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Análise de associação em todo o genoma

Imagem em destaque da análise de associação de todo o genoma

O estudo de associação genômica ampla (GWAS) visa identificar variantes genéticas (genótipo) associadas a características específicas (fenótipo).O estudo GWAS investiga marcadores genéticos que cruzam todo o genoma de um grande número de indivíduos e prevê associações genótipo-fenótipo por meio de análise estatística em nível populacional.Tem sido amplamente aplicado em pesquisas sobre doenças humanas e na mineração de genes funcionais em características complexas de animais ou plantas.

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Detalhes do serviço

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1. Vantagens do serviço

● Casos de Projetos Abundantes: desde a sua criação em 2009, o BMKGENE concluiu centenas de projetos de espécies em pesquisas populacionais de GWAS, ajudou pesquisadores a publicar mais de 100 artigos, e o fator de impacto cumulativo atingiu 500.
● Analistas profissionais.
● Ciclo de análise curto.
● Mineração de dados precisa.

2. Especificações de serviço

Tipo	Escala Populacional	Estratégia e profundidade de sequenciamento
SLAF-GWAS	Número da amostra ≥200	Tamanho do genoma <400M, com ref-genoma, WGS é recomendado
		Tamanho do genoma ≤ 1G, 100K tags e 10X
		1G ≤ Tamanho do genoma ≤ 2G, 200 mil tags e 10X
		Tamanho do genoma > 2G, 300K Tags e 10X
WGS-GWAS	Número da amostra ≥200	10X para cada amostra

3. Seleção de materiais

Diferentes variedades, subespécies, raças locais/bancos de genes/famílias mistas/recursos silvestres

Diferentes variedades, subespécies, raças locais

Família de meio-irmão/família de irmão completo/recursos selvagens

4. Análise de Bioinformação

● Análise de associação em todo o genoma
● Análise e triagem de SNP significativos
● Anotação funcional do gene candidato

5. Fluxo de trabalho de serviço

Projeto de experimento

Entrega de amostra

Extração de RNA

Construção de biblioteca

Sequenciamento

Análise de dados

Serviços pós-venda

Anterior: Sequenciamento de RNA de núcleo único

Próximo:

a.CQ do fenótipo

Histograma de distribuição de frequência

Estatísticas de fenótipo

b.Análise de associação (Modelo: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

Gráfico QQ

Conspiração de Manhattan

Ano	Diário	IF	Título
2022	NC	17,69	Base genômica dos giga-cromossomos e giga-genoma da peônia da árvore Paeonia ostii
2015	NP	7,43	Pegadas de domesticação ancoram regiões genômicas de importância agronômica na soja
2018	MP	9h32	O resequenciamento do genoma completo de uma coleção mundial de acessos de colza revela a base genética de sua divergência de ecótipos
2022	HR	7.29	A análise de associação de todo o genoma fornece insights moleculares sobre a variação natural do tamanho da semente de melancia