BMKCloud Log in
条形banner-03

Продукты

Секвенирование ДНК/РНК – секвенатор нанопор

Секвенирование ONT — это технология секвенирования электрического сигнала в реальном времени для одной молекулы, основанная на нанопорах, принцип секвенирования на каждой платформе одинаков.Двухцепочечная ДНК/РНК будет связываться с нанопористым белком, встроенным в биопленку и раскручивающимся под руководством моторного белка, под действием разности потенциалов с обеих сторон биопленки нити ДНК/РНК проходят через белок канала нанопоры при определенном ставка.Из-за различий в химических свойствах различных оснований на цепи ДНК/РНК, когда одно основание или молекула ДНК проходит через канал нанопор, это вызывает изменение различных электрических сигналов.Обнаружив эти сигналы и соответствуя им, можно вычислить соответствующие базовые типы и завершить обнаружение последовательности в реальном времени.


Детали услуги

Демо-результат

Подробности об услуге

Платформа

Размер библиотеки

Теоретический выход данных (на ячейку)

Однобазовая точность

Приложения

Нанопор

8Кб, 10Кб, 20Кб, Сверхдлинный, кДНК-ПЦР

70-90Гб/ячейка

85-92%

Вызов SV, de novo, полноразмерное секвенирование, Iso-Seq, аннотация генов, обнаружение метилирования ДНК

Преимущества сервиса

● Более 5 лет опыта работы на платформе секвенирования PacBio с тысячами закрытых проектов с различными видами.
● BMKGENE является официальным партнером Oxford Nanopore, имеющим сертификацию двойной платформы РНК/ДНК.
● Существуют распространенные модели секвенаторов с полным оснащением и достаточной производительностью секвенирования.
● На основе платформы Nanopore более 10 исследований Denovo на животных и растениях были опубликованы в всемирно известных журналах.

Образцы требований


Тип образца

Количество

Концентрация (Кубит ®)

Объем

Чистота

Другие

Геномная ДНК

Зависит от требований к данным

 ≥20 нг/мкл

≥15 мкл

ОД260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Четкий пик при 260 нм, отсутствие примесей

Концентрацию необходимо измерять по кубиту и кубиту/нанопоре ≤ 2.

Общая РНК

≥1,2 мкг

≥100 мкг/мкл

≥15 мкл

ОД260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5;нет загрязнений

Значение РИН ≥7,5

 

Рабочий процесс обслуживания

Базовые приготовления

Базовые приготовления

Подготовка библиотеки

Строительство библиотеки

Последовательность действий

Последовательность действий

Анализ данных

Анализ данных

Образец контроля качества

Доставка проекта


  • Предыдущий:
  • Следующий:

  • Оценка качества данных образца ДНК

    Таблица 1. Статистика по чистым данным.

    БМКИД

    сыройSeqNum

    сырсумбасе

    ОчиститьSeqNum

    CleanSumBase

    очиститьN50Len

    очиститьN90Len

    CleanMeanLen

    чистыйМаксЛен

    CleanMeanQual

    ДНК_BMK01

    1 218 239

    26.37

    1 121 736

    25.90

    28 014

    15 764

    23 090

    143 181

    9

    Оценка качества данных образца РНК

    Таблица 1. Статистика по чистым данным.

    Имя файла

    ID клиента

    ReadNum

    Базенум

    Н50

    Средняя длина

    Максимальная длина

    Средний Qscore

    РНК_BMK001

    C2

    8 947 708

    4 047 230 083

    398

    452

    129 227

    Вопрос 12

    Рисунок 1. Распределение длины чтения

    А3

    Рисунок 2. Распределение показателей качества чистых данных

    А4

    Рисунок 3. Распределение показателей качества и длины чистых данных

    А5

    получить ценовое предложение

    Напишите здесь свое сообщение и отправьте его нам

    Отправьте нам сообщение: