-
PacBio - بشپړ اوږدوالی 16S/18S/ITS امپلیکون ترتیب کول
امپلیکون (16S/18S/ITS) پلیټ فارم د مایکروبیل تنوع پروژې تحلیل کې د کلونو تجربې سره رامینځته شوی ، کوم چې معیاري لومړني تحلیلونه او شخصي تحلیلونه لري: بنسټیز تحلیل د اوسني مایکروبیل څیړنې اصلي جریان تحلیل مینځپانګه پوښي ، د تحلیل مینځپانګه بډایه او پراخه ده ، او د تحلیل پایلې د پروژې راپورونو په بڼه وړاندې کیږي؛ د شخصي تحلیل محتويات متنوع دي. نمونې غوره کیدی شي او پیرامیټونه د لومړني تحلیلي راپور او څیړنې هدف سره سم په انعطاف سره تنظیم کیدی شي ، ترڅو د شخصي اړتیاو احساس وکړي. د وینډوز عملیاتي سیسټم، ساده او چټک.
-
PacBio - د بشپړ اوږدوالی ټرانسکریټوم (بې حواله)
د پاسیفیک بایوسینس (PacBio) Isoform تسلسل ډیټا د ان پټ په توګه اخیستل ، دا ایپ د دې وړتیا لري چې د بشپړ اوږدوالي لیږد ترتیبونه وپیژني (پرته له مجلس څخه). د حوالې جینوم په وړاندې د بشپړ اوږدوالي ترتیبونو نقشه کولو سره، لیږدونه د پیژندل شوي جینونو، ټرانسکریپټونو، کوډ کولو سیمو او نورو په واسطه اصلاح کیدی شي. پدې حالت کې، د mRNA جوړښتونو ډیر درست پیژندنه، لکه د بدیل جلا کول، او نور، ترلاسه کیدی شي. د NGS ټرانسکریپټوم ترتیب کولو ډیټا سره ګډ تحلیل د لیږد په کچه په بیان کې ډیر جامع تشریح او ډیر دقیق مقدار وړتیا وړ کوي ، کوم چې په لویه کچه د لاندې جریان توپیر څرګندولو او فعال تحلیلونو څخه ګټه پورته کوي.
-
Toolkits
BMKCloud یو مخکښ بایو انفارماتیک پلیټ فارم دی چې د جینومیک برنامو لپاره یو تمځای حل چمتو کوي ، کوم چې په پراخه کچه د څیړونکو لخوا په بیلابیلو برخو کې د طبي ، کرنې ، چاپیریال او نورو په شمول د څیړونکو لخوا باور لري. د کمپیوټري سرچینې، عامه ډیټابیس، بایو انفارمیټیک آنلاین کورسونه، او داسې نور. BMKCloud مختلف لري په مکرر ډول کارول شوي بایو انفارماتیک وسیلې چې پکې د جین تشریح ، تکامل جنیټیک اوزار ، ncRNA ، د معلوماتو کیفیت کنټرول ، مجلس ، ترتیب ، د معلوماتو استخراج ، تغیرات ، احصایې ، د ارقامو جنریټر ، د ترتیب تحلیل او داسې نور.
-
کوچنی RNA
کوچني RNAs د لنډ غیر کوډ کولو RNA ډول دي چې اوسط اوږدوالی یې 18-30 nt دی، په شمول miRNA، siRNA او piRNA. دا کوچني RNAs په پراخه کچه راپور شوي چې په مختلفو بیولوژیکي پروسو کې ښکیل دي لکه د mRNA تخریب، د ژباړې مخنیوی، د هیټروکروماتین جوړښت، او داسې نور. د کوچني RNA ترتیب تحلیل په پراخه توګه د څارویو/نباتاتو پراختیا، ناروغۍ، ویروس او نور په مطالعاتو کې کارول شوي. د ترتیب کولو تحلیل پلیټ فارم د معیاري تحلیلونو او پرمختللي ډیټا کان کیندنې څخه جوړ دی. د RNA-seq معلوماتو په اساس، معیاري تحلیل کولی شي د miRNA پیژندنه او وړاندوینه، د miRNA هدف جین وړاندوینه، تشریح او بیان تحلیل ترلاسه کړي. پرمختللی تحلیل د دودیز miRNA لټون او استخراج ، د وین ډیاګرام نسل ، miRNA او هدف جین شبکې رامینځته کول وړوي.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS د بشپړ جینوم بیا ترتیب کولو تحلیل پلیټ فارم دی ، کوم چې د بایومارکر ټیکنالوژیو کې د بډایه تجربې پراساس رامینځته شوی. دا د کارولو اسانه پلیټ فارم په ساده ډول د یو څو لومړني پیرامیټرو په ترتیب کولو سره د مدغم تحلیل کاري فلو ګړندي سپارلو ته اجازه ورکوي ، کوم چې د Illumina پلیټ فارم او BGI تسلسل پلیټ فارم څخه رامینځته شوي د DNA ترتیب کولو ډیټا لپاره فټ کیږي. دا پلیټ فارم د لوړ فعالیت کمپیوټري سرور کې ځای په ځای شوی ، کوم چې په خورا محدود وخت کې خورا مؤثره ډیټا تحلیل ځواکوي. شخصي شوي ډیټا کان کیندنه د معیاري تحلیل په اساس شتون لري ، پشمول د بدل شوي جین پوښتنې ، د PCR پریمر ډیزاین ، او داسې نور.
