-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq د هسټون تعدیل، لیږد فکتورونو، او د DNA سره تړلي نور پروټینونو لپاره د DNA اهدافو جینوم پراخه پروفایل چمتو کوي.دا د ځانګړي پروټین - DNA کمپلیکسونو د بیرته ترلاسه کولو لپاره د کروماتین امونو - ورښت (ChIP) انتخاب ترکیب کوي ، د بیرته ترلاسه شوي DNA د لوړې کچې ترتیب کولو لپاره د راتلونکي نسل تسلسل (NGS) ځواک سره.برسیره پردې، ځکه چې د پروټین-DNA کمپلیکسونه د ژوندیو حجرو څخه بیرته اخیستل کیږي، د پابند سایټونه د مختلفو حجرو ډولونو او نسجونو کې پرتله کیدی شي، یا په مختلفو شرایطو کې.غوښتنلیکونه د لیږدونې مقرراتو څخه د ناروغۍ میکانیزمونو او هاخوا پراختیایی لارو پورې اړه لري.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
Metagenomic Sequencing -NGS
میټاجینوم د ژوندی موجوداتو د ګډې ټولنې ټول جینیاتي موادو ټولګه ته اشاره کوي لکه د چاپیریال میټاګینوم، انساني میټاجینوم او داسې نور. دا د کرنې وړ او غیر کرل کیدونکي مایکرو ارګانیزمونو جینومونه لري.میټاجینومیک ترتیب یو مالیکولر وسیله ده چې د چاپیریال نمونو څخه استخراج شوي مخلوط جینومیک توکي تحلیل کولو لپاره کارول کیږي، کوم چې د ډولونو تنوع او کثرت، د نفوس جوړښت، فیلوجنیټیک اړیکه، فعال جینونه او د چاپیریال فکتورونو سره د ارتباط شبکه کې تفصيلي معلومات وړاندې کوي.
پلیټ فارم:د Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
Metagenomic Sequencing- نانوپور
میټاګینومکس یو مالیکولر وسیله ده چې د چاپیریال له نمونو څخه ایستل شوي مخلوط جینومیک توکي تحلیل کولو لپاره کارول کیږي، کوم چې د ډولونو تنوع او کثرت، د نفوس جوړښت، فایلوجینیک اړیکه، فعال جینونه او د چاپیریال فکتورونو سره د ارتباط شبکه، او نور په اړه مفصل معلومات وړاندې کوي. د نانوپور ترتیب کولو پلیټ فارمونه پدې وروستیو کې معرفي شوي د میټاګینومیک مطالعاتو لپاره.د لوستلو په اوږدوالي کې د دې عالي فعالیت په پراخه کچه د لاندې جریان میټاجینومیک تحلیل ته وده ورکړه ، په ځانګړي توګه د میټاګینوم اسمبلۍ.د لوستلو اوږدوالی څخه په ګټې اخیستنې، د نانوپور پر بنسټ میټاګینومیک مطالعه د دې توان لري چې د شاټ-ګن میټاجینومکس په پرتله ډیر دوامداره مجلس ترلاسه کړي.دا خپره شوې چې د نانوپور میشته میټاګینومکس په بریالیتوب سره د مایکرو بایومونو څخه بشپړ او تړل شوي باکتریا جینومونه تولید کړي (Moss, EL, et. al.,د طبیعت بایوټیک۲۰۲۰)
پلیټ فارم:Nanopore PromethION P48
-
د بشپړ جینوم بیسلفائٹ ترتیب کول
په سیتوسین (5-mC) کې په پنځم ځای کې د DNA میتیلیشن د جین بیان او د حجرو فعالیت باندې بنسټیز اغیزه لري.غیر معمولي میتیلیشن نمونې د ډیری شرایطو او ناروغیو سره تړاو لري، لکه سرطان.WGBS په واحد بیس ریزولوشن کې د جینوم پراخه میتیلیشن مطالعې لپاره د سرو زرو معیار ګرځیدلی.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
د ټرانسپوز - د لاسرسي وړ کروماتین لپاره ارزونه د لوړې کچې ترتیب سره (ATAC-seq)
ATAC-seq د جینوم پراخه کروماتین لاسرسي تحلیل لپاره د لوړې کچې ترتیب کولو میتود دی ، کوم چې د جین بیان نړیوال ایپی جینیټیک کنټرول لپاره مهم دی.د ترتیب کولو اډاپټرونه په خلاص کروماتین سیمو کې د Hyperactive Tn5 ټرانسپوز لخوا داخل شوي.د PCR پراخولو وروسته، د ترتیب کتابتون جوړیږي.ټولې خلاصې کروماتین سیمې د یو ځانګړي ځای وخت شرایطو لاندې ترلاسه کیدی شي ، نه یوازې د ټرانسکرپشن فکتورونو پابند ځایونو پورې محدوده ، یا د ځانګړي هسټون ترمیم شوي سیمې پورې.
