-
Metagenomic تسلسل (NGS)
Metagenome مان مراد جاندارن جي مخلوط برادري جي ڪل جينياتي مواد جو مجموعو آهي، جهڙوڪ ماحولياتي ميٽاگينوم، انساني ميٽاگينوم وغيره. ان ۾ پوکڻ جي قابل ۽ غير پوکيل جاندارن جي جينوم شامل آهن.Metagenomic sequencing هڪ ماليڪيولر ٽول آهي جيڪو ماحولياتي نمونن مان نڪتل مخلوط جينومڪ مواد جو تجزيو ڪرڻ لاءِ استعمال ڪيو ويندو آهي، جيڪو تفصيلي معلومات مهيا ڪري ٿو نسلن جي تنوع ۽ ڪثرت، آبادي جي جوڙجڪ، فيلوجينيٽڪ لاڳاپن، فنڪشنل جينز ۽ ماحولياتي عنصرن سان رابطي واري نيٽ ورڪ ۾.
پليٽ فارم:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic تسلسل-نانوپور
Metagenomics هڪ ماليڪيولر اوزار آهي جيڪو ماحولياتي نموني مان نڪتل مخلوط جينومڪ مواد جو تجزيو ڪرڻ لاءِ استعمال ڪيو ويندو آهي، جيڪو تفصيلي معلومات مهيا ڪري ٿو نسلن جي تنوع ۽ ڪثرت، آبادي جي جوڙجڪ، فيلوجينيٽڪ رشتي، فنڪشنل جينز ۽ ماحولياتي عنصرن سان رابطي واري نيٽ ورڪ وغيره. نانوپور ترتيب ڏيڻ واري پليٽ فارم تازو متعارف ڪرايو آهي. metagenomic اڀياس لاء.پڙهڻ جي ڊيگهه ۾ ان جي شاندار ڪارڪردگي وڏي پيماني تي وڌايو ويو هيٺيون وهڪرو metagenomic تجزيو، خاص طور تي ميٽگينوم اسيمبلي.پڙهڻ جي ڊگھائي جا فائدا کڻڻ، نانوپور جي بنياد تي ميٽيگينومڪ مطالعي کي شاٽ گن ميٽاگينومڪس جي مقابلي ۾ وڌيڪ مسلسل اسيمبلي حاصل ڪرڻ جي قابل آهي.اهو شايع ڪيو ويو آهي ته نانوپور جي بنياد تي ميٽاگينومڪس ڪاميابيء سان مڪمل ۽ بند ٿيل بيڪٽيريا جينوم مائڪروبيومس (Moss، EL، et. al.فطرت بايوٽيڪ، 2020)
پليٽ فارم:نانوپور PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S ۽ 18S rRNA تي سبيونٽ ٻنهي انتهائي محفوظ ۽ هائپر متغير علائقن تي مشتمل آهي پراڪاريوٽڪ ۽ يوڪريوٽڪ جاندارن جي سڃاڻپ لاءِ هڪ ڀرپور ماليڪيولر فنگر پرنٽ آهي.ترتيب ڏيڻ جو فائدو وٺندي، انهن amplicons کي محفوظ حصن جي بنياد تي نشانو بڻائي سگهجي ٿو ۽ هائپر-متغير علائقن کي مڪمل طور تي خاص ڪري سگهجي ٿو مائڪروبيل شناخت لاءِ حصو وٺندڙ مطالعي ۾ مائڪروبيل تنوع جي تجزيي، ٽيڪسونومي، فائيلوجني وغيره. سنگل ماليڪيول ريئل ٽائيم (SMRT ) PacBio پليٽ فارم جي ترتيب انتهائي درست ڊگھي ريڊز حاصل ڪرڻ جي قابل بنائي ٿي، جيڪا پوري ڊگھائي amplicons (تقريبن 1.5 Kb) کي ڍڪي سگھي ٿي.جينياتي فيلڊ جي وسيع نظر کي بيڪٽيريا يا فنگي ڪميونٽي ۾ نسلن جي تشريح ۾ قرارداد کي تمام گهڻو وڌايو.
