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Sequenciamento de Imunoprecipitação de Cromatina (ChIP-seq)
O ChIP-Seq fornece perfis genômicos de alvos de DNA para modificação de histonas, fatores de transcrição e outras proteínas associadas ao DNA.Ele combina a seletividade da imunoprecipitação da cromatina (ChIP) para recuperar complexos específicos de proteína-DNA, com o poder do sequenciamento de próxima geração (NGS) para sequenciamento de alto rendimento do DNA recuperado.Além disso, como os complexos proteína-DNA são recuperados de células vivas, os sítios de ligação podem ser comparados em diferentes tipos de células e tecidos, ou sob diferentes condições.As aplicações variam de regulação transcricional a vias de desenvolvimento a mecanismos de doenças e além.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
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Sequenciamento completo do genoma bissulfito
A metilação do DNA na quinta posição da citosina (5-mC) tem uma influência fundamental na expressão gênica e na atividade celular.Padrões anormais de metilação têm sido associados a várias condições e doenças, como câncer.O WGBS tornou-se o padrão-ouro para estudar a metilação de todo o genoma em resolução de base única.
Plataforma: Illumina NovaSeq6000
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Ensaio para cromatina acessível por transposase com sequenciamento de alto rendimento (ATAC-seq)
ATAC-seq é um método de sequenciamento de alto rendimento para análise da acessibilidade da cromatina em todo o genoma, que é importante para o controle epigenético global da expressão gênica.Os adaptadores de sequenciamento são inseridos em regiões de cromatina abertas pela transposase Tn5 hiperativa.Após a amplificação por PCR, uma biblioteca de sequenciamento é construída.Todas as regiões abertas da cromatina podem ser obtidas sob uma condição espaço-temporal específica, não limitada apenas aos sítios de ligação de um fator de transcrição, ou uma certa região modificada por histonas.
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Sequenciamento de Bissulfito de Representação Reduzida (RRBS)
A pesquisa de metilação de DNA sempre foi um tema quente na pesquisa de doenças e está intimamente relacionada à expressão gênica e características fenotípicas.RRBS é um método preciso, eficiente e econômico para pesquisa de metilação de DNA.O enriquecimento do promotor e das regiões insulares CpG por clivagem enzimática (Msp I), combinado com sequenciamento de bissulfito, fornece detecção de metilação de DNA de alta resolução.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
