Repere
În acest webinar de două ore, este marea noastră onoare să am invitat șase experți în genomica culturilor.Vorbitorii noștri vor oferi o interpretare aprofundată a două studii genomice pe secară, care au fost publicate recent peGenetica naturii:
1. Ansamblul genomului la scară cromozomală oferă perspective asupra biologiei, evoluției și potențialul agronomic secară
2. Un ansamblu de genom de înaltă calitate evidențiază caracteristicile genomice ale secară și genele importante din punct de vedere agronomic
De asemenea, suntem bucuroși să avem un cercetător senior în cercetare și dezvoltare al Biomarker Technologies care să-și împărtășească experiența în asamblarea de novo a genomului.
Agendă
09:00 CET
Comentarii de bun venit
Zheng Hong-kun
Fondator și CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Președinte, Școala de Științe Agricole Avansate, Universitatea din Beijing
09:15
Îmbunătățirea îmbunătățirii secară, triticale și grâu prin utilizarea secvenței genomului de referință de înaltă calitate
În acest webinar, Prof. Wang ne-a oferit actualizări generale cu privire la starea actuală a cercetării genomice triticeae și a demonstrat succesul și progresele celor două lucrări remarcabile privind studiile genomului Rye, care au fost publicate recent pe Nature Genetics și prezintă întreaga cercetare. grupuri care conduc și contribuie la lucrări.
09:25
Genomica cerealelor @ IPK Gatesleben
Ierburile de cereale din tribul Triticeae au fost o sursă majoră de hrană în regiunile temperate, care a fost mult timp considerată ca un punct fierbinte în îmbunătățirea culturilor și înmulțirea.Dintre toate speciile cultivate, acest trib este renumit pentru caracteristicile lor genomice extrem de complexe, inclusiv dimensiuni mari ale genomului, conținut ridicat de TE, poliploidie etc. În această sesiune, prof. Nils Stein ne-a oferit o introducere generală despre IPK Gatesleben și starea actuală a cerealelor. cercetare genomică@IPK Gatesleben.
ora 09:35
Ansamblul genomului la scară cromozomală oferă informații despre biologia, evoluția și potențialul agronomic secară
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Institutul Leibniz de Genetică a Plantelor și Cercetarea Planurilor de Cultură (IPK)Secara (Secale cereale L.) este o cultură de cereale excepțional de rezistentă la climă, utilizată pe scară largă pentru a produce soiuri îmbunătățite de grâu prin hibridizare introgresivă și care posedă întregul repertoriu de gene necesare pentru a permite reproducerea hibridului.Secara este alogamă și doar recent domesticită, ceea ce oferă secarelor cultivate acces la un bazin genetic sălbatic divers și exploaabil.Pentru a îmbunătăți și mai mult potențialul agronomic al secară, am produs un ansamblu adnotat la scară cromozomală a genomului de secară de 7,9 Mbp și am validat pe larg calitatea acestuia folosind o suită de resurse genetice moleculare.Demonstrăm aplicațiile acestei resurse cu o gamă largă de investigații.Prezentăm constatări privind izolarea genetică incompletă a secară cultivată de rudele sălbatice, mecanismele de evoluție structurală a genomului, rezistența la patogeni, toleranța la temperatură scăzută, sistemele de control al fertilității pentru reproducerea hibridă și beneficiile de randament ale introgresiunilor secară-grâu.
ora 10:05
Un ansamblu genom de înaltă calitate evidențiază caracteristicile genomice ale secară și genele importante din punct de vedere agronomic
Secara este o cultură alimentară și furajeră valoroasă, o resursă genetică importantă pentru ameliorarea grâului și a triticalelor și un material indispensabil pentru studii eficiente de genomică comparativă la ierburi.Aici, am secvențiat genomul secară Weining, o varietate de elită chinezească de secară.Conturile asamblate (7,74 Gb) au reprezentat 98,47% din dimensiunea estimată a genomului (7,86 Gb), cu 93,67% din contig (7,25 Gb) alocați la șapte cromozomi.Elementele repetitive au constituit 90,31% din genomul asamblat.În comparație cu genomurile Triticeae secvențiate anterior, retrotranspozonii Daniela, Sumaya și Sumana au prezentat o expansiune puternică în secară.Analize ulterioare ale ansamblului Weining aruncă o nouă lumină asupra dublărilor genelor la nivelul întregului genom și asupra impactului lor asupra genelor de biosinteză a amidonului, organizărilor fizice ale locilor prolamină complexe, caracteristicilor de expresie genetică care stau la baza trăsăturii timpurii și regiunilor cromozomiale și loci presupuse asociate domesticirii din secară.Această secvență a genomului promite să accelereze studiile genomice și de reproducere a secară și a culturilor de cereale aferente.
ora 10:35
Provocări, soluții și viitor pentru asamblarea de novo a genomului
Genomul de înaltă calitate este baza studiului genomic.Deși dezvoltarea rapidă în secvențierea și algoritmul a împuternicit un ansamblu mult mai simplu și mai eficient al genomului, cerințele în ceea ce privește acuratețea și completitudinea asamblarii sunt, de asemenea, în creștere odată cu aprofundarea obiectivelor cercetării.În această discuție, voi discuta despre tehnologiile populare actuale în asamblarea genomului cu mai multe cazuri de succes și voi arunca o privire asupra dezvoltării viitoare.
Ora postării: 08-ian-2022