Illumina și BGI
Caracteristici
●Platforme:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten și BGI-DNB-T7
●Moduri de secvențiere:PE50, PE100, PE150, PE250
●Controlul calității bibliotecilor înainte de secvențiere
●Secvențierea livrării datelor și QC:livrarea raportului QC și a datelor brute în format fastq după demultiplexarea și filtrarea citirilor Q30.
Avantajele serviciului
●Versatilitatea serviciilor de secvențiere:clientul poate alege să ordoneze după bandă, celulă de flux sau cantitatea de date.
●Versatilitatea platformelor:Bibliotecile DNB pot fi transferate pe platformele Illumina
●Experiență vastă pe platforma de secvențiere Illumina:cu mii de proiecte închise cu diverse specii.
●Livrarea raportului QC de secvențiere:cu metrici de calitate, acuratețea datelor și performanța generală a proiectului de secvențiere.
●Procesul de secvențiere matur:cu timp scurt de întoarcere.
●Control riguros al calității: implementăm cerințe stricte de control al calității pentru a garanta furnizarea de rezultate constant de înaltă calitate.
Cerințe pentru mostre*
Secvențierea parțială a benzii
| Cantitatea datelor (X) | Concentrație (qPCR/nM) | Volum |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
O singură bandă (Illumina)
| Platformă | Concentrație (qPCR/nM) | Volum |
| HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Pe lângă concentrație și cantitatea totală, este de asemenea necesar un model de vârf adecvat.
Vă rugăm să ne contactați dacă mostrele dvs. nu îndeplinesc cerințele privind materialul de pornire.
Fluxul de lucru al serviciului
Controlul calității bibliotecii
Secvențierea
Controlul calității datelor
Livrare de proiect
Raport QC bibliotecă
Un raport privind calitatea bibliotecii este furnizat înainte de secvențiere, evaluarea cantității bibliotecii și fragmentare.
Raport QC de secvențiere
Tabelul 1. Statistici privind secvențierea datelor.
| ID eșantion | BMKID | Citirile brute | Date brute (bp) | Citiri curate (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuția calității de-a lungul citirilor din fiecare probă
Figura 2. Distribuția conținutului de bază
Figura 3. Distribuția conținutului citit în datele de secvențiere
