-
Секвенирование иммунопреципитации хроматина (ChIP-seq)
ChIP-Seq обеспечивает полногеномное профилирование ДНК-мишеней для модификации гистонов, факторов транскрипции и других белков, связанных с ДНК.Он сочетает в себе селективность иммунопреципитации хроматина (ChIP) для восстановления специфических комплексов белок-ДНК с мощью секвенирования нового поколения (NGS) для высокопроизводительного секвенирования восстановленной ДНК.Кроме того, поскольку комплексы белок-ДНК извлекаются из живых клеток, места связывания можно сравнивать в разных типах клеток и тканях или в разных условиях.Область применения варьируется от регуляции транскрипции до путей развития, механизмов заболеваний и не только.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Метагеномное секвенирование -NGS
Метагеном относится к коллекции общего генетического материала смешанного сообщества организмов, такого как метагеном окружающей среды, метагеном человека и т. Д. Он содержит геномы как культивируемых, так и некультивируемых микроорганизмов.Метагеномное секвенирование — это молекулярный инструмент, используемый для анализа смешанных геномных материалов, извлеченных из образцов окружающей среды, который предоставляет подробную информацию о разнообразии и численности видов, структуре популяции, филогенетических отношениях, функциональных генах и сети корреляции с факторами окружающей среды.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Метагеномное секвенирование-нанопоры
Метагеномика — это молекулярный инструмент, используемый для анализа смешанных геномных материалов, извлеченных из образцов окружающей среды, который предоставляет подробную информацию о разнообразии и численности видов, структуре популяций, филогенетических отношениях, функциональных генах и сети корреляции с факторами окружающей среды и т. д. Недавно были представлены платформы секвенирования нанопор. к метагеномным исследованиям.Его выдающиеся характеристики по длине считывания значительно улучшили последующий метагеномный анализ, особенно сборку метагенома.Используя преимущества длины считывания, метагеномное исследование на основе нанопор позволяет добиться более непрерывной сборки по сравнению с метагеномикой дробовика.Было опубликовано, что метагеномика на основе нанопор успешно генерировала полные и закрытые бактериальные геномы из микробиомов (Moss, EL, et. al,Природные биотехнологии, 2020)
Платформа:Нанопор ПрометИОН P48
-
Полногеномное бисульфитное секвенирование
Метилирование ДНК в пятом положении цитозина (5-mC) оказывает фундаментальное влияние на экспрессию генов и клеточную активность.Аномальные модели метилирования связаны с несколькими состояниями и заболеваниями, такими как рак.WGBS стал золотым стандартом для изучения полногеномного метилирования с разрешением одного основания.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Анализ доступного для транспозазы хроматина с высокопроизводительным секвенированием (ATAC-seq)
ATAC-seq — это высокопроизводительный метод секвенирования для анализа доступности хроматина по всему геному, что важно для глобального эпигенетического контроля экспрессии генов.Адаптеры секвенирования встраиваются в открытые области хроматина с помощью гиперактивной транспозазы Tn5.После ПЦР-амплификации создается библиотека секвенирования.Все открытые области хроматина могут быть получены в определенных пространственно-временных условиях, а не только ограничены сайтами связывания транскрипционного фактора или определенной областью, модифицированной гистонами.
-
Секвенирование ампликонов 16S/18S/ITS-PacBio
Субъединица 16S и 18S рРНК, содержащая как высококонсервативные, так и гипервариабельные области, является идеальным молекулярным отпечатком для идентификации прокариотических и эукариотических организмов.Используя преимущества секвенирования, эти ампликоны могут быть нацелены на основе консервативных частей, а гипервариабельные области могут быть полностью охарактеризованы для микробной идентификации, что будет способствовать исследованиям, охватывающим анализ микробного разнообразия, таксономию, филогению и т. д. Одиночные молекулы в режиме реального времени (SMRT ) секвенирование платформы PacBio позволяет получать высокоточные длинные чтения, которые могут охватывать полноразмерные ампликоны (около 1,5 Кб).Расширение обзора генетического поля значительно повысило разрешение аннотаций видов в сообществе бактерий или грибов.
