-
د واحدې هستې د RNA تسلسل
د واحد حجروي نیول او د دودیز کتابتون جوړولو تخنیکونو پراختیا، د لوړ تروپټ ترتیب سره یوځای، د حجرو په کچه د جین د څرګندولو مطالعاتو کې انقلاب راوستی دی. دا پرمختګ د پیچلو حجروي نفوس ژور او ډیر جامع تحلیل ته اجازه ورکوي، د ټولو حجرو په اړه د جین د څرګندولو اوسط سره تړلي محدودیتونه لرې کوي او پدې نفوسو کې ریښتیني متفاوتیت ساتي. پداسې حال کې چې د واحد حجروي RNA ترتیب (scRNA-seq) د نه منلو وړ ګټې لري، دا په ځینو نسجونو کې ننګونو سره مخ کیږي چیرې چې د واحد حجروي تعلیق رامینځته کول ستونزمن ثابت کیږي او تازه نمونو ته اړتیا لري. په BMKGene کې، موږ د عصري 10X جینومکس کرومیم ټیکنالوژۍ په کارولو سره د واحد نیوکلیوس RNA ترتیب (snRNA-seq) وړاندې کولو سره دا خنډ حل کوو. دا طریقه د واحد حجروي کچې کې د ټرانسکرپټوم تحلیل لپاره د منلو وړ نمونو سپیکٹرم پراخوي.
د هستې جلا کول د نوښتګر 10X جینومکس کرومیم چپ له لارې ترسره کیږي، چې د دوه ګوني کراسنګ سره د اتو چینل مایکرو فلوایډکس سیسټم لري. پدې سیسټم کې، د جیل مڼې چې بارکوډونه، پرائمرونه، انزایمونه او یو واحد هسته پکې شامل دي د نانو لیټر په اندازه د تیلو څاڅکو کې پوښل شوي، د جیل مڼې-ان-ایمولشن (GEM) جوړوي. د GEM د جوړښت وروسته، د حجرو لیسیس او د بارکوډ خوشې کول په هر GEM کې واقع کیږي. وروسته، د mRNA مالیکولونه په cDNAs کې د ریورس ټرانسکرپشن څخه تیریږي، چې 10X بارکوډونه او ځانګړي مالیکولر پیژندونکي (UMIs) پکې شامل دي. دا cDNAs بیا د معیاري ترتیب کتابتون جوړونې تابع کیږي، چې د واحد حجرو په کچه د جین د څرګندولو پروفایلونو قوي او جامع سپړنه اسانه کوي.
پلیټ فارم: ۱۰× جینومکس کرومیم او ایلومینا نووا سیک پلیټ فارم
-
د بشپړ اوږدوالي mRNA تسلسل - نانوپور
که څه هم د NGS پر بنسټ د mRNA ترتیب د جین د څرګندولو د اندازه کولو لپاره یو څو اړخیزه وسیله ده، په لنډو لوستلو باندې تکیه کول د پیچلو ټرانسکرپټومیک تحلیلونو کې د هغې اغیزمنتوب محدودوي. له بلې خوا، نانوپور ترتیب د اوږد لوستلو ټیکنالوژۍ کاروي، چې د بشپړ اوږدوالي mRNA ټرانسکرپټونو ترتیب فعالوي. دا طریقه د بدیل سپلیسینګ، جین فیوژن، پولی اډینیلیشن، او د mRNA ایزوفارمونو اندازه کولو جامع سپړنه اسانه کوي.
د نانوپور ترتیب، یوه طریقه چې د نانوپور واحد مالیکول ریښتیني وخت بریښنایی سیګنالونو باندې تکیه کوي، په ریښتیني وخت کې پایلې چمتو کوي. د موټرو پروټینونو لخوا لارښود شوی، دوه ګونی ډنډ شوی DNA د بایوفیلم کې ځای پرځای شوي نانوپور پروټینونو سره تړل کیږي، کله چې دا د ولټاژ توپیر لاندې د نانوپور چینل څخه تیریږي خلاصیږي. د DNA سټرینډ کې د مختلفو اساساتو لخوا رامینځته شوي ځانګړي بریښنایی سیګنالونه په ریښتیني وخت کې کشف او طبقه بندي کیږي، دقیق او دوامداره نیوکلیوټایډ ترتیب اسانه کوي. دا نوښتګر چلند د لنډ لوستلو محدودیتونو څخه تیریږي او د پیچلي جینومیک تحلیل لپاره متحرک پلیټ فارم چمتو کوي، پشمول د پیچلي ټرانسکرپټومیک مطالعاتو سره، د سمدستي پایلو سره.
