-
بشپړ اوږدوالی mRNA ترتیب کول - نانوپور
د RNA ترتیب کول د هراړخیز ټرانسکریټوم تحلیل لپاره ارزښتناکه وسیله وه.بې له شکه، دودیز لنډ لوستلو ترتیب دلته ډیر مهم پرمختګ ترلاسه کړ.په هرصورت، دا ډیری وختونه د بشپړ اوږدوالی isoform پیژندنې، اندازه کولو، PCR تعصب کې محدودیتونو سره مخ کیږي.
د نانوپور ترتیب کول د نورو ترتیب کولو پلیټ فارمونو څخه ځان توپیر کوي، پدې کې نیوکلیوټایډونه د DNA ترکیب پرته مستقیم لوستل کیږي او په لسګونو کیلوبیسونو کې اوږد لوستل تولیدوي.دا د بشپړ اوږدوالي لیږدونو څخه مستقیم لوستل او د isoform کچې مطالعاتو کې ننګونو سره مبارزه ځواکمن کوي.
پلیټ فارم:نانوپور پرومیتیون
کتابتون:cDNA-PCR
-
De novo د بشپړ اوږدوالي ټرانسکریټوم تسلسل -PacBio
نوود بشپړ اوږدوالی ټرانسکریپټوم ترتیب، چې په نوم هم پیژندل کیږينووIso-Seq د لوستلو په اوږدوالي کې د PacBio سیکوینسر ګټې اخلي ، کوم چې پرته له کوم وقفې د بشپړ اوږدوالي cDNA مالیکولونو ترتیب کول وړوي.دا په بشپړ ډول د هر ډول غلطیو څخه مخنیوی کوي چې د ټرانسکریپټ مجلس مرحلو کې رامینځته کیږي او د یونیګین سیټونه د isoform-level ریزولوشن سره رامینځته کوي.دا یونیګین سیټونه د ټرانسکریپټوم په کچه د "حوصلې جینوم" په توګه پیاوړي جنیټیک معلومات چمتو کوي.سربیره پردې ، د راتلونکي نسل ترتیب کولو ډیټا سره یوځای کول ، دا خدمت د isoform کچې بیان دقیق مقدار کولو ځواک ورکوي.
پلیټ فارم: PacBio Sequel IIکتابتون: د SMRT بیل کتابتون -
Eukaryotic mRNA ترتیب کول - ایلومینا
د mRNA ترتیب کول د ځانګړو شرایطو لاندې د حجرو څخه لیږدول شوي د ټولو mRNAs پروفایل کول وړوي.دا د جین څرګندولو پروفایل، د جین جوړښتونو او د ځینو بیولوژیکي پروسو مالیکول میکانیزمونو څرګندولو لپاره یو پیاوړی ټیکنالوژي ده.تر نن نیټې پورې، د mRNA ترتیب په پراخه کچه په بنسټیزو څیړنو، کلینیکي تشخیص، د درملو پراختیا، او داسې نورو کې کارول شوي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
د غیر حوالې پراساس mRNA ترتیب کول - ایلومینا
د mRNA ترتیب کول د راتلونکي نسل ترتیب کولو تخنیک (NGS) غوره کوي ترڅو د رسول RNA (mRNA) بڼه یوکرایوټ په ځانګړي وخت کې ونیسي چې ځینې ځانګړي فعالیتونه فعالوي.تر ټولو اوږده ټرانسکریپټ د یونیګین په نوم یادیږي او د راتلونکو تحلیلونو لپاره د حوالې ترتیب په توګه کارول کیږي، کوم چې د مایعاتو پرته د ډولونو مالیکول میکانیزم او تنظیمي شبکې مطالعې لپاره اغیزمن وسیله ده.
د ټرانسکریپټوم ډیټا اسمبلۍ او یونیګین فعال تشریح وروسته
(1) د SNP تحلیل، د SSR تحلیل، د CDS وړاندوینه او د جین جوړښت به مخکې جوړ شي.
(2) په هره نمونه کې د یونیګین بیان اندازه کول به ترسره شي.
(3) د نمونو (یا ګروپونو) تر مینځ په توپیر سره څرګند شوي یونیګین به د یونیګین بیان پراساس کشف شي
(4) د توپیر څرګند شوي یونیجینز کلستر کول، فعال تشریح او بډایه کول به ترسره شي
-
اوږد غیر کوډ کولو ترتیب - Illumina
اوږده غیر کوډ کولو RNAs (lncRNAs) د RNA مالیکولونو یو ډول دی چې اوږدوالی یې له 200 nt څخه ډیر دی ، کوم چې د خورا ټیټ کوډ کولو ظرفیت لخوا مشخص کیږي.LncRNA، په غیر کوډ کولو RNAs کې د کلیدي غړي په توګه، په عمده توګه په نیوکلیوس او پلازما کې موندل کیږي.د ترتیب کولو ټیکنالوژۍ او بایو انفارمیټکس کې پرمختګ د ډیری ناول lncRNAs پیژندلو توان ورکوي او هغه د بیولوژیکي دندو سره شریکوي.راټول شوي شواهد وړاندیز کوي چې lncRNA په پراخه کچه د ایپی جینیټیک مقرراتو ، د لیږد تنظیم کولو او د لیږد وروسته مقرراتو کې دخیل دی.
