Metagenomic تسلسل-نانوپور
سروس فائدا
● اعلي معيار جي اسيمبلي- نسلن جي سڃاڻپ ۽ فنڪشنل جين جي اڳڪٿي جي درستگي کي وڌائڻ
● بند ٿيل بيڪٽيريا جينوم آئسوليشن
● متنوع علائقن ۾ وڌيڪ طاقتور ۽ قابل اعتماد ايپليڪيشن، مثال طور pathogenic microorganisms يا اينٽي بايوٽڪ مزاحمت سان لاڳاپيل جينز جي ڳولا
● تقابلي metagenome تجزيو
خدمت جي وضاحت
| پليٽ فارم | تسلسل | سفارش ٿيل ڊيٽا | ڦيرڦار جو وقت |
| نانوپور | او اين ٽي | 6 جي / 10 جي | 65 ڪم ڏينهن |
بايو انفارميٽڪس تجزيا
● خام ڊيٽا معيار ڪنٽرول
● Metagenome اسيمبلي
● غير فالتو جين سيٽ ۽ تشريح
● نسلن جي تنوع جو تجزيو
● جينياتي فنڪشن تنوع تجزيو
● بين الاقوامي گروپ تجزيو
● تجرباتي عوامل جي خلاف انجمن جو تجزيو
نموني جي گهرج ۽ پهچائڻ
نموني گهرجون ۽ پهچائڻ
نموني جي گهرج:
لاءِڊي اين اي ڪڍڻ:
| نموني جو قسم | رقم | توجهه | پاڪائي |
| ڊي اين اي ڪڍڻ | 1-1.5 μg | > 20 ng/μl | OD260/280 = 1.6-2.5 |
ماحولياتي نموني لاء:
| نموني جو قسم | تجويز ڪيل نموني جي طريقيڪار |
| مٽي | نموني جي رقم: تقريبن.5 گ؛باقي سڪل مادي کي سطح تان هٽائڻ جي ضرورت آهي؛وڏن ٽڪرن کي پيس ۽ 2 ملي ايم فلٽر ذريعي گذريو؛محفوظ ڪرڻ لاءِ sterile EP-tube يا cyrotube ۾ عليڪوٽ جا نمونا. |
| وات | نموني جي رقم: تقريبن.5 گ؛گڏ ڪريو ۽ aliquot جا نمونا sterile EP-tube يا cryotube ۾ محفوظ ڪرڻ لاءِ. |
| آنت جو مواد | نمونن تي عمل ڪرڻ جي ضرورت آهي aseptic حالت ۾.گڏ ٿيل ٽشو کي PBS سان ڌوئڻ؛PBS کي سينٽريفيوج ڪريو ۽ EP-ٽيوب ۾ اڳڪٿي ڪندڙ گڏ ڪريو. |
| ڪچرو | نموني جي رقم: تقريبن.5 گ؛گڏ ڪريو ۽ aliquot سلج جو نمونو sterile EP-tube يا cryotube ۾ محفوظ ڪرڻ لاء |
| پاڻي وارو | مائڪروبيل جي محدود مقدار سان نموني لاءِ، جهڙوڪ نل جو پاڻي، کوهه جو پاڻي، وغيره، گهٽ ۾ گهٽ 1 L پاڻي گڏ ڪريو ۽ 0.22 μm فلٽر مان گذريو ته جيئن جھلي تي مائڪروبيل کي بهتر بڻائي سگهجي.جھلي کي sterile ٽيوب ۾ ذخيرو ڪريو. |
| چمڙي | احتياط سان چمڙي جي مٿاڇري کي جراثيم کان پاڪ ڪپهه جي سواب يا جراحي بليڊ سان ڇڪيو ۽ ان کي جراثيم کان پاڪ ٽيوب ۾ رکو. |
تجويز ڪيل نموني پهچائڻ
نموني کي 3-4 ڪلاڪن لاء مائع نائٽروجن ۾ منجمد ڪريو ۽ مائع نائيٽروجن يا -80 درجا ڊگھي مدت تائين محفوظ ڪريو.خشڪ برف سان نموني جي ترسيل گهربل آهي.
سروس ڪم فلو
نموني پهچائڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوء خدمتون
1. Heatmap: Species richness clustering
2. فنڪشنل جينز KEGG ميٽابولڪ رستن تي بيان ڪيل
3.Species correlation network
4.Circos of CARD اينٽي بايوٽڪ مزاحمتي جينز
BMK ڪيس
نانوپور ميٽگينومڪس بيڪٽيريا لوئر تنفس جي انفيڪشن جي تيز ڪلينڪ تشخيص کي قابل بڻائي ٿو
شايع ٿيل:فطرت بايو ٽيڪنالاجي، 2019
ٽيڪنيڪل نمايان
تسلسل: نانوپور منين
ڪلينڪل ميٽيگينومڪس بايو انفارميٽڪس: ميزبان ڊي اين اي ختم ڪرڻ، WIMP ۽ آرما تجزيو
تيز پتو لڳائڻ: 6 ڪلاڪ
اعلي حساسيت: 96.6٪
اهم نتيجا
2006 ۾، لوئر ريسپيريٽري انفيڪشن (LR) عالمي سطح تي 3 ملين انسانن جي موت جو سبب بڻيا.LR1 جي بيماريءَ جي سڃاڻپ لاءِ عام طريقو پوکڻ آهي، جنهن ۾ حساسيت گهٽ هوندي آهي، گهڻي وقت تي موڙ لڳندي آهي ۽ ابتدائي اينٽي بايوٽڪ علاج ۾ رهنمائي جي کوٽ هوندي آهي.هڪ تيز ۽ صحيح مائڪروبيل تشخيص ڊگهي عرصي کان هڪ تڪڙي ضرورت آهي.ايسٽ اينگليا يونيورسٽي مان ڊاڪٽر جسٽن ۽ سندس ساٿين ڪاميابيءَ سان هڪ نانوپور تي ٻڌل ميٽاجينومڪ طريقو تيار ڪيو جنهن ۾ پيٿوجين جي نشاندهي ڪئي وئي.انهن جي ڪم جي فلو جي مطابق، ميزبان ڊي اين اي جو 99.99٪ ختم ٿي سگهي ٿو.پيٿوجنز ۽ اينٽي بايوٽڪ مزاحمتي جينز جي سڃاڻپ 6 ڪلاڪن ۾ مڪمل ٿي سگهي ٿي.
حوالو
چارالامپوس، ٽي، ڪي، جي ايل، رچرڊسن، ايڇ، آئيڊين، اي، ۽ او گريڊي، جي.(2019).نانوپور ميٽگينومڪس بيڪٽيريا لوئر تنفس جي انفيڪشن جي تيز ڪلينڪ تشخيص کي قابل بڻائي ٿو.فطرت بايو ٽيڪنالاجي، 37(7)، 1.