-
16S/18S/ITS امپلیکون ترتیب کول-PacBio
په 16S او 18S rRNA کې فرعي واحد چې دواړه خورا خوندي او لوړ متغیر سیمې لري د پروکریوټیک او یوکریوټیک ارګانیزمونو پیژندلو لپاره د مالیکولر ګوتو نښه ده.د ترتیب کولو څخه په ګټې اخیستنې، دا امپلیکونونه د محافظت شوي برخو پراساس په نښه کیدی شي او د هایپر - متغیر سیمې په بشپړ ډول د مایکروبیل پیژندنې لپاره مشخص کیدی شي چې د مایکروبیل تنوع تحلیل ، ټیکونومي ، فیلوجیني او داسې نور پوښښ کې مرسته کوي. واحد مالیکول ریښتیني وخت (SMRT ) د PacBio پلیټ فارم ترتیب کول د خورا دقیق اوږد لوستلو ترلاسه کولو توان ورکوي ، کوم چې کولی شي د بشپړ اوږدوالي امپلیکون پوښښ کړي (شاوخوا 1.5 Kb).د جینیاتي ساحې پراخه لید د باکتریا یا فنګسي ټولنې کې د نوعې تشریح کې حل خورا ښه کړی.
پلیټ فارم:د PacBio سیکویل II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
د 16S/18S/ITS امپلیکون ترتیب هدف په مایکروبیل ټولنه کې د فیلوجیني ، ټیکونومي ، او ډولونو کثرت څرګندول دي د کور ساتنې جینیتیک مارکرونو PCR محصولاتو تحقیق کولو له لارې چې دواړه خورا متقابل او هایپر بدلیدونکي برخې لري.د Woeses et al، (1977) لخوا د دې کامل مالیکولر ګوتو نښې معرفي کول د انزوا څخه پاک مایکروبیوم پروفایل کولو ځواک ورکوي.د 16S (بکټریا)، 18S (فنګسي) او داخلي نقل شوي سپیسر (ITS، فنګسي) ترتیب کول د دواړو پراخه ډولونو او همدارنګه نادر او ناپیژندل شوي ډولونو پیژندلو ته اجازه ورکوي.دا ټیکنالوژي په بیلابیلو چاپیریالونو کې د توپیر مایکروبیل ترکیب پیژندلو کې په پراخه کچه پلي شوي او لوی وسیله ګرځیدلې ، لکه د انسان خولې ، کولمو ، ملایانو او داسې نور.
