Eukaryotic mRNA تسلسل-Illumina
فائدا
Øاعليٰ تجربيڪار: BMK ۾ 200,000 کان وڌيڪ نمونن تي عمل ڪيو ويو آھي جيڪي مختلف نمونن جي قسمن کي ڍڪيندا آھن، جن ۾ سيل ڪلچر، ٽشو، باڊي فلوئڊ وغيره شامل آھن ۽ 7,000 کان وڌيڪ mRNA-Seq منصوبا بند ڪيا ويا آھن جيڪي مختلف تحقيقي علائقن کي ڍڪيندا آھن.
Øسخت معيار جي ڪنٽرول سسٽم: سڀني مرحلن ذريعي بنيادي معيار ڪنٽرول پوائنٽون شامل آهن نموني جي تياري، لائبريري جي تياري، ترتيب ۽ بايو انفارميٽڪس اعلي معيار جي نتيجن کي پهچائڻ لاء ويجهي نگراني هيٺ آهن.
Øگھڻا ڊيٽابيس موجود آھن فنڪشن جي تشريح ۽ افزودگي جي مطالعي لاءِ مختلف تحقيقي مقصدن کي پورو ڪرڻ لاءِ.
Øبعد ۾ وڪري جون خدمتون: پراجيڪٽ جي مڪمل ٿيڻ تي 3 مهينن لاءِ صحيح وڪري کان پوءِ خدمتون، بشمول پروجيڪٽ جي پيروي ڪرڻ، مشڪلاتن جي شوٽنگ، نتيجا سوال ۽ جواب وغيره.
نموني جي گهرج ۽ پهچائڻ
| لئبرري | ترتيب واري حڪمت عملي | سفارش ٿيل ڊيٽا | معيار تي ضابطو |
| پولي الف کي وڌايو | Illumina PE150 | 6 جي بي | Q30≥85% |
نموني جي گهرج:
نيوڪليوٽائيڊس:
| پاڪائي | سالميت | رقم |
| OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5جيل تي ڏيکاريل محدود يا ڪو پروٽين يا ڊي اين اي آلودگي. | ٻوٽن لاءِ: RIN≥6.5؛ جانورن لاءِ: RIN≥7؛ 28S/18S≥1.0؛ محدود يا بي بنياد بلندي | Conc.≥30 ng/μl؛حجم ≥ 10 μl؛ڪل ≥ 1.5 μg |
ٽشو: وزن (خشڪ):≥1 جي
*5 mg کان ننڍي ٽشوز لاءِ، اسان سفارش ڪريون ٿا ته فليش منجمد (مائع نائٽروجن ۾) ٽشو نموني موڪليو.
سيل معطلي:سيل ڳڻپ = 3 × 106- 1×107
* اسان کي منجمد سيل lysate موڪلڻ جي صلاح.ان صورت ۾ ته سيل 5 × 105 کان ننڍو ٿئي ٿو، فليش کي مائع نائيٽروجن ۾ منجمد ڪرڻ جي سفارش ڪئي وئي آهي، جيڪا مائڪرو ڪڍڻ لاء ترجيح آهي.
رت جا نمونا:حجم ≥1 ml
مائڪروجنزم:ماس ≥ 1 گ
تجويز ڪيل نموني پهچائڻ
ڪنٽينر: 2 ml سينٽرفيوج ٽيوب (ٽين ورق جي سفارش نه ڪئي وئي آهي)
نموني ليبلنگ: گروپ + نقل ڪريو مثال طور A1، A2، A3؛B1, B2, B3...
ترسيل:
- خشڪ برف: نمونن کي بيگز ۾ ڀريل ۽ خشڪ برف ۾ دفن ڪرڻ جي ضرورت آهي.
- آر اين اي اسٽيبل ٽيوب: آر اين اي جا نمونا آر اين اي اسٽيبلائيزيشن ٽيوب (مثال طور RNAstable®) ۾ خشڪ ٿي سگهن ٿا ۽ ڪمري جي حرارت تي موڪليا وڃن ٿا.
سروس ڪم فلو
تجربو ڊيزائن
نموني پهچائڻ
آر اين اي ڪڍڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوء خدمتون
بايو انفارميٽڪس
يوڪريوٽڪ mRNA تسلسل تجزيو ڪم فلو
بايو انفارميٽڪس
Øخام ڊيٽا معيار ڪنٽرول
Øحوالو جينوم جي ترتيب
Øنقل جي جوڙجڪ جو تجزيو
Øاظهار جي مقدار
Øاختلافي اظهار جو تجزيو
Øفنڪشن تشريح ۽ افزودگي
1.mRNA ڊيٽا سنترپت وکر
2.اختلافي اظهار جو تجزيو- آتش فشاني پلاٽ
3.DEGs تي KEGG تشريح
4.DEGs تي GO درجه بندي
