مصنوعات

*هتي ڏيکاريل ڊيمو نتيجا سڀ بايو مارڪر ٽيڪنالاجيز سان شايع ٿيل جينومز مان آهن.

1. LTR داخل ڪرڻ جي وقت جو اندازو: انگ اکر ٻين نسلن جي مقابلي ۾، ويننگ رائي جينوم ۾ LTR-RTs داخل ڪرڻ جي وقت ۾ هڪ منفرد بائي موڊل تقسيم ڏيکاري ٿو. سڀ کان تازو چوٽي تقريباً 0.5 ملين سال اڳ ظاهر ٿيو.

لي گوانگ ۽ ٻيا،فطرت جينياتيات، 2021

2. چيوٽ (سيچيم ايڊول) تي فائيلوجيني ۽ جين فيملي جو تجزيو: جين فيملي ۾ چيوٽ ۽ ٻين 13 لاڳاپيل جنسن جو تجزيو ڪندي، چيوٽ کي سانپ جي ڪدو (ٽرائڪوسانٿيس اينگوينا) سان تمام گهڻو ويجهڙائي سان لاڳاپيل مليو. چيوٽ تقريباً 27-45 مايا ۾ سانپ جي ڪدو مان نڪتل هو ۽ پوري جينوم جي نقل (WGD) 25±4 مايا ۾ چيوٽ ۾ ڏٺي وئي، جيڪا ڪڪوئيبيٽيسي ۾ ٽيون WGD واقعو آهي.

فو اي ۽ ٻيا،باغباني جي تحقيق، 2021

3. سنٽيني تجزيو: ميوي جي واڌ ويجهه ۾ فائٽو هارمونز سان لاڳاپيل ڪجهه جين چيوٽ، سانپ گورڊ ۽ اسڪواش ۾ مليا. چيوٽ ۽ اسڪواش جي وچ ۾ لاڳاپو چيوٽ ۽ سانپ گورڊ جي وچ ۾ ٿورو وڌيڪ آهي.

فو اي ۽ ٻيا،باغباني جي تحقيق، 2021

4. جين فيملي تجزيو: G.thurberi ۽ G.davidsonii جينوم ۾ جين فيملي جي توسيع ۽ سنڪچن تي KEGG افزودگي ڏيکاري ٿي ته اسٽيرائيڊ بايو سنٿيسس ۽ براسينوسٽرائيڊ بايو سنٿيسس سان لاڳاپيل جين کي وڌايو ويو.

يانگ زي ۽ ٻيا،بي ايم سي حياتيات، 2021

5. پوري جينوم جي نقل جو تجزيو: 4DTV ۽ Ks جي تقسيم جي تجزيي ۾ پوري جينوم جي نقل جو واقعو ڏيکاريو ويو. نسلن جي چوٽين ۾ نسلن جي چوٽين ۾ نسلن جي واقعن کي ڏيکاريو ويو. تجزيي مان ظاهر ٿيو ته ٻين ٽن ويجهي لاڳاپيل نسلن جي مقابلي ۾، O. europaea تازو ئي وڏي پيماني تي جين جي نقل مان گذريو.

رائو جي ۽ ٻيا،باغباني جي تحقيق، 2021

بي ايم ڪي ڪيس

گلاب بغير ڪانٽي جي: جينومڪ بصيرت نمي جي موافقت سان ڳنڍيل آهي

شايع ٿيل: قومي سائنس جو جائزو، 2021

ترتيب ڏيڻ جي حڪمت عملي:

'باسي جي'ڪانٽو کان سواءِ' (آر.وچورينان) جينوم:
تقريبن 93 X پيڪ بائيو + تقريبن 90 X نانوپور + 267 X ايلومينا

اهم نتيجا

1. اعليٰ معيار جو R.wichuraiana جينوم ڊگهي پڙهڻ واري ترتيب جي طريقن کي استعمال ڪندي ٺاهيو ويو، جيڪو 530.07 Mb جي اسيمبلي پيدا ڪري ٿو (انداز ڪيل جينوم سائيز فلو سائٽوميٽري طرفان تقريبن 525.9 Mb ۽ جينوم سروي پاران 525.5 هو؛ هيٽروزيگوسٽي تقريبن 1.03٪ هئي). BUSCO جو اندازو لڳايو ويو اسڪور 93.9٪ هو. "اولڊ بلش" (haploOB) سان مقابلو ڪندي، هن جينوم جي معيار ۽ مڪمل ٿيڻ جي تصديق بنيادي سنگل بيس درستگي ۽ LTR اسيمبلي انڊيڪس (LAI=20.03) ذريعي ڪئي وئي. R.wichuraiana جينوم ۾ 32,674 پروٽين ڪوڊنگ جين شامل آهن.

2. ملٽي اومڪس جوائنٽ تجزيو، جنهن ۾ تقابلي جينومڪس، ٽرانسڪرپٽومڪس، جينياتي آبادي جو QTL تجزيو شامل آهي، آر. وچوريانا ۽ روزا چينينسس جي وچ ۾ اهم اسپيسيئيشن کي ظاهر ڪيو. ان کان علاوه، QTL ۾ لاڳاپيل جين جي اظهار جي تبديلي اسٽيم پرڪل پيٽرننگ سان لاڳاپيل هجڻ جو امڪان هو.

بيسي جي ٿورن لیس ۽ روزا چائنينسس جي وچ ۾ تقابلي جينومڪس تجزيو، جنهن ۾ سنٽيني تجزيو، جين فيملي ڪلسٽر، توسيع ۽ سنڪچن جو تجزيو شامل آهي، وڏي تعداد ۾ تبديليون ظاهر ڪيون، جيڪي گلاب ۾ اهم خاصيتن سان لاڳاپيل هيون. NAC ۽ FAR1/FRS جين فيملي ۾ منفرد توسيع جو امڪان ڪارو داغ جي مزاحمت سان لاڳاپيل هو.

ژونگ، ايم.، وغيره. "گلاب کان سواءِ ڪانٽو: جينومڪ بصيرت نمي جي موافقت سان ڳنڍيل آهي"قومي سائنس جو جائزو، 2021؛، nwab092.