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Sequenciamento Metagenômico (NGS)
Metagenoma refere-se a uma coleção de material genético total de uma comunidade mista de organismos, como metagenoma ambiental, metagenoma humano, etc. Ele contém genomas de microrganismos cultiváveis e não cultiváveis.O sequenciamento metagenômico é uma ferramenta molecular utilizada para analisar os materiais genômicos mistos extraídos de amostras ambientais, que fornece informações detalhadas sobre diversidade e abundância de espécies, estrutura populacional, relação filogenética, genes funcionais e rede de correlação com fatores ambientais.
Plataforma:Illumina NovaSeq6000
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Sequenciamento Metagenômico-Nanoporo
A metagenômica é uma ferramenta molecular usada para analisar os materiais genômicos mistos extraídos de amostras ambientais, que fornece informações detalhadas sobre diversidade e abundância de espécies, estrutura populacional, relação filogenética, genes funcionais e rede de correlação com fatores ambientais, etc. para estudos metagenômicos.Seu excelente desempenho em comprimento de leitura melhorou amplamente a análise metagenômica downstream, especialmente a montagem do metagenoma.Aproveitando as vantagens do comprimento de leitura, o estudo metagenômico baseado em Nanopore é capaz de obter uma montagem mais contínua em comparação com a metagenômica de espingarda.Foi publicado que a metagenômica baseada em nanoporos gerou com sucesso genomas bacterianos completos e fechados a partir de microbiomas (Moss, EL, et. al,Biotecnologia da Natureza, 2020)
Plataforma:Nanopore PromethION P48
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Sequenciamento de Amplicon 16S/18S/ITS-PacBio
A subunidade no rRNA 16S e 18S contendo regiões altamente conservadas e hipervariáveis é uma impressão digital molecular perfeita para identificação de organismos procarióticos e eucarióticos.Aproveitando o sequenciamento, esses amplicons podem ser direcionados com base nas partes conservadas e as regiões hipervariáveis podem ser totalmente caracterizadas para identificação microbiana contribuindo para estudos que abrangem análise de diversidade microbiana, taxonomia, filogenia, etc. Molécula única em tempo real (SMRT ) da plataforma PacBio permite obter leituras longas altamente precisas, que podem abranger amplicons de comprimento total (aprox. 1,5 Kb).A visão ampliada do campo genético melhorou muito a resolução na anotação de espécies na comunidade de bactérias ou fungos.
Plataforma:Sequência de PacBio II
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Sequenciamento de Amplicon 16S/18S/ITS-NGS
O sequenciamento de amplicon 16S/18S/ITS visa revelar filogenia, taxonomia e abundância de espécies em uma comunidade microbiana, investigando produtos de PCR de marcadores genéticos de manutenção que contêm partes altamente conversadas e hipervariáveis.A introdução dessas impressões digitais moleculares perfeitas por Woeses et al, (1977) capacita o perfil do microbioma sem isolamento.O sequenciamento de 16S (bactérias), 18S (fungos) e espaçador transcrito interno (ITS, fungos) permite a identificação tanto de espécies abundantes quanto de espécies raras e não identificadas.Essa tecnologia vem se tornando uma ferramenta amplamente aplicada e importante na identificação da composição microbiana diferencial em diversos ambientes, como boca humana, intestinos, fezes, etc.
Plataforma:Illumina NovaSeq6000
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Resequenciamento completo do genoma bacteriano e fúngico
O resequenciamento do genoma completo de bactérias e fungos é uma ferramenta crítica para completar os genomas de bactérias e fungos conhecidos, bem como para comparar vários genomas ou mapear genomas de novos organismos.É de grande importância sequenciar genomas inteiros de bactérias e fungos para gerar genomas de referência precisos, fazer identificação microbiana e outros estudos comparativos de genoma.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
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Genoma Fúngico
Biomarker Technologies fornece pesquisa de genoma, genoma fino e genoma pene-completo de fungos, dependendo do objetivo de pesquisa específico.O sequenciamento do genoma, a montagem e a anotação funcional podem ser obtidos combinando o sequenciamento de próxima geração + o sequenciamento de terceira geração para obter a montagem do genoma de alto nível.A tecnologia Hi-C também pode ser empregada para facilitar a montagem do genoma no nível do cromossomo.
Plataforma:Sequência de PacBio II
Nanopore PromethION P48
Illumina Nova Seq 6000
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Genoma Completo de Bactérias
A Biomarker Technologies fornece serviço de sequenciamento na construção do genoma completo de bactérias com zero gap.O fluxo de trabalho principal da construção completa do genoma de bactérias inclui sequenciamento de terceira geração, montagem, anotação funcional e análise bioinformática avançada, cumprindo objetivos de pesquisa específicos.Um perfil mais abrangente do genoma das bactérias permite a revelação de mecanismos fundamentais subjacentes aos seus processos biológicos, que também podem fornecer referências valiosas para pesquisas genômicas em espécies eucarióticas superiores
Plataforma:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
Sequência de PacBio II
