Бисульфитное секвенирование с уменьшенным представлением (RRBS)
Технические характеристики услуги
Платформа: платформа NovaSeq, PE150.
Тип библиотеки: Библиотека ДНК со вставками 200–400 пар оснований, обработанная бисульфитом.
Стратегия секвенирования: парный конец 150 п.н.
Рекомендуемый вывод данных: 10 ГБ необработанных данных/выборка.
Образцы требований
Количество ДНК: ≥ 2 мкг
Концентрация ДНК: ≥ 20 нг/мкл.
Чистота: OD260/280 = от 1,8 до 2,0 без деградации или загрязнения РНК.
Биоинформатический анализ
Рабочий процесс обслуживания
Доставка образца
Строительство библиотеки
Последовательность действий
Анализ данных
Послепродажное обслуживание
a.Эталонная статистика выравнивания геномов
Статистика картографических чтений
Sстатистика глубины секвенирования и покрытия сайта C
Aнакопленное покрытие
Dэффективность переваривания каждого образца
b.Обнаружение сайта метилирования
Список уровней метилирования в сайте C
BS-конверсия
Mэтилированный цитозин
Распределение уровней метилирования
c.Карта метилирования
Gвесь эном
Gэномный элемент
d.Сравнение уровней метилирования между образцами
Pпо воздуху Корреляция метилирования CG
PМетилирование CA-CG
Cблеск метилирования CG
d.Дифференциальный анализ метилирования
Sстатистика ПМР
Распределение длины DMR
Hесть карта
DРаспределение MR в целевом регионе