-
mRNA (حواله)
ټرانسکریټوم د جینومیک جنیټیک معلوماتو او د بیولوژیکي فعالیت پروټوم ترمنځ اړیکه ده. د انتقالي کچې مقررات د ژوندی موجوداتو ترټولو مهم او په پراخه کچه مطالعه شوي مقرراتو طریقه ده. د ټرانسکریپټوم ترتیب کول کولی شي ټرانسکریپټوم په هر وخت کې یا په هر حالت کې ترتیب کړي، د یو واحد نیوکلیوټایډ لپاره دقیق ریزولوشن سره. دا کولی شي په متحرک ډول د جین لیږد کچه منعکس کړي، په ورته وخت کې نادر او نورمال لیږدونه وپیژني او اندازه کړي، او ساختماني معلومات چمتو کړي. نمونې ځانګړي لیکنې.
په اوس وخت کې، د ټرانسکریپټوم ترتیب کولو ټیکنالوژي په پراخه کچه د زراعت، طب او نورو څیړنو برخو کې کارول کیږي، پشمول د څارویو او نباتاتو پراختیا مقررات، د چاپیریال موافقت، د معافیت تعامل، د جین ځایی کول، د ډولونو جینیکیک ارتقاء او تومور او د جینیاتي ناروغیو کشف.
-
Metagenomics (NGS)
دا تحلیل پلیټ فارم د کلونو تجربو پراساس د شاټګن میټاجینومیک ډیټا تحلیل لپاره ډیزاین شوی. دا مربوط کاري فلو لري چې د عمومي اړتیا لرونکي مختلف میټاجینومیک تحلیلونه لري پشمول د ډیټا پروسس کول ، د نوعې کچې مطالعې ، د جین فعالیت کچې مطالعې ، میټاجینوم بائنینګ ، او داسې نور. سربیره پردې ، د ډیټا کان کیندنې دودیز اوزار د معیاري تحلیل کاري فلو کې شتون لري ، پشمول د جین او ډولونو پوښتنې. , د پیرامیټر ترتیب، شخصي شخصیت تولید، او داسې نور.
-
LncRNA
اوږده غیر کوډ RNAs (lncRNA) یو ډول ټرانسکریپټ دی چې اوږدوالی یې له 200 nt څخه اوږد دی، کوم چې د پروټینونو کوډ کولو توان نلري. راټول شوي شواهد وړاندیز کوي چې ډیری lncRNAs ډیر احتمال لري چې فعال وي. د لوړې کچې ترتیب کولو ټیکنالوژي او د بایو انفارماتیک تحلیلي وسیلې موږ ته ځواک راکوي چې د lncRNA ترتیبونه او د موقعیت معلومات په ډیر مؤثره توګه څرګند کړو او موږ ته لارښوونه کوي چې د مهمو تنظیمي دندو سره lncRNAs کشف کړو. BMKCloud ویاړي چې زموږ پیرودونکو ته د ګړندي ، باوري او انعطاف وړ lncRNA تحلیل ترلاسه کولو لپاره د lncRNA تسلسل تحلیل پلیټ فارم چمتو کوي.
-
GWAS
د جینوم پراخه انجمن مطالعه (GWAS) موخه د جینیاتي ډولونو (جینوټایپ) پیژندل دي چې د ځانګړي ځانګړتیاو (فینوټایپ) سره تړاو لري. د GWA مطالعات د جنیټیک مارکرونو پلټنه کوي چې د لوی شمیر اشخاصو ټول جینوم څخه تیریږي او د نفوس په کچه د احصایوي تحلیلونو له لارې د جینټایپ-فینوټایپ اتحادیې وړاندوینه کوي. د بشپړ جینوم بیاکتنه کولی شي په بالقوه توګه ټول جینیاتي ډولونه کشف کړي. د فینوټائپیک ډیټا سره یوځای کول، GWAS د فینوټایپ اړوند SNPs، QTLs او کاندید جینونو پیژندلو لپاره پروسس کیدی شي، کوم چې د عصري څارویو/نباتاتو نسل پالنه په کلکه ملاتړ کوي. SLAF پخپله پرمختللې ساده جینوم ترتیب کولو ستراتیژي ده، کوم چې د جینوم په کچه ویشل شوي مارکرونه، SNP کشف کوي. دا SNPs، د مالیکول جینیکیک مارکر په توګه، د هدف شوي ځانګړتیاو سره د اتحادیې مطالعې لپاره پروسس کیدی شي. دا د جینیاتي تغیراتو سره تړلي پیچلي ځانګړتیاو په پیژندلو کې د لګښت مؤثره ستراتیژي ده.
