BMKCloud Log in
条形banner-03

Produse

Secvențierea ADN/ARN – Sequencer Nanopore

Secvențierea ONT este o tehnologie de secvențiere a semnalului electric în timp real cu o singură moleculă bazată pe nanopori, principiul de secvențiere al fiecărei platforme este același.ADN/ARN dublu catenar se va lega de proteina nanoporoasă încorporată în biofilm și se va desfășura sub conducerea proteinei motorii, sub acțiunea diferenței de tensiune de pe ambele părți ale biofilmului, catenele de ADN/ARN trec prin proteina canalului nanopor la un anumit rată.Datorită diferențelor de proprietăți chimice ale diferitelor baze de pe catena ADN/ARN, atunci când o singură bază sau moleculă de ADN trece prin canalul nanoporului, va provoca schimbarea diferitelor semnale electrice.Prin detectarea și corespondența acestor semnale, pot fi calculate tipurile de bază corespunzătoare și poate fi finalizată detectarea în timp real a secvenței.


Detalii serviciu

Rezultat Demo

Detalii serviciu Caracteristici

Platformă

Dimensiunea bibliotecii

Randamentul teoretic al datelor (per celulă)

Precizie cu o singură bază

Aplicații

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, ultralung, cDNA-PCR

70-90 Gb/celulă

85-92%

Apelare SV, De novo, Secvențiere completă, Iso-Seq, Adnotare genă, Detectarea metilării ADN-ului

Avantajele serviciului

● Peste 5 ani de experiență pe platforma de secvențiere PacBio cu mii de proiecte închise cu diverse specii.
● BMKGENE este partener oficial al Oxford Nanopore, cu certificare ARN/ADN cu platformă duală.
● Există modele obișnuite de secvențiere cu echipament complet și un randament suficient de secvențiere.
● Pe baza platformei Nanopore, au fost publicate peste 10 cercetări Denovo pe animale și plante în reviste de renume internațional.

Cerințe pentru mostre


Tip eșantion

Cantitate

Concentrație (Qubit ®)

Volum

Puritate

Alții

ADN genomic

Depinde de cerințele de date

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Vârf clar la 260 nm, fără contaminări

Concentrația trebuie măsurată cu Qubit și Qubit/Nanopore ≤ 2

ARN total

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5;fara contaminari

Valoarea RIN ≥7,5

 

Fluxul de lucru al serviciului

pregătirea unei mostre

pregătirea unei mostre

Pregătirea bibliotecii

Construcția bibliotecii

Secvențierea

Secvențierea

Analiza datelor

Analiza datelor

Eșantion QC

Livrare de proiect


  • Anterior:
  • Următorul:

  • Evaluarea calității datelor a probei de ADN

    Tabelul 1. Statistici privind datele curate.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    curatN50Len

    curatN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Evaluarea calității datelor a probei de ARN

    Tabelul 1. Statistici privind datele curate.

    Nume de fișier

    ClientID

    ReadNum

    BaseNum

    N50

    Lungime medie

    Lungime maxima

    Scorul Q mediu

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Figura 1. Distribuția lungimii de citire

    A3

    Figura 2. Distribuția scorului de calitate al datelor curate

    A4

    Figura 3. Distribuția privind lungimea și scorul de calitate al datelor curate

    A5

    obține o cotație

    Scrie mesajul tău aici și trimite-l nouă

    Trimite-ne mesajul tau: