د PacBio 2+3 بشپړ اوږدوالی mRNA حل
ځانګړتیاوې
● د مطالعې ډیزاین:
د ټرانسکرپټ ایزوفارمونو پیژندلو لپاره د پیک بایو سره یوځای شوی نمونه ترتیب شوې
جلا نمونې (نقلونه او شرایط چې باید ازموینه شي) په ترتیب سرهNGS د ټرانسکرپټ اظهار اندازه کولو لپاره
● د CCS حالت کې د PacBio ترتیب، د HiFi لوستلو تولیدول
● د بشپړو متنونو ترتیب
● تحلیل د حوالې جینوم ته اړتیا نلري؛ په هرصورت، دا ممکن وکارول شي
● بایو انفارمیټیک تحلیل نه یوازې د جین او ایزوفارم په کچه څرګندونه کوي بلکه د lncRNA، جین فیوژن، پولی اډینیلیشن، او جین جوړښت تحلیل هم پکې شامل دی.
ګټې
● لوړ دقت: های فای د 99.9٪ (Q30) څخه ډیر دقت سره لوستل کیږي، د NGS سره پرتله کیدونکی
● د بدیل جلا کولو تحلیل: د ټولو نقلونو ترتیب کول د ایزوفارم پیژندنه او ځانګړتیا ته اجازه ورکوي.
● د PacBio او NGS قوتونو ترکیب: دا د ایزوفارم په کچه د اظهار اندازه کول فعالوي، هغه بدلون رابرسیره کوي چې ممکن د ټول جین اظهار تحلیل کولو پر مهال پټ وي.
● پراخه تخصص: موږ له ۲۳۰۰ څخه ډیر نمونې پروسس کړې دي، زموږ ټیم هرې پروژې ته د تجربې شتمني راوړي.
● د خرڅلاو وروسته ملاتړ: زموږ ژمنه د پروژې له بشپړېدو هاخوا د پلور وروسته د 3 میاشتو خدمت دورې سره غځیږي. پدې موده کې، موږ د پروژې تعقیب، د ستونزو حل کولو مرستې، او د پایلو پورې اړوند هرې پوښتنې ته د ځواب ویلو لپاره د پوښتنې او ځواب غونډو وړاندیز کوو.
د نمونې اړتیاوې او تحویلي
| کتابتون | د ترتیب کولو ستراتیژي | سپارښتنه شوې معلومات | د کیفیت کنټرول |
| د PolyA غني شوی mRNA CCS کتابتون | د پیک بایو دوهمه لړۍ د پیک بایو ریویو | ۲۰/۴۰ جي بي ۵/۱۰ متره سي سي ایس | د Q30≥85٪ |
| پولی A غني شوی | ایلومینا PE150 | ۶-۱۰ جي بي | د Q30≥85٪ |
نیوکلیوټایډونه
|
| مجموعه (ng/μl) | اندازه (μg) | پاکوالی | صداقت |
| د ایلومینا کتابتون | ≥ ۱۰ | ≥ ۰.۲ | د OD260/280=1.7-2.5 معرفي کول د OD260/230=0.5-2.5 معرفي کول په جیل کې محدود یا هیڅ پروټین یا DNA ککړتیا نه ښودل شوې. | د نباتاتو لپاره: RIN≥4.0; د څارویو لپاره: RIN≥4.5; ۵.۰≥۲۸ث/۱۸ث≥۱.۰; محدود یا هیڅ بنسټیز لوړوالی نلري |
| د پیک بایو کتابتون | ≥ ۱۰۰ | ≥ ۱.۰ | د OD260/280=1.7-2.5 معرفي کول د OD260/230=0.5-2.5 معرفي کول په جیل کې محدود یا هیڅ پروټین یا DNA ککړتیا نه ښودل شوې. | نباتات: RIN≥7.5 څاروي: RIN≥8.0 ۵.۰≥۲۸ث/۱۸ث≥۱.۰; محدود یا هیڅ بنسټیز لوړوالی نلري |
د نمونې سپارلو سپارښتنه
کانټینر: ۲ ملی لیتره سنټرفیوج ټیوب (ټین ورق سپارښتنه نه کیږي)
د نمونې لیبل کول: ګروپ + نقل د مثال په توګه A1، A2، A3؛ B1، B2، B3.