Платформа:ПакБио Продолжение II
-
Секвенирование ампликонов 16S/18S/ITS-NGS
Секвенирование ампликонов 16S/18S/ITS направлено на выявление филогении, таксономии и видового разнообразия в микробном сообществе путем исследования ПЦР-продуктов генетических маркеров домашнего хозяйства, которые содержат как высококонверсивные, так и гипервариабельные части.Введение этих идеальных молекулярных отпечатков пальцев Woeses et al (1977) дает возможность проводить профилирование микробиома без изоляции.Секвенирование 16S (бактерии), 18S (грибы) и внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS, грибы) позволяет идентифицировать как распространенные виды, так и редкие и неопознанные виды.Эта технология стала широко применяемым и основным инструментом для определения дифференцированного микробного состава в различных средах, таких как рот человека, кишечник, фекалии и т. д.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Повторное секвенирование полного генома бактерий и грибов
Полное секвенирование генома бактерий и грибов является важнейшим инструментом для завершения геномов известных бактерий и грибов, а также для сравнения нескольких геномов или картирования геномов новых организмов.Очень важно секвенировать полные геномы бактерий и грибов для создания точных эталонных геномов, идентификации микробов и других сравнительных исследований генома.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Полноразмерное секвенирование ампликонов PacBio 16S/18S/ITS
Платформа Amplicon (16S/18S/ITS) разработана с учетом многолетнего опыта в проектном анализе микробного разнообразия, который содержит стандартизированный базовый анализ и персонализированный анализ: базовый анализ охватывает основное содержание анализа текущих микробных исследований, содержание анализа является богатым и всеобъемлющим, а результаты анализа представляются в виде отчетов по проекту;Содержание персонализированного анализа разнообразно.Можно выбирать образцы и гибко устанавливать параметры в соответствии с базовым отчетом об анализе и целью исследования для реализации индивидуальных требований.Операционная система Windows, простая и быстрая.
-
Полноразмерный транскриптом PacBio (не эталонный)
Используя данные секвенирования изоформ Pacific Biosciences (PacBio) в качестве входных данных, это приложение способно идентифицировать полноразмерные последовательности транскриптов (без сборки).Путем сопоставления полноразмерных последовательностей с эталонным геномом можно оптимизировать транскрипты по известным генам, транскриптам, кодирующим областям и т. д. В этом случае можно достичь более точной идентификации структур мРНК, например, путем альтернативного сплайсинга и т. д.Совместный анализ с данными секвенирования транскриптома NGS обеспечивает более полную аннотацию и более точную количественную оценку экспрессии на уровне транскрипта, что в значительной степени приносит пользу последующей дифференциальной экспрессии и функциональному анализу.
-
Бисульфитное секвенирование с уменьшенным представлением (RRBS)
Исследования метилирования ДНК всегда были горячей темой в исследованиях заболеваний и тесно связаны с экспрессией генов и фенотипическими признаками.RRBS — это точный, эффективный и экономичный метод исследования метилирования ДНК.Обогащение областей промотора и CpG-островков путем ферментативного расщепления (Msp I) в сочетании с бисульфитным секвенированием обеспечивает обнаружение метилирования ДНК с высоким разрешением.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Секвенирование прокариотической мРНК
Секвенирование мРНК дает возможность комплексного профилирования всех транскриптов мРНК внутри клеток в определенных условиях.Эта передовая технология служит мощным инструментом, раскрывающим сложные профили экспрессии генов, генные структуры и молекулярные механизмы, связанные с разнообразными биологическими процессами.Секвенирование мРНК, широко используемое в фундаментальных исследованиях, клинической диагностике и разработке лекарств, позволяет глубже понять тонкости клеточной динамики и генетической регуляции.Наша обработка образцов прокариотической мРНК адаптирована для прокариотических транскриптомов, включая истощение рРНК и направленную подготовку библиотеки.
Платформа: Illumina NovaSeq X