پلیټ فارم: نانوپور پرومیتیون ۴۸
-
د بشپړ اوږدوالي mRNA ترتیب - PacBio
پداسې حال کې چې د NGS پر بنسټ د mRNA ترتیب د جین د څرګندولو د اندازه کولو لپاره یو څو اړخیز وسیله ده، په لنډو لوستلو باندې تکیه کول په پیچلو ټرانسکرپټومیک تحلیلونو کې د هغې کارول محدودوي. له بلې خوا، PacBio ترتیب (Iso-Seq) د اوږد لوستلو ټیکنالوژي کاروي، د بشپړ اوږدوالي mRNA لیږدونو ترتیب فعالوي. دا طریقه د بدیل سپلیسینګ، جین فیوژن، او پولی اډینیلیشن جامع سپړنه اسانه کوي. په هرصورت، د اړتیا وړ ډیټا لوړ مقدار له امله د جین د څرګندولو اندازه کولو لپاره نور انتخابونه شتون لري. د PacBio ترتیب ټیکنالوژي په واحد مالیکول، ریښتیني وخت (SMRT) ترتیب تکیه کوي، د بشپړ اوږدوالي mRNA لیږدونو په نیولو کې یو ځانګړی ګټه چمتو کوي. پدې نوښتګر چلند کې د صفر موډ ویو ګایډونو (ZMWs) او مایکرو فابریکیټ شوي څاګانو کارول شامل دي چې د ترتیب کولو پرمهال د DNA پولیمریز فعالیت ریښتیني وخت مشاهده فعالوي. د دې ZMWs دننه، د PacBio DNA پولیمریز د DNA یو بشپړونکی سټرینډ ترکیب کوي، اوږد لوستل تولیدوي چې د mRNA لیږدونو ټول پوښښ لري. د سرکلر کنسینسس سیکوینسنګ (CCS) حالت کې د پیک بایو عملیات د ورته مالیکول په مکرر ترتیب کولو سره دقت لوړوي. تولید شوي های فای لوستل د NGS سره پرتله کیدونکي دقت لري، چې د پیچلو ټرانسکرپټومیک ځانګړتیاو جامع او باوري تحلیل کې نور هم مرسته کوي.
پلیټ فارم: PacBio Sequel II؛ PacBio Revio
-
د یوکاریوټیک mRNA تسلسل-NGS
د mRNA ترتیب یوه تخنیک ده چې د راتلونکي نسل ترتیب کاروي ترڅو په بیولوژیکي نمونه کې د RNA مالیکولونو شتون او مقدار څرګند کړي، په نمونه کې د جین څرګندولو سنیپ شاټ چمتو کوي.
د خپلو پراخو غوښتنلیکونو سره، دا پرمختللې وسیله د جین د څرګندولو پیچلي پروفایلونه، د جین جوړښتونه، او د متنوع بیولوژیکي پروسو سره تړلي مالیکولي میکانیزمونه افشا کوي.
دا تخنیک په پراخه کچه په څیړنه، کلینیکي تشخیصاتو، او د درملو پراختیا کې کارول کیږي، ځکه چې دا د حجرو متحرکاتو او جینیاتي مقرراتو پیچلتیاو ته بصیرت وړاندې کوي، چې په مختلفو برخو کې د دې د وړتیا په اړه د تجسس د رامینځته کولو لپاره یو قوي اساس چمتو کوي.
شته پلیټ فارمونه: ایلومینا نووا سیک ایکس؛ DNBSEQ-T7
-
د غیر حوالې پر بنسټ د mRNA ترتیب-NGS
د mRNA ترتیب د ځانګړو شرایطو لاندې د حجرو دننه د ټولو mRNA لیږدونو جامع پروفایل کولو ته ځواک ورکوي. دا پرمختللې ټیکنالوژي د یوې قوي وسیلې په توګه کار کوي، د جین د څرګندولو پیچلي پروفایلونه، د جین جوړښتونه، او د متنوع بیولوژیکي پروسو سره تړلي مالیکولي میکانیزمونه افشا کوي. په بنسټیزو څیړنو، کلینیکي تشخیصاتو، او د مخدره توکو پراختیا کې په پراخه کچه منل شوی، د mRNA ترتیب د حجروي متحرکاتو او جینیاتي تنظیماتو پیچلتیاو ته بصیرت وړاندې کوي.