-
کوچني RNA ترتیب کول - ایلومینا
کوچني RNA د غیر کوډ کولو RNA مالیکولونو ټولګي ته اشاره کوي چې معمولا په اوږدوالي کې له 200nt څخه کم وي ، پشمول د مایکرو RNA (miRNA) ، کوچني مداخلې RNA (siRNA) ، او piwi متقابل RNA (piRNA).
MicroRNA (miRNA) د 20-24nt اوږدوالی سره د انډروجینس کوچني RNA ټولګي ده، کوم چې په حجرو کې مختلف مهم تنظیمي رول لوبوي.miRNA د ژوند په ډیری پروسو کې دخیل دي کوم چې د نسج څرګندونه - ځانګړي او مرحله - ځانګړي بیان او په مختلف ډولونو کې خورا خوندي ساتل کیږي.
-
circRNA ترتیب کول - ایلومینا
د بشپړ ټرانسکریټوم ترتیب د RNA ټول ډوله مالیکولونو پروفایل کولو لپاره ډیزاین شوی ، پشمول د کوډینګ (mRNA) او غیر کوډ کولو RNAs (په شمول lncRNA، circRNA او miRNA) چې په یو ټاکلي وخت کې د ځانګړو حجرو لخوا لیکل شوي.د بشپړ ټرانسکریټوم ترتیب کول چې د "ټول RNA ترتیب" په نوم هم پیژندل کیږي هدف د ټرانسکریټوم په کچه د هراړخیز تنظیمي شبکې څرګندول دي.د NGS ټیکنالوژۍ څخه په ګټې اخیستنې سره، د بشپړ ټرانسکریټوم محصولاتو لړۍ د ceRNA تحلیل او ګډ RNA تحلیل لپاره شتون لري، کوم چې د فعال ځانګړتیا په لور لومړی ګام وړاندې کوي.د ceRNA پر بنسټ د circRNA-miRNA-mRNA تنظیمي شبکه ښکاره کول.
-
د بشپړ ټرانسکریپټوم ترتیب - ایلومینا
د بشپړ ټرانسکریټوم ترتیب د RNA ټول ډوله مالیکولونو پروفایل کولو لپاره ډیزاین شوی ، پشمول د کوډینګ (mRNA) او غیر کوډ کولو RNAs (په شمول lncRNA، circRNA او miRNA) چې په یو ټاکلي وخت کې د ځانګړو حجرو لخوا لیکل شوي.د بشپړ ټرانسکریټوم ترتیب کول چې د "ټول RNA ترتیب" په نوم هم پیژندل کیږي هدف د ټرانسکریټوم په کچه د هراړخیز تنظیمي شبکې څرګندول دي.د NGS ټیکنالوژۍ څخه په ګټې اخیستنې سره، د بشپړ ټرانسکریټوم محصولاتو لړۍ د ceRNA تحلیل او ګډ RNA تحلیل لپاره شتون لري، کوم چې د فعال ځانګړتیا په لور لومړی ګام وړاندې کوي.د ceRNA پر بنسټ د circRNA-miRNA-mRNA تنظیمي شبکه ښکاره کول.
-
پروکاریوټیک RNA ترتیب کول
د پروکاریوټیک RNA تسلسل د راتلونکي نسل ترتیب (NGS) کاروي ترڅو په یوه ټاکلې شیبه کې د RNA شتون او مقدار څرګند کړي ، د بدلیدونکي سیلولر ټرانسکریټوم تحلیل کولو سره.زموږ د شرکت پروکاریوټیک RNA ترتیب، په ځانګړې توګه د حوالې جینومونو سره د پروکاریوټس هدف دی، تاسو ته د ټرانسکریپټوم پروفایل، د جین جوړښت تحلیل، او داسې نور چمتو کول دي. دا په پراخه کچه د لومړني ساینس څیړنې، د درملو څیړنې او پراختیا، او نور ډیر کارول شوي.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranscriptome تسلسل
د میټاټرانسکریټوم ترتیب کول په طبیعي چاپیریال کې د مایکروبونو (دواړه یوکریوټس او پروکاریوټس) د جین څرګندونه په ګوته کوي (د بیلګې په توګه خاوره ، اوبه ، بحر ، ملا او کولمو.). د ډولونو، د مختلف څرګند شوي جینونو فعال غني کولو تحلیل، او نور.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq 6000
