Полногеномный анализ ассоциаций
1. Преимущества обслуживания
● Множество проектов: с момента своего создания в 2009 году BMKGENE завершила сотни видовых проектов по популяционным исследованиям GWAS, помогла исследователям опубликовать более 100 статей, а совокупный импакт-фактор достиг 500.
● Профессиональные аналитики.
● Короткий цикл анализа.
● Точный анализ данных.
2. Спецификации услуг
| Тип | Масштаб населения | Стратегия и глубина секвенирования |
| ВСЛА-ГВАС | Номер образца ≥200 | Размер генома < 400 млн, с реф-геномом, рекомендуется WGS |
| Размер генома ≤ 1 ГБ, 100 тыс. тегов и 10X. | ||
| 1G ≤ Размер генома ≤ 2G, 200 тыс. тегов и 10X | ||
| Размер генома > 2G, 300 тыс. тегов и 10X | ||
| WGS-GWAS | Номер образца ≥200 | 10X для каждого образца |
3. Выбор материала
Различные сорта, подвиды, местные сорта/генные банки/смешанные семейства/дикие ресурсы
Различные сорта, подвиды, местные сорта
Полуродная семья/полнородная семья/дикие ресурсы
4. Биоинформационный анализ
● Полногеномный анализ ассоциаций.
● Анализ и проверка значимых SNP.
● Функциональная аннотация гена-кандидата.
5. Рабочий процесс обслуживания
Дизайн эксперимента
Доставка образца
экстракция РНК
Строительство библиотеки
Последовательность действий
Анализ данных
Послепродажное обслуживание
а.Фенотип КК
Гистограмма распределения частот
Статистика фенотипов
б.Анализ ассоциаций (модель: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
График QQ
Манхэттенский участок
| Год | Журнал | IF | Заголовок |
| 2022 год | NC | 17.69 | Геномная основа гигахромосом и гигагенома пиона древовидного Paeonia ostii |
| 2015 год | NP | 7.43 | Следы одомашнивания закрепляют геномные области, имеющие агрономическое значение в соевых бобах |
| 2018 год | MP | 9.32 | Полногеномное ресеквенирование мировой коллекции образцов рапса выявило генетическую основу дивергенции их экотипов |
| 2022 год | HR | 7.29 | Полногеномный анализ ассоциаций дает молекулярное представление о естественных вариациях размера семян арбуза. |
