لوی شوی سیګریګینټ تحلیل
د خدماتو ګټې
تاکاګي او نور، د نبات ژورنال، 2013
● دقیق ځایی کول: د شالید شور کمولو لپاره د 30+30 څخه تر 200+200 اشخاصو سره د ګولیو مخلوط کول؛غیر مترادف متوازین پر بنسټ د نوماندانو د سیمې وړاندوینه.
● هراړخیز تحلیل: د امیدوار جین فعالیت ژوره تشریح، په شمول NR، SwissProt، GO، KEGG، COG، KOG، او نور.
● د چټک بدلون وخت: په 45 کاري ورځو کې د جین چټک ځای کول.
● پراخه تجربه: BMK د زرګونو ځانګړتیاوو په ځایی کولو کې مرسته کړې، د مختلفو ډولونو لکه فصلونو، آبي محصولاتو، ځنګلونو، ګلانو، میوو او نورو پوښښ.
د خدماتو مشخصات
نفوس:
د مخالفو فینوټایپونو سره د والدینو نسل جلا کول.
د مثال په توګه F2 نسل، بیک کراسنګ (BC)، د بیا جوړونې انبریډ لاین (RIL)
د مخلوط کولو حوض
د کیفیت لرونکي ځانګړتیاو لپاره: له 30 څخه تر 50 پورې کسان (لږترلږه 20) / لوی
د کمیتي ټراټیس لپاره: له 5٪ څخه تر 10٪ لوړ اشخاص په ټول نفوس کې (لږترلږه 30+30).
د تسلسل ژوروالی وړاندیز شوی
لږ تر لږه 20X/مور او پلار او 1X/اولاد فرد (د مثال په توګه د 30+30 انفرادي د اولادونو د مخلوط کولو حوض لپاره، د ترتیب ژوروالی به په هر بلک کې 30X وي)
بایو انفارماتیک تحلیلونه
● د بشپړ جینوم بیاکتنه
● د معلوماتو پروسس کول
● SNP/Indel زنګ وهل
● د نوماندانو د سیمې سکرینینګ
● د کاندید جین فعالیت تشریح
د نمونې اړتیاوې او تحویلي
د نمونې اړتیاوې:
نیوکلیوټایډونه:
| د gDNA نمونه | د نسج نمونه |
| غلظت: ≥30 ng/μl | نباتات: 1-2 g |
| اندازه: ≥2 μg (حجم ≥15 μl) | حیوانات: 0.5-1 g |
| پاکوالی: OD260/280= 1.6-2.5 | ټوله وینه: 1.5 ملی لیتر |
د خدماتو کاري جریان
د تجربې ډیزاین
د سپارلو نمونه
د RNA استخراج
د کتابتون جوړول
ترتیب کول
د معلوماتو تحلیل
د پلور وروسته خدمتونه
1. د یوکلیډین فاصلې (ED) په اړه د اتحادیې تحلیل اساس ترڅو د کاندید ساحه وپیژني.په لاندې شکل کې
ایکس محور: د کروموزوم شمیره؛هر ټکی د SNP د ED ارزښت استازیتوب کوي.تور کرښه د نصب شوي ED ارزښت سره مطابقت لري.د ED لوړ ارزښت د سایټ او فینوټایپ ترمنځ خورا مهم تړاو څرګندوي.سور ډش لاین د پام وړ اتحادیې حد استازیتوب کوي.
2. د SNP-index پرته د اتحادیې تحلیل
ایکس محور: د کروموزوم شمیره؛هر ټکی د SNP-index ارزښت استازیتوب کوي.تور کرښه د فټ شوي SNP-index ارزښت لپاره ولاړ دی.هرڅومره چې ارزښت لوی وي ، ټولنه خورا مهمه ده.
د BMK قضیه
د لوی اغیز کمیتي خاصیت لوکوس Fnl7.1 په ککرو کې د میوو د غاړې اوږدوالي سره د ناوخته جنین جنینس پراخه پروټین کوډ کوي
خپور شوی: د نبات بایو ټیکنالوژۍ ژورنال، 2020
د ترتیب کولو تګلاره:
والدین (Jin5-508, YN): د 34 × او 20 × لپاره د بشپړ جینوم بیاکتنه.
د DNA حوض (50 اوږده غاړه او 50 لنډه غاړه): د 61 × او 52 × لپاره بیاکتنه
کلیدي پایلې
په دې څیړنه کې، د نفوس جلا کول (F2 او F2:3) د اوږدې غاړې د ککرو کرښې Jin5-508 او لنډ غاړې YN څخه تیریدلو سره رامینځته شوي.د DNA دوه حوضونه د 50 خورا اوږده غاړه او 50 خورا لنډ غاړې اشخاصو لخوا جوړ شوي.لوی اغیز QTL په Chr07 کې د BSA تحلیل او دودیز QTL نقشه کولو لخوا پیژندل شوی.د امیدوارۍ ساحه د ښه نقشه کولو، د جین څرګندولو اندازه کولو او ټرانسجینک تجربو لخوا نوره هم محدوده شوې وه، کوم چې د غاړې اوږدوالی، CsFnl7.1 کنټرول کې کلیدي جین څرګند کړ.برسېره پردې، د CsFnl7.1 پروموټر سیمه کې پولیمورفیزم د ورته بیان سره تړلی وموندل شو.نور phylogenetic تحلیل وړاندیز وکړ چې Fnl7.1 لوکس ډیر احتمال لري چې له هند څخه سرچینه واخلي.
 د BSA تحلیل کې د QTL نقشه کول ترڅو د امیدوارۍ سیمه وپیژني چې د ککمبر د غاړې اوږدوالي سره تړاو لري |  د LOD پروفایلونه د ککمبر د غاړې اوږدوالی QTL په Chr07 کې پیژندل شوي |
Xu, X, et al."لوی اغیزې کمیتي خاصیت لوکوس Fnl7.1 په ککرو کې د میوو د غاړې اوږدوالي سره تړلی د ناوخته جنین جنینس پراخه پروټین کوډ کوي."د نبات بایو ټیکنالوژۍ ژورنال 18.7 (2020).