پلیټ فارم: ایلومینا نووا سیک ایکس؛ DNBSEQ-T7
-
اوږده غیر کوډ کولو ترتیب - الیومینا
اوږده غیر کوډ شوي RNAs (lncRNAs) د 200 نیوکلیوټایډونو څخه اوږد دي چې لږترلږه کوډ کولو پوټینشن لري او د غیر کوډ کولو RNA دننه مهم عناصر دي. په نیوکلیوس او سایتوپلازم کې موندل شوي، دا RNAs په ایپی جینیټیک، ټرانسکرپشنل، او پوسټ ټرانسکرپشنل تنظیم کې مهم رول لوبوي، د حجروي او مالیکولي پروسو په شکل ورکولو کې د دوی اهمیت ټینګار کوي. د LncRNA ترتیب د حجرو توپیر، اونټجینیسیس، او انساني ناروغیو کې یو پیاوړی وسیله ده.
پلیټ فارم: ایلومینا نووا سیک ایکس
-
د کوچني RNA تسلسل - الیومینا
کوچني RNA د RNA مالیکولونو یوه ډله ده چې پکې مایکرو RNAs (miRNAs)، کوچني مداخله کونکي RNAs (siRNAs)، او piwi-interacting RNAs (piRNAs) شامل دي. د دې په منځ کې، miRNAs، چې شاوخوا 18-25 نیوکلیوټایډونه اوږد دي، په ځانګړي ډول د مختلفو حجروي پروسو کې د دوی د مهم تنظیمي رولونو لپاره د پام وړ دي. د نسجونو ځانګړي او مرحلې ځانګړي بیان نمونو سره، miRNAs په مختلفو ډولونو کې لوړ محافظت ښیې.
پلیټ فارم: ایلومینا نووا سیک
-
د سرک آر این اې تسلسل-الومینا
د سرکلر RNA ترتیب (circRNA-seq) د سرکلر RNAs پروفایل او تحلیل کوي، د RNA مالیکولونو یوه ټولګه چې د غیر کینونیکل سپلایسینګ پیښو له امله تړل شوي حلقې جوړوي، دې RNA ته ډیر ثبات چمتو کوي. پداسې حال کې چې ځینې سرکلر RNAs د مایکرو RNA سپنجونو په توګه عمل کولو لپاره ښودل شوي، مایکرو RNAs جلا کوي او د دوی د هدف mRNAs تنظیم کولو څخه یې مخنیوی کوي، نور سرکلر RNAs ممکن د پروټینونو سره تعامل وکړي، د جین څرګندونه تعدیل کړي، یا په حجروي پروسو کې رول ولري. د سرکلر RNA د بیان تحلیل د دې مالیکولونو تنظیمي رولونو او په مختلفو حجروي پروسو، پراختیایي مرحلو، او د ناروغۍ شرایطو کې د دوی اهمیت په اړه بصیرت چمتو کوي، د جین څرګندولو په شرایطو کې د RNA تنظیم پیچلتیا ژوره پوهه کې مرسته کوي.
پلیټ فارم: ایلومینا نوواسیک ایکس
-
د بشپړ ټرانسکرپټوم ترتیب - ایلومینا
د وول ټرانسکرپټوم ترتیب د متنوع RNA مالیکولونو پروفایل کولو لپاره یوه جامع طریقه وړاندې کوي، چې کوډینګ (mRNA) او غیر کوډینګ RNAs (lncRNA، circRNA، او miRNA) پکې شامل دي. دا تخنیک په یوه ټاکلې شیبه کې د ځانګړو حجرو ټول ټرانسکرپټوم نیسي، چې د حجروي پروسو جامع پوهاوي ته اجازه ورکوي.
شته پلیټ فارمونه: ایلومینا نوواسیک ایکس