پليٽ فارم:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing جو مقصد آھي phylogeny, taxonomy, and species experience in a microbial community ۾ تحقيق ڪندي PCR پروڊڪٽس جي گھر جي سنڀال جينياتي نشانن جي جن ۾ تمام گھڻيون ڳالھيون ۽ ھائيپر ويريبل حصا شامل آھن.Woeses et al، (1977) پاران انهن مڪمل ماليڪيولر فنگر پرنٽ جو تعارف اڪيلائي کان آزاد مائڪروبيوم پروفائلنگ کي طاقت ڏئي ٿو.16S (بيڪٽيريا)، 18S (فنگي) ۽ اندروني ٽرانسڪرپٽ اسپيسر (ITS، فنگس) جي ترتيب ڏيڻ سان گڏو گڏ ناياب ۽ اڻ سڃاتل نسلن جي سڃاڻپ جي اجازت ڏئي ٿي.هي ٽيڪنالاجي هڪ وڏي پيماني تي لاڳو ٿيل ۽ اهم اوزار بڻجي چڪي آهي مختلف ماحول ۾ مختلف مائڪروبيل مرکب جي سڃاڻپ ڪرڻ ۾، جهڙوڪ انساني وات، اندريون، مٽي وغيره.
پليٽ فارم:Illumina NovaSeq6000
-
بيڪٽيريا ۽ فنگل سڄو جينوم ٻيهر ترتيب ڏيڻ
بيڪٽيريا ۽ فنگل پوري جينوم جي ٻيهر ترتيب ڏيڻ هڪ اهم اوزار آهي معلوم ٿيل بيڪٽيريا ۽ فنگس جي جينوم کي مڪمل ڪرڻ لاءِ، انهي سان گڏ ڪيترن ئي جينوم جو مقابلو ڪرڻ يا نئين جاندارن جي جينوم کي نقشي ڪرڻ لاءِ.اهو تمام ضروري آهي ته بيڪٽيريا ۽ فنگي جي سڄي جينوم کي ترتيب ڏيڻ لاء صحيح حوالو جينوم پيدا ڪرڻ لاء، مائڪروبيل جي سڃاڻپ ڪرڻ ۽ ٻين تقابلي جينوم اڀياس ڪرڻ لاء.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
فنگل جينوم
بائيو مارڪر ٽيڪنالاجيون مهيا ڪن ٿيون جينوم سروي، ٺيڪ جينوم ۽ فنگل جي مڪمل جينوم مخصوص تحقيق جي مقصد تي منحصر آهي.جينوم جي ترتيب، اسيمبلي ۽ فنڪشنل تشريح کي گڏ ڪري حاصل ڪري سگهجي ٿو ايندڙ نسل جي ترتيب + ٽئين نسل جي ترتيب کي اعلي سطحي جينوم اسيمبلي حاصل ڪرڻ لاء.ڪروموزوم سطح تي جينوم اسيمبليءَ کي آسان ڪرڻ لاءِ هاءِ-سي ٽيڪنالاجي پڻ استعمال ڪري سگهجي ٿي.
پليٽ فارم:PacBio Sequel II
نانوپور PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
بيڪٽيريا مڪمل جينوم
بائيو مارڪر ٽيڪنالاجيز صفر خال سان بيڪٽيريا جي مڪمل جينوم جي تعمير تي ترتيب ڏيڻ جي خدمت مهيا ڪري ٿي.بيڪٽيريا جي مکيه ڪم جي فلو مڪمل جينوم جي تعمير ۾ شامل آهي ٽين نسل جي ترتيب، اسيمبلي، فنڪشنل تشريح ۽ ترقي يافته بايو انفارميٽيڪل تجزيو مخصوص تحقيق جي مقصدن کي پورو ڪرڻ.بيڪٽيريا جينوم جي وڌيڪ جامع پروفائيلنگ انهن جي حياتياتي عملن جي بنيادي ميکانيزم کي ظاهر ڪرڻ جي طاقت ڏئي ٿي، جيڪي اعلي يوڪريوٽڪ نسلن ۾ جينوميڪ تحقيق لاء قيمتي حوالو پڻ مهيا ڪري سگھن ٿا.
پليٽ فارم:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
