Produse

Secvențierea ARN cu un singur nucleu

Progresul în captarea unei singure celule și tehnica de construcție a bibliotecii individuale, combinată cu secvențierea de înaltă performanță, permite studii de exprimare a genelor pe bază de celulă cu celulă.Permite o analiză a sistemului mai profundă și completă a populațiilor de celule complexe, în care evită în mare măsură mascarea eterogenității acestora, luând media tuturor celulelor.

Cu toate acestea, unele celule nu sunt potrivite pentru a fi transformate în suspensie unicelulară, așa că sunt necesare alte metode de preparare a probelor - extracția nucleului din țesuturi, adică nucleul este extras direct din țesuturi sau celulă și preparat în suspensie cu un singur nucleu pentru un singur nucleu. secvențierea celulelor.

BMK oferă un serviciu de secvențiere a ARN-ului unicelular bazat pe Genomics ChromiumTM.Acest serviciu a fost utilizat pe scară largă în studii privind studiile legate de boli, cum ar fi diferențierea celulelor imune, eterogenitatea tumorii, dezvoltarea țesuturilor etc.

Cip de transcriptom spațial: 10× Genomics

Platformă: Platforma Illumina NovaSeq

Contactaţi-ne

Detalii serviciu

Bioinformatica

Rezultate Demo

Principiul tehnic

Izolarea nucleelor este realizată de 10× Genomics ChromiumTM, care constă în sistem microfluidic cu opt canale cu încrucișări duble.În acest sistem, o picătură de gel cu coduri de bare și primer, enzime și un singur nucleu sunt încapsulate în picătură de ulei de mărimea unui nanolitru, generând Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Odată ce GEM sunt formate, liza celulară și eliberarea codurilor de bare sunt efectuate în fiecare GEM.ARNm sunt transcrise invers în molecule de ADNc cu coduri de bare de 10x și UMI, care sunt supuse în continuare construcției bibliotecii de secvențiere standard.

Țesutul nu este adecvat pentru prepararea suspensiei unicelulare

Celulă / țesut	Motiv
Țesut neproaspat congelat	Nu se pot obține organizații proaspete sau salvate de mult timp
Celulă musculară, megacariocite, grăsime...	Diametrul celulei este prea mare pentru a intra în instrument
Ficat…	Prea fragil pentru a fi spart, incapabil să distingă celulele individuale
Celula neuronală, creierul...	Mai sensibil, ușor de stresat, va schimba rezultatele secvențierii
Pancreas, tiroida...	Bogat în enzime endogene, care afectează producția de suspensie de celule unice

Un singur nucleu vs. o singură celulă

Un singur nucleu	Celulă unică
Diametru nelimitat al celulei	Diametrul celulei: 10-40 μm
Materialul poate fi țesut înghețat	Materialul trebuie să fie țesut proaspăt
Stresul scăzut al celulelor înghețate	Tratamentul cu enzime poate provoca reacții de stres celular
Nu trebuie îndepărtate celulele roșii din sânge	Celulele roșii din sânge trebuie îndepărtate
Nuclear exprimă bioinformații	Întreaga celulă exprimă bioinformații