Продукция

Секвенирование ДНК/РНК - секвенсор нанопора

Секвенирование ДНК/РНК - секвенсер нанопора показал изображение

Секвенирование ONT представляет собой одну молекулу электрического сигнала в реальном времени, основанная на нанопорах, принцип секвенирования каждой платформы одинаков. Двухцепочечная ДНК/РНК будет связываться с нанопористым белком, встроенным в биопленку, и разматываясь под свинцом моторного белка, при действии разности напряжений с обеих сторон биопленки, ДНК/РНК проходит через белок нанопоры в определенном ставка. Из -за различий химических свойств различных оснований на цепи ДНК/РНК, когда проходит одно основание или молекула ДНК через канал нанопор, это приведет к изменению различных электрических сигналов. Обнаруживая и соответствующую этим сигналам, можно рассчитать соответствующие типы базовых типов, и может быть завершено обнаружение последовательности в реальном времени.

Связаться с нами

Служба детали

Демо -результат

Служба сведения о функциях

Платформа	Размер библиотеки	Теоретические данные о выходе (на клетку)	Точность одно базы	Приложения
Нанопора	8 КБ, 10 КБ, 20 КБ, Ультралонг, кДНК-ПЦР	70-90 ГБ/ячейка	85-92%	SV Calling, de novo, полноразмерное секвенирование, Iso-seq, аннотация гена, обнаружение метилирования ДНК

Сервисные преимущества

● Более 5 лет опыта на платформе секвенирования Pacbio с тысячами закрытых проектов с различными видами.
● BMKGene является официальным партнером Oxford Nanopore, с сертификацией RNA/ДНК с двойной платформой.
● Существуют основные модели секвенсоров с полным оборудованием и достаточной пропускной способности секвенирования.
● На основании платформы Nanopore более 10 исследований животных и растений Деново были опубликованы в всемирно известных журналах.

Требования к выборке

Тип примера

Количество

Концентрация (QUBIT ®)

Объем

Чистота

Другие

Геномная ДНК

Зависеть от требований к данным

≥20 нг/мкл

≥15 мкл

OD260/280 = 1,7-2,2;

Od260/230≥1,5 ；

Чистый пик при 260 нм ， нет загрязнений

Концентрация должна быть измерена с помощью кубита и кубита/нанопор ≤ 2

Общая РНК

≥1,2 мкг

≥100 мкг/мкл

≥15 мкл

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ； Нет загрязнения

Значение RIN ≥7,5

Служба рабочего процесса

Приготовление образца

Библиотека строительство

Секвенирование

Анализ данных

Доставка проекта

Предыдущий: Illumina готовые библиотеки

Следующий: Секвенирование амплифицированного фрагмента специфического локуса (Slaf-seq)

Оценка качества данных образца ДНК

Таблица 1. Статистика по чистым данным.

BMKID	rawseqnum	Rawsumbase	Cleanseqnum	чистящий клятву	Clean50len	Cleann90len	CleanMeanlen	CleanMaxlen	CleanMeanqual
DNA_BMK01	1 218 239	26.37	1121 736	25,90	28 014	15 764	23 090	143,181	9

Оценка качества данных образца РНК

Таблица 1. Статистика по чистым данным.

Имя файла	ClientId	Риднум	Басенум	N50	Средняя длина	MaxLength	Средний QSCORE
RNA_BMK001	C2	8 947 708	4047 230 083	398	452	129 227	Q12