条形بینر-03

محصولات

پرتلیزه جینومکس

پرتلیزه جینومیکونه د مختلفو ډولونو ترمنځ د ټولو جینوم ترتیبونو او جوړښتونو معاینه او پرتله کول شامل دي. دا ساحه هڅه کوي چې د ډولونو ارتقاء افشا کړي، د جین فعالیتونه ډیکوډ کړي، او د مختلفو ژوندیو موجوداتو په اوږدو کې د ساتل شوي یا متنوع ترتیب جوړښتونو او عناصرو په پیژندلو سره د جینیاتي تنظیمي میکانیزمونو روښانه کړي. د پرتلیزې جینومیکونو یوه جامع مطالعه تحلیلونه لکه د جین کورنۍ، ارتقايي پراختیا، د ټول جینوم تکرار پیښې، او د انتخابي فشارونو اغیزې شاملې دي.


د خدماتو توضیحات

د ډیمو پایلې

د قضیې مطالعه

د خدماتو ګټې

۱ پرتلیزه جینومکس

پراخه تخصص او د خپرولو ریکارډونه: د راټولو شویو سره، BMKGene له 90 څخه ډیر د پرتلې جینومیک پروژې بشپړې کړې، چې د مجموعي اغیزې فکتور یې 900 ته رسیدلی.

د بایو انفارمیټکس جامع تحلیل: د تحلیلونو کڅوړه اته خورا عام اړین تحلیلونه لري، چې ښه ډیزاین شوي او د خپرولو لپاره چمتو ارقام چمتو کوي او د پایلو اسانه تفسیر ته اجازه ورکوي.

د بایو انفارمیټکس خورا ماهر ټیم او لنډ تحلیلي دوره: د پرتلیزې جینومیک تحلیل کې د عالي تجربې سره، د BMKGene ټیم په لنډ وخت کې د مختلفو شخصي تحلیل غوښتنې پوره کوي.

د خرڅلاو وروسته ملاتړ:زموږ ژمنه د پروژې له بشپړېدو هاخوا د خرڅلاو وروسته د درې میاشتو خدمت دورې سره غځېږي. پدې موده کې، موږ د پروژې تعقیب، د ستونزو حل کولو مرستې، او د پایلو پورې اړوند هرې پوښتنې ته د ځواب ویلو لپاره د پوښتنو او ځوابونو غونډې وړاندې کوو.

د خدماتو مشخصات

د ګرځېدو اټکل شوی وخت

د ډولونو شمېر

تحلیلونه

۳۰ کاري ورځې

۶ - ۱۲

د جین کورنۍ ډله ییزه کول

د جین کورنۍ پراختیا او انقباض

د ونې د فایلوجینټیک جوړښت

د انحراف وخت اټکل (د فوسیل کیلیبریشن اړین دی)

د LTR داخلولو وخت (د نباتاتو لپاره)

د بشپړ جینوم تکرار (د نباتاتو لپاره)

انتخابي فشار

د ترکیب تحلیل

د بایو انفارمیټکس تحلیلونه

● د جین کورنۍ

● فیلوجنیټکس

● د انحراف وخت

● انتخابي فشار

● د سنټیني تحلیل

流程图 مقایسوي جینومکس

د نمونې اړتیاوې او تحویلي

د نمونې اړتیاوې:

د جینوم ترتیب او راټولولو لپاره نسج یا DNA

د نسج لپاره

ډولونه

نسج

سروې

د پیک بایو سي سي ایس

څاروی

د بدن نسج

۰.۵ ~ ۱ ګرامه

≥ ۳.۵ ګرامه

د عضلاتو نسج

≥ ۵.۰ ګرامه

≥ ۵.۰ ملی لیتره

د تی لرونکو وینه

≥ 0.5 ملی لیتره

د چرګانو/د کب وینه

نبات

تازه پاڼه

۱ ~ ۲ ګرامه

≥ ۵.۰ ګرامه

 

ګلدان / ډډ

۱ ~ ۲ ګرامه

≥ ۱۰.۰ ګرامه

 

ریښه/ تخم

۱ ~ ۲ ګرامه

≥ ۲۰.۰ ګرامه

حجرې

کلتوري حجره

-

≥ ۱ x ۱۰8

د معلوماتو د

د نږدې اړونده ډولونو د جینوم ترتیب فایلونه (.fasta) او د تشریح فایلونه (.gff3)

د خدماتو کاري جریان

نمونه QC

د تجربې ډیزاین

د نمونې سپارل

د نمونې تحویلي

د کتابتون چمتووالی

د کتابتون جوړول

د ترتیب ترتیب

د ترتیب ترتیب

د معلوماتو تحلیل

د معلوماتو تحلیل

د خرڅلاو وروسته خدمتونه

د خرڅلاو وروسته خدمتونه


  • مخکینی:
  • بل:

  • *دلته ښودل شوي ډیمو پایلې ټول د بایومارکر ټیکنالوژیو لخوا خپاره شوي جینومونو څخه دي.

    ۱. د LTR داخلولو وخت اټکل: دا شمېره د نورو ډولونو په پرتله د وینینګ رای جینوم کې د LTR-RTs داخلولو وختونو کې یو ځانګړی بایموډل ویش ښیې. ترټولو وروستۍ څوکه شاوخوا ۰.۵ ملیون کاله دمخه راڅرګنده شوه.

