Sequenciamento de Bissulfito de Representação Reduzida (RRBS)
Especificações de serviço
Plataforma: plataforma NovaSeq, PE150
Tipo de biblioteca: biblioteca de DNA tratada com bissulfito com inserção de 200-400 pb
Estratégia de sequenciamento: Paired-End 150 pb
Recomendar saída de dados: 10 Gb de dados brutos/amostra
Requisitos de amostra
Quantidade de DNA: ≥ 2ug
Concentração de DNA:≥ 20ng/μl.
Pureza: OD260/280 = 1,8 a 2,0 sem degradação ou contaminação por RNA
Análise de bioinformática
Fluxo de trabalho de serviço
Entrega de amostra
Construção de biblioteca
Sequenciamento
Análise de dados
Serviços pós-venda
a.Estatísticas de alinhamento do genoma de referência
Estatísticas de leituras de mapeamento
Sestatísticas de profundidade de sequenciamento e cobertura do site C
Acobertura acumulada
Deficiência de digestão de cada amostra
b.Detecção de local de metilação
Lista de níveis de metilação no local C
BConversão S
Mcitosina etilada
Distribuição do nível de metilação
c.Mapa de metilação
Gem todo o enome
Gelemento enome
d.Comparação dos níveis de metilação entre amostras
PCorrelação airwise de metilação de CG
PMetilação CA-CG
Cbrilho da metilação CG
d.Análise diferencial de metilação
Sestatísticas de DMR
Distribuição de comprimento DMR
Hcomer mapa
DDistribuição de MR na região alvo
