16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
خدمتون خاصيتون
● تسلسل پليٽ فارم: PacBio Revio
● تسلسل جو طريقو: CCS (HiFi ريڊس)
● ھائي فائي SMRT گھنٽي لئبرري جي تياري کان اڳ ھدف واري علائقي جو واڌارو بعد ۾ amplicons جي ٽينڊم لنڪنگ
سروس فائدا
●اعلي ٽيڪنيڪي قرارداد: Tمختصر-amplicon تسلسل,نسلن جي سطح تي اعلي OTU درجه بندي جي شرح کي چالو ڪرڻ.
●انتهائي درست بنيادي ڪالنگ: PacBio CCS موڊ جي ترتيب (HiFi پڙهائي).
●اڪيلائي کان خالي: ماحولياتي نموني ۾ مائڪروبيل ساخت جي تيز سڃاڻپ.
●وڏي پيماني تي لاڳو: متنوع مائڪروبيل ڪميونٽي اڀياس.
●جامع حياتياتي معلوماتي تجزيو: جديد QIIME2 پئڪيج (مائڪروبيل ماحوليات ۾ مقداري بصيرت) ڊيٽابيس، تشريح، OTU/ASV جي لحاظ کان مختلف تجزين سان.
●وسيع ماهر: هر سال منعقد ٿيندڙ هزارين amplicon ترتيبن جي منصوبن سان، BMKGENE هڪ ڏهاڪي کان وڌيڪ تجربو، هڪ انتهائي ماهر تجزياتي ٽيم، جامع مواد، ۽ بهترين پوسٽ-سيلز سپورٽ آڻيندو آهي.
خدمت جي وضاحت
| لائبريري | تسلسل واري حڪمت عملي | سفارش ٿيل ڊيٽا |
| امپليڪون | PacBio Revio | 10/30/50 K ٽيگ (CCS) |
نموني جي گهرج
| ڪنسنٽريشن (ng/µL) | ڪل رقم (µg) | حجم (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
تجويز ڪيل نموني پهچائڻ
نموني کي 3-4 ڪلاڪن لاء مائع نائٽروجن ۾ منجمد ڪريو ۽ مائع نائيٽروجن يا -80 درجا ڊگھي مدت تائين محفوظ ڪريو. خشڪ برف سان نموني جي ترسيل گهربل آهي.
سروس ڪم فلو
نموني پهچائڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوء خدمتون
ھيٺ ڏنل تجزيو شامل آھي:
● خام ڊيٽا معيار ڪنٽرول
●OTU ڪلسترنگ/ڊي-شور (ASV)
●OTU تشريح
●Alpha diversity analysis: گھڻن انڊيڪسس، بشمول Shannon، Simpson ۽ ACE.
● بيٽا تنوع جو تجزيو
●انٽر گروپ تجزيو
● باضابطه تجزيو: ماحولياتي عنصر ۽ OUT ساخت ۽ تنوع جي وچ ۾
●16S فنڪشنل جين جي اڳڪٿي
ٽئڪسونومڪ ورڇ جو هسٽوگرام
ڪميونٽي جي تقسيم phylogenetic وڻ
الفا تنوع تجزيو: اي سي
انڊيڪس
بيٽا تنوع جو تجزيو: PCoA
بين الاقوامي گروپ تجزيو: ANOVA
BMKGene جي amplicon ترتيب ڏيڻ واري خدمتن پاران PacBio سان گڏ ڪيل پبليڪيشنز جي تيار ڪيل مجموعن ذريعي پيش رفت جي ڳولا ڪريو.
Gao, X. and Wang, H. (2023) 'الپائن ميرينو رڍن ۾ الپائن ميرينو رڍن جي ٻن وڌندڙ مرحلن سان مختلف فينولوجي جي موافقت دوران رومن بيڪٽيريل پروفائلز ۽ افعال جو تقابلي تجزيو'، فرمينٽيشن، 9( 1)، ص. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
لي، ايس وغيره. (2023) 'Capturing the microbial Dark Matter in desert soils using culturomics-based metagenomics and high-resolution analysis', npj Biofilms and Microbiomes 2023 9:1, 9(1), pp. 1-14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu، L. et al. (2022) 'فيٽي ايسڊ سالٽس جا اثر خمير جي خاصيتن تي، بيڪٽيريل تنوع ۽ الفالفا، چانورن جي پٽي ۽ ڪڻڪ جي بران سان تيار ڪيل مخلوط سائليج جي ايروبڪ استحڪام'، جرنل آف دي سائنس آف فوڊ اينڊ ايگريڪلچر، 102(4)، پي پي. 1475- 1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
يانگ، جي وغيره. (2023) آڪسائيڊيوٽ اسٽريس بائيو مارڪرز ۽ گٽ مائڪروبيوٽا جي وچ ۾ تعامل انٽي آڪسائيڊٽ اثرات ۾ سونچس برچيوٽس ڊي سي مان نڪتل نڪتل اثرن ۾. بالغ زيبرا فش ۾ Oxazolone-Induced Intestinal Oxidative Stress in Adult Zebrafish'، Antioxidants 2023، Vol. 12، صفحو 192، 12 (1)، ص. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
