条形 Banner-03

Produse

Secvențiere ADN/ARN - secvențiator de nanopore

Secvențializarea ONT este o tehnologie de secvențiere a semnalului electric în timp real cu o singură moleculă bazată pe nanopore, principiul de secvențiere al fiecărei platforme este același. ADN/ARN dublu-catenar se va lega de proteina nanoporoasă încorporată în biofilm și de relaxare sub conducerea proteinei motorii, sub acțiunea diferenței de tensiune de la ambele părți ale biofilmului, catenele ADN/ARN trec prin proteina canalului nanopore la un anumit rata. Datorită diferențelor proprietăților chimice ale diferitelor baze de pe catena ADN/ARN, când o singură bază sau o moleculă de ADN trece prin canalul nanopore, aceasta va provoca schimbarea diferitelor semnale electrice. Prin detectarea și corespunzând acestor semnale, pot fi calculate tipurile de bază corespunzătoare, iar detectarea în timp real a secvenței poate fi finalizată.


Detalii privind serviciul

Rezultatul demo

Caracteristici despre detaliile serviciului

Platformă

Dimensiunea bibliotecii

Randament de date teoretice (pe celulă)

Precizie cu o singură bază

Aplicații

Nanopore

8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, ADNc-PCR

70-90 GB/celulă

85-92%

SV Calling, de Novo, secvențiere completă, ISO-seq, adnotare a genelor, detectarea metilării ADN-ului

Avantaje de serviciu

● Experiență de peste 5 ani pe platforma de secvențiere Pacbio cu mii de proiecte închise cu diverse specii.
● BMKGENE este un partener oficial al Oxford Nanopore, cu certificarea ARN/ADN cu platformă dublă.
● Există modele mainstream de secvențiere cu echipamente complete și de randament de secvențiere suficient.
● Pe baza platformei Nanopore, mai mult de 10 cercetări Denovo pentru animale și plante au fost publicate în reviste de renume internațional.

Cerințe de eșantion


Tip de eșantion

Cantitate

Concentrare (qubit ®)

Volum

Puritate

Alţii

ADN genomic

Depinde de cerința de date

 ≥20ng/µl

≥15 μL

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1.5 ;

Vârful clar la 260 nm , fără contaminări

Concentrația trebuie măsurată prin qubit și qubit/nanopore ≤ 2

ARN total

≥1.2μg

≥100 μg/µl

≥15 μL

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ; Fără contaminări

Valoarea RIN ≥7,5

 

Flux de lucru al serviciului

Pregătirea eșantionului

Pregătirea eșantionului

Pregătirea bibliotecii

Construcția bibliotecii

Secvențiere

Secvențiere

Analiza datelor

Analiza datelor

Eșantion QC

Livrarea proiectului


  • Anterior:
  • Următorul:

  • Evaluarea calității datelor eșantionului ADN

    Tabelul 1. Statistici privind datele curate.

    Bmkid

    Rawseqnum

    Rawsumbase

    Cleanseqnum

    curățare

    Cleann50Len

    CleanN90LEN

    CleanMeanlen

    CleanMaxlen

    CleanMeanqual

    ADNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Evaluarea calității datelor a eșantionului ARN

    Tabelul 1. Statistici privind datele curate.

    Nume de fișier

    ClientID

    Readnum

    BASENUM

    N50

    Lungime medie

    Lungime maximă

    MeanqScore

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Figura 1. Distribuția lungimii citite

    A3

    Figura 2. Distribuția scorului de calitate a datelor curate

    A4

    Figura 3. Distribuția de lungime și scor de calitate a datelor curate

    A5

    Obțineți un citat

    Scrieți -vă mesajul aici și trimiteți -ne

    Trimiteți -ne mesajul dvs.: