Illumina پلیټ فارم او BGI تسلسل پلیټ فارم څخه رامینځته شوي.دا پلیټ فارم د لوړ فعالیت کمپیوټري سرور کې ځای په ځای شوی ، کوم چې په خورا محدود وخت کې خورا مؤثره ډیټا تحلیل ځواکوي.شخصي شوي ډیټا کان کیندنه د معیاري تحلیل په اساس شتون لري ، پشمول د بدل شوي جین پوښتنې ، د PCR پریمر ډیزاین ، او داسې نور.
-
mRNA (حواله)
ټرانسکریټوم د جینومیک جنیټیک معلوماتو او د بیولوژیکي فعالیت پروټوم ترمنځ اړیکه ده.د انتقالي کچې مقررات د ژوندی موجوداتو ترټولو مهم او په پراخه کچه مطالعه شوي مقرراتو طریقه ده.د ټرانسکریپټوم ترتیب کول کولی شي ټرانسکریپټوم په هر وخت کې یا په هر حالت کې ترتیب کړي، د یو واحد نیوکلیوټایډ لپاره دقیق ریزولوشن سره. دا کولی شي په متحرک ډول د جین لیږد کچه منعکس کړي، په ورته وخت کې نادر او نورمال لیږدونه وپیژني او اندازه کړي، او ساختماني معلومات چمتو کړي. نمونه ځانګړي لیکنې.
په اوس وخت کې، د ټرانسکریټوم ترتیب کولو ټیکنالوژي په پراخه کچه د کرنې، طب او نورو څیړنو برخو کې کارول کیږي، پشمول د څارویو او نباتاتو د پراختیا مقررات، د چاپیریال موافقت، د معافیت تعامل، د جین ځایی کول، د ډولونو جینیکیک ارتقاء او د تومور او جینیاتی ناروغیو کشف.
-
Metagenomics (NGS)
د دې تحلیل پلیټ فارم د کلونو تجربو پراساس د شاټګن میټاجینومیک ډیټا تحلیل لپاره ډیزاین شوی.دا مربوط کاري فلو لري چې د عمومي اړتیا لرونکي مختلف میټاجینومیک تحلیلونه لري پشمول د ډیټا پروسس کول ، د نوعې کچې مطالعې ، د جین فنکشن کچې مطالعې ، میټاجینوم بائنینګ ، او داسې نور. سربیره پردې ، د ډیټا کان کیندنې دودیز اوزار د معیاري تحلیل کاري فلو کې شتون لري ، پشمول د جین او ډولونو پوښتنې. ، د پیرامیټر تنظیم کول ، شخصي شکل رامینځته کول ، او داسې نور.
-
LncRNA
اوږده غیر کوډ RNAs (lncRNA) یو ډول ټرانسکریپټ دی چې اوږدوالی یې له 200 nt څخه اوږد دی، کوم چې د پروټینونو کوډ کولو توان نلري.راټول شوي شواهد وړاندیز کوي چې ډیری lncRNAs ډیر احتمال لري چې فعال وي.د لوړې کچې ترتیب کولو ټیکنالوژۍ او د بایو انفارماتیک تحلیلي وسیلې موږ ته ځواک راکوي چې د lncRNA ترتیبونه او د موقعیت معلومات په خورا مؤثره توګه څرګند کړو او موږ ته لارښوونه کوي چې د مهمو تنظیمي دندو سره lncRNAs کشف کړو.BMKCloud ویاړي چې زموږ پیرودونکو ته د ګړندي ، معتبر او انعطاف وړ lncRNA تحلیل ترلاسه کولو لپاره د lncRNA تسلسل تحلیل پلیټ فارم چمتو کوي.
-
GWAS
د جینوم پراخه انجمن مطالعه (GWAS) موخه د جینیاتي ډولونو (جینوټایپ) پیژندل دي چې د ځانګړي ځانګړتیاو (فینوټایپ) سره تړاو لري.د GWA مطالعات د جنیټیک مارکرونو پلټنه کوي د لوی شمیر اشخاصو ټول جینوم څخه تیریږي او د نفوس په کچه د احصایوي تحلیلونو لخوا د جینټایپ - فینوټایپ اتحادیې وړاندوینه کوي.د بشپړ جینوم بیاکتنه کولی شي په بالقوه توګه ټول جینیاتي ډولونه کشف کړي.د فینوټائپیک ډیټا سره یوځای کول، GWAS د فینوټایپ اړوند SNPs، QTLs او کاندید جینونو پیژندلو لپاره پروسس کیدی شي، کوم چې د عصري څارویو/نباتاتو نسل پالنه په کلکه ملاتړ کوي.SLAF د ځان پرمختللې ساده جینوم ترتیب کولو ستراتیژي ده، کوم چې د جینوم په کچه ویشل شوي مارکرونه، SNP کشف کوي.دا SNPs، د مالیکول جینیکیک مارکر په توګه، د هدف شوي ځانګړتیاو سره د اتحادیې مطالعې لپاره پروسس کیدی شي.دا د جینیاتي تغیراتو سره تړلي پیچلي ځانګړتیاو په پیژندلو کې د لګښت مؤثره ستراتیژي ده.
-
نانوپور بشپړ اوږدوالی ټرانسکریټومکس
په ژوندی موجوداتو کې پیچلي او متغیر بدیل isoforms د جین بیان او د پروټین تنوع تنظیم کولو لپاره مهم جنیټیک میکانیزمونه دي.د ټرانسکریپټ جوړښتونو دقیق پیژندنه د جین بیان د تنظیم کولو نمونو د ژورې مطالعې اساس دی.د نانوپور ترتیب کولو پلیټ فارم په بریالیتوب سره د ټرانسکرټومیک مطالعه د isoform کچې ته راوړې.د دې تحلیل پلیټ فارم د RNA-Seq ډیټا تحلیل کولو لپاره ډیزاین شوی چې د نانوپور پلیټ فارم کې د حوالې جینوم اساس باندې رامینځته شوی ، کوم چې د جین کچه او د لیږد په کچه دواړه کیفیتي او کمیتي تحلیلونه ترلاسه کوي.
