-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq د هسټون تعدیل، لیږد فکتورونو، او د DNA سره تړلي نور پروټینونو لپاره د DNA اهدافو جینوم پراخه پروفایل چمتو کوي.دا د ځانګړي پروټین - DNA کمپلیکسونو د بیرته ترلاسه کولو لپاره د کروماتین امونو - ورښت (ChIP) انتخاب ترکیب کوي ، د بیرته ترلاسه شوي DNA د لوړې کچې ترتیب کولو لپاره د راتلونکي نسل تسلسل (NGS) ځواک سره.برسیره پردې، ځکه چې د پروټین-DNA کمپلیکسونه د ژوندیو حجرو څخه بیرته اخیستل کیږي، د پابند سایټونه د مختلفو حجرو ډولونو او نسجونو کې پرتله کیدی شي، یا په مختلفو شرایطو کې.غوښتنلیکونه د لیږدونې مقرراتو څخه د ناروغۍ میکانیزمونو او هاخوا پراختیایی لارو پورې اړه لري.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
د بشپړ جینوم بیسلفائٹ ترتیب کول
په سیتوسین (5-mC) کې په پنځم ځای کې د DNA میتیلیشن د جین بیان او د حجرو فعالیت باندې بنسټیز اغیزه لري.غیر معمولي میتیلیشن نمونې د ډیری شرایطو او ناروغیو سره تړاو لري، لکه سرطان.WGBS په واحد بیس ریزولوشن کې د جینوم پراخه میتیلیشن مطالعې لپاره د سرو زرو معیار ګرځیدلی.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
د ټرانسپوز - د لاسرسي وړ کروماتین لپاره ارزونه د لوړې کچې ترتیب سره (ATAC-seq)
ATAC-seq د جینوم پراخه کروماتین لاسرسي تحلیل لپاره د لوړې کچې ترتیب کولو میتود دی ، کوم چې د جین بیان نړیوال ایپی جینیټیک کنټرول لپاره مهم دی.د ترتیب کولو اډاپټرونه په خلاص کروماتین سیمو کې د Hyperactive Tn5 ټرانسپوز لخوا داخل شوي.د PCR پراخولو وروسته، د ترتیب کتابتون جوړیږي.ټولې خلاصې کروماتین سیمې د یو ځانګړي ځای وخت شرایطو لاندې ترلاسه کیدی شي ، نه یوازې د ټرانسکرپشن فکتورونو پابند ځایونو پورې محدوده ، یا د ځانګړي هسټون ترمیم شوي سیمې پورې.
-
کم شوی نمایندګی د بیسلفائٹ ترتیب کول (RRBS)
د DNA میتیلیشن څیړنه تل د ناروغیو په څیړنه کې یوه ګرمه موضوع وه، او د جین بیان او فینو ټایپیک ځانګړتیاو سره نږدې تړاو لري.RRBS د DNA میتیلیشن څیړنې لپاره دقیق، اغیزمن او اقتصادي میتود دی.د پروموټر او CpG ټاپو سیمو بډایه کول د انزیمیک کلیویج (Msp I) په واسطه، د Bisulfite ترتیب سره یوځای، د لوړ ریزولوشن DNA میتیلیشن کشف چمتو کوي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
