ØCu înaltă experiență: Peste 200.000 de probe au fost procesate în BMK, acoperind diverse tipuri de eșantioane, inclusiv culturi celulare, țesuturi, fluide corporale etc. și peste 7.000 de proiecte ARNm-Seq încheiate, acoperind diverse domenii de cercetare.
ØSistem strict de control al calității: punctele de bază de control al calității prin toate etapele, inclusiv pregătirea probelor, pregătirea bibliotecii, secvențierea și bioinformatica sunt monitorizate îndeaproape pentru a oferi rezultate de înaltă calitate.
ØMai multe baze de date disponibile pentru adnotarea funcției și studii de îmbogățire pentru a îndeplini diverse obiective de cercetare.
ØServicii post-vânzare: Servicii post-vânzare valabile 3 luni după finalizarea proiectului, inclusiv urmărirea proiectelor, depanarea, întrebările și răspunsurile rezultate, etc.
Bibliotecă | Strategia de secvențiere | Date recomandate | Control de calitate |
Poli A îmbogățit | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nucleotide:
Puritate | Integritate | Cantitate |
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Contaminare limitată sau lipsită de proteine sau ADN este indicată pe gel. | Pentru plante: RIN≥6,5;Pentru animale: RIN≥7;28S/18S≥1,0;denivelare de referință limitată sau deloc | Conc.≥30 ng/μl;Volum ≥ 10 μl;Total ≥ 1,5 μg |
Țesut: Greutate (uscat):≥1 g
*Pentru țesutul mai mic de 5 mg, vă recomandăm să trimiteți probă de țesut congelată rapid (în azot lichid).
Suspensie celulară:Număr de celule = 3×106- 1×107
*Recomandăm să expediați lizat de celule congelate.În cazul în care numărul celulelor este mai mic de 5×105, se recomandă congelarea rapidă în azot lichid, ceea ce este de preferat pentru microextracție.
Mostre de sânge:Volum ≥1 ml
Microorganism:Masa ≥ 1 g
Recipient: tub de centrifuga de 2 ml (nu este recomandata folie de cositor)
Etichetarea eșantionului: grup+replica de ex. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Expediere:
Bioinformatica
eucariote Fluxul de lucru al analizei secvențierii ARNm
Bioinformatica
ØControlul calității datelor brute
ØAlinierea genomului de referință
ØAnaliza structurii transcripției
ØCuantificarea expresiei
ØAnaliza expresiei diferențiale
ØAdnotare și îmbogățire a funcției
1.Curba de saturație a datelor ARNm
2.Analiza expresiei diferențiale-Graficul vulcanului
3.Adnotare KEGG pe DEG
4.Clasificarea GO pe DEG