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Produtos

Sequenciamento de mRNA eucariótico - Illumina

O sequenciamento de mRNA permite o perfil de todos os mRNAs transcritos de células sob condições específicas.É uma tecnologia poderosa para revelar o perfil de expressão gênica, estruturas gênicas e mecanismos moleculares de certos processos biológicos.Até o momento, o sequenciamento de mRNA tem sido amplamente empregado em pesquisas fundamentais, diagnósticos clínicos, desenvolvimento de medicamentos, etc.

Plataforma: Illumina NovaSeq 6000


Detalhes do serviço

Bioinformática

Resultados de demonstração

Vantagens

ØAltamente experiente: Mais de 200.000 amostras foram processadas no BMK abrangendo diversos tipos de amostras, incluindo cultura de células, tecidos, fluidos corporais, etc. e mais de 7.000 projetos de mRNA-Seq fechados abrangendo várias áreas de pesquisa.

ØRigoroso sistema de controle de qualidade: Os principais pontos de controle de qualidade em todas as etapas, incluindo preparação de amostras, preparação de bibliotecas, sequenciamento e bioinformática, estão sob monitoramento rigoroso para fornecer resultados de alta qualidade.

ØMúltiplos bancos de dados disponíveis para anotações de funções e estudos de enriquecimento para atender a diversos objetivos de pesquisa.

ØServiços pós-venda: Serviços pós-venda válidos por 3 meses após a conclusão do projeto, incluindo acompanhamento de projetos, solução de problemas, perguntas e respostas de resultados, etc.

Requisitos de Amostra e Entrega

Biblioteca Estratégia de sequenciamento Dados recomendados Controle de qualidade
Poli A enriquecido Illumina PE150

6 GB

Q30≥85%

Requisitos de amostra:

Nucleotídeos:

Pureza Integridade Resultar
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Limitada ou nenhuma contaminação de proteína ou DNA mostrada no gel. Para plantas: RIN≥6,5;Para animais: RIN≥7;28S/18S≥1,0;limitado ou sem elevação da linha de base Conc.≥30 ng/μl;Volume ≥ 10 μl;Total ≥ 1,5 μg

Tecido: Peso (seco):≥1g
*Para tecidos menores que 5 mg, recomendamos enviar uma amostra de tecido congelada (em nitrogênio líquido).

Suspensão celular:Contagem de células = 3×106- 1×107
*Recomendamos enviar lisado celular congelado.No caso de contagem de células menor que 5×105, recomenda-se congelamento instantâneo em nitrogênio líquido, o que é preferível para microextração.

Amostras de sangue:Volume ≥1 ml

Microrganismo:Massa ≥ 1 g

Entrega de amostra recomendada

Recipiente: tubo de centrífuga de 2 ml (folha de estanho não é recomendada)

Marcação da amostra: Grupo+replicar, por exemplo, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Envio:

  1. Gelo seco: As amostras precisam ser embaladas em sacos e enterradas em gelo seco.
  2. Tubos RNAstable: As amostras de RNA podem ser secas em tubo de estabilização de RNA (por exemplo, RNAstable®) e enviadas em temperatura ambiente.

Fluxo de trabalho de serviço

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Projeto do experimento

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Entrega de amostra

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Extração de RNA

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Construção de biblioteca

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Sequenciamento

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Análise de dados

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Serviços pós-venda


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  • Bioinformática

    2(1)

    Eucariótico fluxo de trabalho de análise de sequenciamento de mRNA

    Bioinformática

    ØControle de qualidade de dados brutos

    ØAlinhamento do genoma de referência

    ØAnálise da estrutura da transcrição

    ØQuantificação de expressão

    ØAnálise de expressão diferencial

    ØAnotação e enriquecimento de funções

    1.Curva de saturação de dados de mRNA

    3(1)

    2.Análise de expressão diferencial - gráfico de vulcão

    4(1)

    3.Anotação KEGG em DEGs

    5(1)

    4.Classificação GO em DEGs

    6(1)

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