Secvențiere de metatranscriptom
Caracteristici de serviciu
● Epuizarea ARNm urmată de pregătirea bibliotecii mRNA direcționale.
● Secvențiere pe Illumina Novaseq.
Avantaje de serviciu
●Studiați schimbările comunităților microbiene complexe:Acest lucru se întâmplă la nivel transcripțional și explorează potențiale gene noi.
●Explicarea interacțiunilor comunitare microbiene cu gazda sau mediul.
●Analiză bioinformatică cuprinzătoare: Aceasta oferă informații despre compozițiile taxonomice și funcționale ale comunității, precum și analiza diferenței de expresie a genelor.
●Adnotare extinsă a genelor:Utilizarea bazelor de date de funcții genice actualizate pentru informații informative despre expresia genelor ale comunităților microbiene.
●Suport post-vânzare:Angajamentul nostru se extinde dincolo de finalizarea proiectului cu o perioadă de serviciu după vânzare de 3 luni. În acest timp, oferim urmărirea proiectului, asistență de depanare și sesiuni de întrebări și întrebări pentru a aborda orice întrebări legate de rezultate.
Specificații de serviciu
| Platforma de secvențiere | Strategia de secvențiere | Date recomandate | Controlul calității datelor |
| Illumina Novaseq | PE150 | 12 GB | Q30≥85% |
Cerințe de eșantion
| Concentrație (Ng/µL) | Suma totală (µg) | Volum (pL) | OD260/280 | OD260/230 | Rin |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Flux de lucru de serviciu
Livrare de probe
Construcția bibliotecii
Secvențiere
Analiza datelor
Servicii după vânzare
Include următoarea analiză:
● Secvențializarea controlului calității datelor
● Ansamblu transcriere
● adnotare și abundență taxonomică
● adnotare funcțională și abundență
● Cuantificarea expresiei și analiza diferențială
Distribuția taxonomică a fiecărui eșantion:
Analiza diversității beta: Upgma
Adnotare funcțională - mergeți din abundență
Abundență de taxonomie diferențială - Lefse
Explorați avansările facilitate de serviciile de secvențiere Meta Transcriptomics de la BMKGENE printr -o colecție curată de publicații.
Lu, Z. și colab. (2023) „Toleranța la acidă a bacteriilor care utilizează lactatul bacteroidalelor de ordin contribuie la prevenirea acidozei ruminale la caprine adaptate la o dietă cu concentrat ridicat”,Nutriția animalelor, 14, p. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Song, Z. și colab. (2017) „Dezvăluirea microbiotei funcționale de bază în fermentația tradițională în stare solidă prin ampliconi cu randament ridicat și secvențiere cu metatranscriptomică”,Frontiere în microbiologie, 8 (iul). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/complet.
Wang, W. și colab. (2022) „Novele micovirusuri descoperite dintr -un sondaj cu metatranscriptomică a ciupercii alternative fitopatogene”,Virusuri, 14 (11), p. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.
Wei, J. și colab. (2022) „Analiza paralelă a metatranscriptomului relevă degradarea metaboliților secundari ai plantelor de către gândacii și simbolii lor intestinați”,Molecular Ecologie, 31 (15), p. 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.