پلیټ فارم:د Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
باکتریا او فنګسي ټول جینوم بیا ترتیب کول
د باکتریا او فنګسي ټول جینوم بیا ترتیب کول د پیژندل شوي بکتیریا او فنګسي جینومونو بشپړولو لپاره یوه مهمه وسیله ده، او همدارنګه د څو جینومونو پرتله کول یا د نوي ژوندی موجوداتو جینومونو نقشه کول.دا خورا مهم دی چې د باکتریا او فنګسي ټول جینومونه ترتیب کړي ترڅو دقیق حواله جینومونه رامینځته کړي ، د مایکروبیل پیژندنې او نورو پرتله کولو جینوم مطالعات ترسره کړي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
PacBio - بشپړ اوږدوالی 16S/18S/ITS امپلیکون ترتیب کول
امپلیکون (16S/18S/ITS) پلیټ فارم د مایکروبیل تنوع پروژې تحلیل کې د کلونو تجربې سره رامینځته شوی ، کوم چې معیاري لومړني تحلیلونه او شخصي تحلیلونه لري: بنسټیز تحلیل د اوسني مایکروبیل څیړنې اصلي جریان تحلیل مینځپانګه پوښي ، د تحلیل مینځپانګه بډایه او پراخه ده ، او د تحلیل پایلې د پروژې راپورونو په بڼه وړاندې کیږي؛د شخصي تحلیل محتويات متنوع دي.نمونې غوره کیدی شي او پیرامیټونه د لومړني تحلیلي راپور او څیړنې هدف سره سم په انعطاف سره تنظیم کیدی شي ، ترڅو د شخصي اړتیاو احساس وکړي.د وینډوز عملیاتي سیسټم، ساده او چټک.
-
PacBio - د بشپړ اوږدوالی ټرانسکریټوم (بې حواله)
د پاسیفیک بایوسینس (PacBio) Isoform تسلسل ډیټا د ان پټ په توګه اخیستل ، دا ایپ د دې وړتیا لري چې د بشپړ اوږدوالي لیږد ترتیبونه وپیژني (پرته له غونډې).د حوالې جینوم په وړاندې د بشپړ اوږدوالي ترتیبونو نقشه کولو سره، لیږدونه د پیژندل شوي جینونو، ټرانسکریپټونو، کوډ کولو سیمو او نورو په واسطه اصلاح کیدی شي. پدې حالت کې، د mRNA جوړښتونو ډیر دقیق پیژندنه، لکه د بدیل جلا کول، او نور، ترلاسه کیدی شي.د NGS ټرانسکریپټوم ترتیب کولو ډیټا سره ګډ تحلیل د لیږد په کچه په بیان کې ډیر جامع تشریح او ډیر دقیق مقدار تاییدوي ، کوم چې په لویه کچه د لاندې جریان توپیر څرګندولو او فعال تحلیلونو څخه ګټه پورته کوي.
-
کم شوی نمایندګی د بیسلفائٹ ترتیب کول (RRBS)
د DNA میتیلیشن څیړنه تل د ناروغیو په څیړنه کې یوه ګرمه موضوع وه، او د جین بیان او فینو ټایپیک ځانګړتیاو سره نږدې تړاو لري.RRBS د DNA میتیلیشن څیړنې لپاره دقیق، اغیزمن او اقتصادي میتود دی.د پروموټر او CpG ټاپو سیمو بډایه کول د انزیمیک کلیویج (Msp I) په واسطه، د Bisulfite ترتیب سره یوځای، د لوړ ریزولوشن DNA میتیلیشن کشف چمتو کوي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
پروکاریوټیک mRNA ترتیب کول
د mRNA ترتیب کول د ځانګړو شرایطو لاندې په حجرو کې د ټولو mRNA لیږدونو جامع پروفایل کولو ځواک ورکوي.دا عصري ټیکنالوژي د یوې پیاوړې وسیلې په توګه کار کوي، د پیچلي جین بیان پروفایلونه، د جین جوړښتونه، او د مختلفو بیولوژیکي پروسو سره تړلي مالیکول میکانیزمونه افشا کوي.په پراخه کچه په بنسټیزو څیړنو، کلینیکي تشخیص، او د مخدره توکو پراختیا کې منل شوي، د mRNA ترتیب د سیلولر متحرکاتو او جینیاتي مقرراتو پیچلتیاو کې بصیرت وړاندې کوي.زموږ د پروکاریوټیک mRNA نمونې پروسس د پروکاریوټیک ټرانسکرټومونو لپاره مناسب دی ، چې پکې د rRNA تخریب او لارښود کتابتون چمتو کول شامل دي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq X
