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Ensaio para cromatina acessível por transposase com sequenciamento de alto rendimento (ATAC-seq)

ATAC-seq é um método de sequenciamento de alto rendimento para análise da acessibilidade da cromatina em todo o genoma, que é importante para o controle epigenético global da expressão gênica.Adaptadores de sequenciamento são inseridos em regiões abertas da cromatina pela transposase Tn5 hiperativa.Após a amplificação por PCR, uma biblioteca de sequenciamento é construída.Todas as regiões abertas da cromatina podem ser obtidas sob uma condição espaço-temporal específica, não apenas limitada aos sítios de ligação de um fator de transcrição, ou a uma determinada região modificada por histonas.


Detalhes do serviço

Bioinformática

Resultados de demonstração

Vantagens do serviço

● Análise Abrangente: Pipeline de análise profissional para atender a uma variedade de necessidades de análise personalizadas;

● Ampla experiência: Centenas de projetos concluídos com sucesso até agora, incluindo amostras de animais e plantas.

Especificações de serviço

Plataforma: plataforma Illumina NovaSeq

Tipo de biblioteca: ATAC-seq

Saída de dados recomendada: ≥20 milhões de leituras

Requisitos de amostra

Tipo de amostra: Tecidos, células vivas ou células congeladas e assim por diante

Número de células: ≥ 5×105células, um número preciso de células é a chave para o sucesso do experimento;

Peso do tecido: ≥ 200 mg de tecido fresco;

Sangue: ≥ 2 mL

Fluxo de trabalho de serviço

CQ de amostra

Projeto de experimento

entrega de amostra

Entrega de amostra

Experiência piloto

Extração de DNA

Preparação da Biblioteca

Construção de biblioteca

Sequenciamento

Sequenciamento

Análise de dados

Análise de dados

Serviços pós-venda

Serviços pós-venda


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  • 表观-02

    1.Heatmap no ATAC lê a distribuição no TSS e regiões adjacentes (±3 kb)

    3(1)2.Distribuição da região aberta da cromatina em diferentes componentes do genoma

    4(1)

    3. Chamada de pico diferencial entre grupos

    5(1)

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