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Sequenciamento de RNA pequeno-Illumina

Moléculas pequenas de RNA (sRNA), normalmente com menos de 200 nucleotídeos de comprimento, incluem microRNAs (miRNAs), pequenos RNAs interferentes (siRNAs) e RNAs que interagem com piwi (piRNAs).Entre estes, os miRNAs, com cerca de 20-24 nucleotídeos de comprimento, são particularmente notáveis ​​por seus papéis regulatórios essenciais em vários processos celulares.Com padrões de expressão específicos de tecido e de estágio, os miRNAs exibem alta conservação em diferentes espécies.

Plataforma: Illumina NovaSeq


Detalhes do serviço

Bioinformática

Resultados de demonstração

Publicações em destaque

Características

● Seleção do tamanho do RNA antes da preparação da biblioteca

● Análise bioinformática centrada na previsão de miRNA e seus alvos

Vantagens do serviço

Análise abrangente de bioinformática:permitindo a identificação de miRNAs novos e conhecidos, identificação de alvos de miRNAs e correspondente anotação funcional e enriquecimento com múltiplos bancos de dados (KEGG, GO)

Rigoroso controle de qualidade: implementamos pontos de controle centrais em todas as etapas, desde a preparação de amostras e bibliotecas até sequenciamento e bioinformática.Esse monitoramento meticuloso garante a entrega de resultados consistentemente de alta qualidade.

Suporte pós-venda: Nosso compromisso vai além da conclusão do projeto com um período de serviço pós-venda de 3 meses.Durante esse período, oferecemos acompanhamento do projeto, assistência na solução de problemas e sessões de perguntas e respostas para esclarecer quaisquer dúvidas relacionadas aos resultados.

Ampla experiência: com um histórico de fechamento bem-sucedido de vários projetos de sRNA cobrindo mais de 100 espécies em vários domínios de pesquisa, nossa equipe traz uma vasta experiência para cada projeto.

Requisitos de amostra e entrega

Biblioteca

Plataforma

Dados recomendados

Controle de qualidade de dados

Tamanho selecionado

Illumina SE50

10 milhões-20 milhões de leituras

Q30≥85%

Requisitos de amostra:

Nucleotídeos:

Conc.(ng/μl)

Quantidade (μg)

Pureza

Integridade

≥ 80

≥ 0,5

DO260/280=1,7-2,5

DO260/230=0,5-2,5

Contaminação limitada ou inexistente de proteínas ou DNA mostrada no gel.

RIN≥6,5;

5,0≥28S/18S≥1,0;

elevação limitada ou nenhuma elevação da linha de base

● Plantas:

Raiz, Caule ou Pétala: 450 mg

Folha ou Semente: 300 mg

Fruta: 1,2g

● Animal:

Coração ou Intestino: 450 mg

Vísceras ou Cérebro: 240 mg

Músculo: 600 mg

Ossos, Cabelo ou Pele: 1,5g

● Artrópodes:

Insetos: 9g

Crustáceos: 450 mg

● Sangue total: 2 tubos

● Células: 106 células

● Soro e Plasma:6ml

Entrega de amostra recomendada

Recipiente:
Tubo de centrífuga de 2 ml (folha de estanho não é recomendada)
Rotulagem da amostra: Grupo+réplica, por exemplo, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Envio:
1.Gelo seco: As amostras precisam ser embaladas em sacos e enterradas em gelo seco.
2.Tubos RNAstable: As amostras de RNA podem ser secas em tubo de estabilização de RNA (por exemplo, RNAstable®) e enviadas em temperatura ambiente.

Fluxo de trabalho de serviço

CQ de amostra

Projeto de experimento

entrega de amostra

Entrega de amostra

Experiência piloto

Extração de RNA

Preparação da Biblioteca

Construção de biblioteca

Sequenciamento

Sequenciamento

Análise de dados

Análise de dados

Serviços pós-venda

Serviços pós-venda


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    wps_doc_14

    Identificação de miRNA: estrutura e profundidade

     

     

     Estrutura-precursor-e-profundidade de sequenciamento de miRNA

     

    Expressão diferencial de miRNA – agrupamento hierárquico

    Foto 34

     

    Anotação funcional do alvo de miRNAs expressos diferencialmente

    35 fotos

    Explore os avanços da pesquisa facilitados pelos serviços de sequenciamento de sRNA da BMKGene por meio de uma coleção selecionada de publicações.

      

    Chen, H. et al.(2023) 'Infecções virais inibem a biossíntese e fotossíntese de saponinas em Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.

    Li, H. et al.(2023) 'A proteína FREE1 contendo o domínio FYVE da planta associa-se a componentes do microprocessador para reprimir a biogênese do miRNA', relatórios EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.

    Yu, J. et al.(2023) 'O MicroRNA Ame-Bantam-3p controla o desenvolvimento de pupas larvais visando o gene 8 de múltiplos domínios semelhantes ao fator de crescimento epidérmico (megf8) na abelha, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), p .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.

    Zhang, M. et al.(2018) 'Análise integrada de miRNA e genes associados à qualidade da carne revela que Gga-MiR-140-5p afeta a deposição de gordura intramuscular em galinhas', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), pp.doi: 10.1159/000489649.

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