-
نانوپور بشپړ اوږدوالی ټرانسکریټومکس
په ژوندی موجوداتو کې پیچلي او متغیر بدیل isoforms د جین بیان او د پروټین تنوع تنظیم کولو لپاره مهم جنیټیک میکانیزمونه دي. د ټرانسکریپټ جوړښتونو دقیق پیژندنه د جین بیان د تنظیم کولو نمونو د ژورې مطالعې اساس دی. د نانوپور ترتیب کولو پلیټ فارم په بریالیتوب سره د ټرانسکریټومیک مطالعه د isoform کچې ته راوړې. د دې تحلیل پلیټ فارم د RNA-Seq ډیټا تحلیل کولو لپاره ډیزاین شوی چې د نانوپور پلیټ فارم کې د حوالې جینوم اساس باندې رامینځته شوی ، کوم چې د جین کچه او د لیږد په کچه دواړه کیفیتي او کمیتي تحلیلونه ترلاسه کوي.
-
circ-RNA
سرکلر RNA(circRNA) د غیر کوډ کولو RNA یو ډول دی چې په دې وروستیو کې موندل شوي چې په تنظیمي شبکو کې مهم رول لوبوي چې په وده کې ښکیل دي، د چاپیریال مقاومت، او نور. د خطي RNA مالیکولونو څخه توپیر لري، د بیلګې په توګه mRNA، lncRNA، 3′ او 5′ د circRNA پایونه سره یوځای شوي ترڅو یو ګردي جوړښت رامینځته کړي، کوم چې دوی د هضم څخه ژغوري exonuclease او د ډیری خطي RNA څخه ډیر مستحکم دي. CircRNA موندل شوي چې د جین بیان تنظیم کولو کې مختلف دندې لري. CircRNA کولی شي د ceRNA په توګه کار وکړي، کوم چې miRNA په سیالۍ سره تړلی، چې د miRNA سپنج په نوم پیژندل کیږي. د CircRNA تسلسل تحلیل پلیټ فارم د circRNA جوړښت او بیان تحلیل ، هدف وړاندوینه او د RNA مالیکولونو نورو ډولونو سره ګډ تحلیل ځواکوي
-
BSA
د بلک شوي سیګریګینټ تحلیل پلیټ فارم د یو ګام معیاري تحلیل او د دودیز پیرامیټر ترتیب سره پرمختللي تحلیلونه لري. BSA یو تخنیک دی چې په چټکۍ سره د فینوټایپ اړوند جینیکیک مارکرونو پیژندلو لپاره کارول کیږي. د BSA اصلي کاري جریان لري: 1. د اشخاصو دوه ګروپونه غوره کول چې خورا مخالف فینوټایپونه لري؛ 2. د ټولو اشخاصو DNA، RNA یا SLAF-seq (د بایومارکر لخوا رامینځته شوی) راټولول ترڅو د DNA دوه لویه برخه جوړه کړي؛ 3. د حوالې جینوم یا په منځ کې د توپیر ترتیبونو پیژندل، 4. د ED او SNP-index الګوریتم لخوا د کاندید سره تړلې سیمې وړاندوینه کول؛ 5. د نوماندانو په سیمو کې د جینونو فعالیت تحلیل او بډایه کول، او داسې نور. په ډیټا کې نور پرمختللي کان کیندنې په شمول د جینیکیک مارکر سکرینینګ او پریمر ډیزاین هم شتون لري.
-
امپلیکون (16S/18S/ITS)
امپلیکون (16S/18S/ITS) پلیټ فارم د مایکروبیل تنوع پروژې تحلیل کې د کلونو تجربې سره رامینځته شوی ، کوم چې معیاري لومړني تحلیلونه او شخصي تحلیلونه لري: بنسټیز تحلیل د اوسني مایکروبیل څیړنې اصلي جریان تحلیل مینځپانګه پوښي ، د تحلیل مینځپانګه بډایه او پراخه ده ، او د تحلیل پایلې د پروژې راپورونو په بڼه وړاندې کیږي؛ د شخصي تحلیل محتويات متنوع دي. نمونې غوره کیدی شي او پیرامیټونه د لومړني تحلیلي راپور او څیړنې هدف سره سم په انعطاف سره تنظیم کیدی شي ، ترڅو د شخصي اړتیاو احساس وکړي. د وینډوز عملیاتي سیسټم، ساده او چټک.
