Secvențiere lungă fără codificare-Illumina
Avantajele serviciului
●Analiza comună a ARNm și ARNlnc: prin combinarea cuantificării transcriptelor ARNm cu studiul lncRNA și țintele acestora, este posibil să obținem o imagine de ansamblu aprofundată a mecanismului de reglementare care stă la baza răspunsului celular.
●Expertiza extinsa: Echipa noastră aduce o bogată experiență fiecărui proiect, cu un istoric de procesare a peste 23.000 de mostre la BMK, care acoperă diverse tipuri de mostre și proiecte lncRNA.
●Control riguros al calității: Implementăm puncte de control de bază în toate etapele, de la pregătirea probelor și a bibliotecii până la secvențiere și bioinformatică. Această monitorizare meticuloasă asigură furnizarea de rezultate constant de înaltă calitate.
●Suport post-vânzare: Angajamentul nostru se extinde dincolo de finalizarea proiectului cu o perioadă de service post-vânzare de 3 luni. În acest timp, oferim urmărire a proiectului, asistență pentru depanare și sesiuni de întrebări și răspunsuri pentru a răspunde oricăror întrebări legate de rezultate.
Cerințe pentru mostre și livrare
| Bibliotecă | Platformă | Date recomandate | QC date |
| bibliotecă direcțională epuizată de ARNr | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nucleotide:
| Conc. (ng/μl) | Cantitate (μg) | Puritate | Integritate |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Contaminare limitată sau lipsită de proteine sau ADN este indicată pe gel. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; creștere limitată sau inexistentă |
● Plante:
Rădăcină, tulpină sau petală: 450 mg
Frunze sau semințe: 300 mg
Fructe: 1,2 g
● Animal:
Inima sau intestinul: 450 mg
Viscere sau creier: 240 mg
Muschi: 600 mg
Oasele, părul sau pielea: 1,5 g
● Artropode:
Insecte: 9 g
Crustacee: 450 mg
● Sânge integral:2 tuburi
● Celulele: 106 celule
● Ser si Plasma: 6 ml
Livrare recomandată de mostre
Recipient: tub de centrifuga de 2 ml (nu este recomandata folie de cositor)
Etichetarea eșantionului: Grup+replica de ex. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Expediere:
1. Gheață carbonică: Probele trebuie ambalate în saci și îngropate în gheață carbonică.
2. Tuburi ARNstable: Probele de ARN pot fi uscate în tub de stabilizare a ARN (de exemplu, RNAstable®) și expediate la temperatura camerei.
Fluxul de lucru al serviciului
Design experiment
Livrare mostre
extracția ARN
Construcția bibliotecii
Secvențierea
Analiza datelor
Servicii post-vânzare
Bioinformatica
Analiza expresiei genetice diferențiale (DEG).
Cuantificarea expresiei lncRNA – clustering
Îmbogățirea genelor țintă lncRNA
Analiza comună a ARNm și lncRNA - diagramă Circos (cercul din mijloc este ARNm și circuitul interior este ARNlc)
Explorați progresele facilitate de serviciile de ecvențiere lncRNA ale BMKGene printr-o colecție de publicații organizată.
Ji, H. şi colab. (2020) „Identificarea, predicția funcțională și verificarea cheie lncRNA a lncRNA-urilor legate de stresul rece în ficat de șobolani”, Rapoarte științifice 2020 10:1, 10 (1), pp. 1-14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. şi colab. (2021) „Analiza transcriptomică integrativă dezvăluie mecanismul imunitar pentru o tulpină de crap comun rezistentă la CyHV-3”, Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ şi colab. (2022) „Prioritizarea bazată pe integrarea multi-omică a rețelelor concurente de reglementare a ARN endogen în cancerul pulmonar cu celule mici: caracteristici moleculare și candidați la medicamente”, Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. şi colab. (2020) „Disecția genetică a rețelei de coexpresie genetică care stă la baza fotosintezei în Populus”, Plant Biotechnology Journal, 18 (4), pp. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. şi colab. (2022) „O rețea globală de reglementare pentru expresia genetică disregulată și semnalizarea metabolică anormală în celulele imune în micromediul bolii Graves și tiroidita lui Hashimoto”, Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