بار وړل:
۱. وچه یخ:نمونې باید په کڅوړو کې بسته شي او په وچ یخ کې ښخ شي.
۲. د RNAstable ټیوبونه: د RNA نمونې د RNAstable® په ټیوب کې وچې کیدی شي او د خونې په تودوخه کې لیږدول کیدی شي.
لاندې تحلیلونه پکې شامل دي:
- خام معلومات
- د کیفیت کنټرول
- د پولیډینیلیشن بدیل تحلیل (APA)
- د فیوژن ټرانسکرپټ تحلیل
- د بدیل سپلیسینګ تحلیل
- د یونیورسل واحد کاپي ارتولوګز (BUSCO) تحلیل بنچمارکینګ
- د ناول د نقل تحلیل: د کوډ کولو ترتیبونو (CDS) وړاندوینه او د فعالیت تشریح
- د lncRNA تحلیل: د lncRNA او اهدافو وړاندوینه
- د مایکرو سپوږمکۍ پیژندنه (SSR)
- په توپیري ډول څرګند شوي نقلونه (DETs) تحلیل
- په توپیري ډول څرګند شوي جینونه (DEGs) تحلیل
- د DEGs او DETs فعال تشریح
د بسکو تحلیل
د بدیل سپلیسینګ تحلیل
د پولیډینیلیشن بدیل تحلیل (APA)
په توپیري ډول څرګند شوي جینونه (DEGs) او نقلونه (DETs9 تحلیل)
د DETs او DEGs د پروټین-پروټین تعامل شبکې
د BMKGene د PacBio 2+3 بشپړ اوږدوالی mRNA ترتیب له لارې د خپرونو د یوې جوړې شوې ټولګې له لارې هغه پرمختګونه وپلټئ.
چاو، کیو او نور (۲۰۱۹) 'د پاپولس سټم ټرانسکرپټوم پرمختیایي متحرکات'،د نباتاتو د بایو ټیکنالوژۍ ژورنال، ۱۷(۱)، مخونه ۲۰۶–۲۱۹. doi: ۱۰.۱۱۱۱/PBI.۱۲۹۵۸.
ډینګ، ایچ. او نور (۲۰۲۲) 'د ایکټینیدیا لیټیفولیا (د اسکوربیټ بډایه میوو فصل) د میوو د ودې او پخیدو پرمهال د اسکوربیک اسید په مینځپانګه کې متحرک بدلونونه او اړوند مالیکولي میکانیزمونه'،د مالیکولي علومو نړیوال ژورنال، ۲۳ (۱۰) مخ. 5808. doi: 10.3390/IJMS23105808/S1.
هو، ایکس او نور (۲۰۲۲) 'د پاریس پولیفیلا کې د بایو فعال پولیفیلینونو کې د ښکیلو بایوسینتیټیک لارې جینونو مؤثره وړاندوینه'،د مخابراتو بیولوژي۲۰۲۲ ۵:۱، ۵(۱)، مخونه ۱–۱۰. doi: ۱۰.۱۰۳۸/s۴۲۰۰۳-۰۲۲-۰۳۰۰۰-z.
لیو، ایم. او نور (۲۰۲۳) 'د ټوټا ابسولوټ (میریک) ټرانسکرپټوم او سایټوکروم P450 جینونو ګډ پیک بایو اسو-سیک او ایلومینا آر این اے-سیک تحلیل'،حشرات، ۱۴(۴)، مخ ۳۶۳. doi: ۱۰.۳۳۹۰/INSECTS۱۴۰۴۰۳۶۳/S۱.
وانګ، لیجون او نور (۲۰۱۹) 'د ریکینوس کمیونیس کې د ریکینولیک اسید بایوسینتیسس د ښه پوهیدو لپاره د ایلومینا RNA ترتیب سره یوځای د پیک بایو واحد مالیکول ریښتیني وخت تحلیل په کارولو سره د ټرانسکرپټوم پیچلتیا سروې'،د بي ايم سي جينومکس، 20(1)، مخونه 1–17. doi: 10.1186/S12864-019-5832-9/FIGURES/7.