    په وینینګ رای کې د 3LTR د داخلولو وخت اټکل

    لي ګوانګ او نور،د طبیعت جینیات، ۲۰۲۱

     

     

    ۲. د چایوټ (سیچیم ایډول) په اړه د فایلوجیني او جین کورنۍ تحلیل: د چایوټ او د جین کورنۍ کې د نورو ۱۳ اړوندو ډولونو تحلیل کولو سره، چایوټ د مار کدو (ټریکوسانتیس انګوینا) سره خورا نږدې تړاو وموندل شو. چایوټ د شاوخوا ۲۷-۴۵ میا په اوږدو کې د مار کدو څخه اخیستل شوی او د جینوم بشپړ نقل (WGD) په ۲۵±۴ میا کې په چایوټ کې لیدل شوی، کوم چې په کوکویبیټاسی کې دریم WGD پیښه ده.

    ۴ د چایوټ فایلوجینټیک ونې

    فو ا او نور،د باغدارۍ څیړنه، ۲۰۲۱

     

     

    ۳. د سینټیني تحلیل: د میوو په وده کې د فایټو هورمونونو پورې اړوند ځینې جینونه په چایوټ، مار کدو او کدو کې وموندل شول. د چایوټ او اسکواش ترمنځ اړیکه د چایوټ او مار کدو ترمنځ په پرتله یو څه لوړه ده.

    ۴ د چایوټ فایلوجینټیک ونې

    فو ا او نور،د باغدارۍ څیړنه، ۲۰۲۱

     

     

    ۴. د جین کورنۍ تحلیل: د G.thurberi او G.davidsonii جینومونو کې د جین کورنۍ پراختیا او انقباض په اړه د KEGG بډاینه ښودلې چې د سټرایډ بایوسینتیسس او براسینوسټرایډ بایوسینتیسس پورې اړوند جینونه پراخ شوي.

    ۴ د چایوټ فایلوجینټیک ونې

    یانګ زی او نور،د BMC بیولوژي، ۲۰۲۱

     

     

    ۵. د بشپړ جینوم تکرار تحلیل: د 4DTV او Ks ویش تحلیل د بشپړ جینوم تکرار پیښې ښودلې. د انټراسپیسیز لوړو څوکو د نقل پیښې ښودلې. د انټراسپیسیز لوړو څوکو د تخصص پیښې ښودلې. تحلیل ښودلې چې د نورو دریو نږدې اړوند ډولونو سره پرتله کول، O. europaea په دې وروستیو کې د لوی پیمانه جین تکرار څخه تیر شو.

    ۴ د چایوټ فایلوجینټیک ونې

    راو جي او نور،د باغدارۍ څیړنه، ۲۰۲۱

    د BMK قضیه

    ګلاب پرته له کاڼۍ: جینومیک بصیرتونه د رطوبت تطابق سره تړاو لري

    خپور شوی: د ملي ساینس بیاکتنه، ۲۰۲۱

    د ترتیب کولو ستراتیژي:

    د باسیبې اغزي' (ر.ویچورینان) جینوم:
    تقریبا ۹۳ ایکس پیک بایو + تقریبا ۹۰ ایکس نانوپور + ۲۶۷ ایکس ایلومینا

    مهمې پایلې

    ۱. د لوړ کیفیت R.wichuraiana جینوم د اوږدمهاله لوستلو ترتیب تخنیکونو په کارولو سره جوړ شوی و، کوم چې د 530.07 Mb اسمبلۍ تولیدوي (د اټکل شوي جینوم اندازه د جریان سایټومیټري لخوا نږدې 525.9 Mb او د جینوم سروې لخوا 525.5 وه؛ هیټروزایګوسیت شاوخوا 1.03٪ وه). د BUSCO اټکل شوی نمره 93.9٪ وه. د "زوړ بلش" (haploOB) سره پرتله کولو سره، د دې جینوم کیفیت او بشپړتیا د اساس واحد اساس دقت او LTR اسمبلۍ شاخص (LAI=20.03) لخوا تایید شوې. د R.wichuraiana جینوم 32,674 پروټین کوډینګ جینونه لري.

    ۲. د څو اومیکونو ګډ تحلیل، چې د پرتله کولو جینومیکونو، ټرانسکرپټومیکونو، د جینیاتي نفوس د QTL تحلیل څخه جوړ دی، د R. wichuraiana او Rosa chinensis ترمنځ مهم ځانګړتیا څرګنده کړه. همدارنګه، په QTL کې د اړوندو جینونو د څرګندولو توپیر احتمال درلود چې د ډډ د پریکل نمونې سره تړاو ولري.

    ۷ د جین کورنۍ پراختیا او انقباض په اړه د KEGG غني کول

    د باسی د تورنلیس او روزا چینینسس ترمنځ د جینومیک مقایسوي تحلیل چې پکې د سنټیني تحلیل، د جین کورنۍ کلستر، پراختیا او انقباض تحلیل شامل دي، لوی شمیر توپیرونه څرګند کړل، کوم چې د ګلابونو کې د مهمو ځانګړتیاو سره تړاو لري. په NAC او FAR1/FRS جین کورنۍ کې ځانګړی پراختیا ډیر احتمال درلود چې د تور داغ په وړاندې مقاومت سره تړاو ولري.

    ۸۱ د BT او OB ترمنځ د جینومکس مقایسوي تحلیلونه ۸۲ د BT او OB ترمنځ د جینومکس مقایسوي تحلیلونه ۸۳ د BT او OB ترمنځ د جینومکس مقایسوي تحلیلونه

    د BT او haploOB جینومونو ترمنځ د جینومیک مقایسوي تحلیل.

    حواله

    ژونګ، ایم.، او نور. "د ګلاب پرته له کاڼو: جینومیک بصیرتونه د رطوبت تطابق سره تړاو لري"د ملي ساینس بیاکتنه، ۲۰۲۱؛، nwab092.

    نرخ ترلاسه کړئ

    خپل پیغام دلته ولیکئ او موږ ته یې واستوئ

    خپل پیغام موږ ته واستوئ: