Secvențierea bisulfiților cu reprezentare redusă (RRBS)
Specificații de service
Platformă: platformă NovaSeq, PE150
Tip de bibliotecă: bibliotecă de ADN tratată cu bisulfit de inserție de 200-400 pb
Strategia de secvențiere: Paired-End 150 bp
Ieșire de date recomandată: 10 Gb date brute/eșantion
Cerințe pentru mostre
Cantitatea de ADN: ≥ 2ug
Concentrația ADN:≥ 20ng/μl.
Puritate: OD260/280 = 1,8 până la 2,0 fără degradare sau contaminare cu ARN
Analiza bioinformatică
Fluxul de lucru al serviciului
Livrare mostre
Construcția bibliotecii
Secvențierea
Analiza datelor
Servicii post-vânzare
a.Statistici de referință privind alinierea genomului
Statisticile citirilor de cartografiere
Statistică a adâncimii de secvențiere și a acoperirii site-ului C
Aacoperire acumulată
Deficiența digestiei fiecărei probe
b.Detectarea locului de metilare
Lista nivelurilor de metilare la locul C
Bconversie S
Mcitozină etilată
Distribuția nivelului de metilare
c.Harta de metilare
Gla nivel de enomă
Gelement enome
d.Compararea nivelurilor de metilare între probe
Pairwise Corelația metilării CG
PMetilarea CA-CG
Clustruirea metilării CG
d.Analiza metilării diferențiale
Statistica DMR
Distribuția lungimii DMR
Hmânca harta
DDistribuția MR în regiunea vizată
