BMKCloud Log in
条形 بينر-03

مصنوعات

غير حوالي سان ٻڌل mRNA تسلسل-Illumina

mRNA ترتيب ڏيڻ ايندڙ نسل جي ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنڪ (NGS) کي اپنائڻ لاءِ ميسينجر RNA (mRNA) فارم Eukaryote کي مخصوص دور ۾ پڪڙيندي آهي ته ڪي خاص فنڪشن فعال ٿي رهيا آهن.ورهايل سڀ کان ڊگھي ٽرانسڪرپٽ کي 'Unigene' سڏيو ويو ۽ بعد ۾ تجزيي لاءِ حوالن جي ترتيب طور استعمال ڪيو ويو، جيڪو هڪ مؤثر وسيلو آهي انوکي ميکانيزم ۽ نسلن جي ريگيوليٽري نيٽ ورڪ کي بغير حوالن جي مطالعي ڪرڻ لاءِ.

ٽرانسڪروم ڊيٽا اسيمبلي ۽ يونيگين فنڪشنل تشريح کان پوء

(1) ايس ايس آر تجزيو، سي ڊي ايس جي اڳڪٿي ۽ جين جي جوڙجڪ کي اڳڀرائي ڪيو ويندو.

(2) هر نموني ۾ يونيجن اظهار جي مقدار کي انجام ڏنو ويندو.

(3) نمونن (يا گروپن) جي وچ ۾ مختلف طور تي ظاهر ڪيل يونيجنز کي دريافت ڪيو ويندو يونيجن اظهار جي بنياد تي

(4) ڪلسٽرنگ، فنڪشنل تشريح ۽ مختلف طور تي ظاهر ڪيل يونيجنز جي افزودگي جو تجزيو ڪيو ويندو.


خدمت جا تفصيل

بايو انفارميٽڪس

Demo نتيجا

ڪيس اسٽڊي

خاصيتون

● ڪنهن به حوالي جينوم کان آزاد،

● ڊيٽا کي استعمال ڪري سگھجي ٿو ٽرانسڪرپٽس جي ساخت ۽ اظهار جو تجزيو ڪرڻ لاءِ

● متغير ڪلپنگ سائيٽن جي سڃاڻپ ڪريو

سروس فائدا

● BMKCloud تي ٻڌل نتيجن جي ترسيل: نتيجا BMKCloud پليٽ فارم ذريعي ڊيٽا فائل ۽ انٽرايڪٽو رپورٽ جي طور تي پهچايا ويندا آهن، جيڪي استعمال ڪندڙ کي اجازت ڏين ٿا پيچيده تجزياتي نتيجن جي پڙهڻ ۽ ڪسٽمائيز ڊيٽا مائننگ جي بنياد تي معياري بايو انفارميٽڪس تجزيي جي بنياد تي.

● بعد ۾ وڪري جون خدمتون: پراجيڪٽ جي مڪمل ٿيڻ کان پوءِ 3 مهينن لاءِ وڪري کان پوءِ جون خدمتون، بشمول پروجيڪٽ جي پيروي ڪرڻ، مشڪلاتن کي حل ڪرڻ، نتيجا سوال ۽ جواب وغيره.

نموني جي گهرج ۽ پهچائڻ

نموني جي گهرج:

نيوڪليوٽائيڊس:

اتفاق (ng/μl)

رقم (μg)

پاڪائي

سالميت

≥ 20

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

جيل تي ڏيکاريل محدود يا ڪو پروٽين يا ڊي اين اي آلودگي.

ٻوٽن لاءِ: RIN≥6.5؛

جانورن لاءِ: RIN≥7.0؛

5.0≥28S/18S≥1.0؛

محدود يا بي بنياد بلندي

ٽشو: وزن (خشڪ): ≥1 گ
*5 mg کان ننڍي ٽشوز لاءِ، اسان تجويز ڪريون ٿا ته فليش منجمد (مائع نائٽروجن ۾) ٽشو نموني موڪلڻ لاءِ.

سيل معطلي: سيل ڳڻپ = 3 × 107
* اسان منجهيل سيل ليسٽ کي موڪلڻ جي صلاح ڏيو ٿا.ان صورت ۾ ته سيل 5 × 10 کان ننڍو ٿئي ٿو5، فليش منجمد مائع نائيٽروجن ۾ سفارش ڪئي وئي آهي.

رت جا نمونا:
PA×geneBloodRNATube؛
6mLTRIzol ۽ 2mL رت (TRIzol:Blood=3:1)

تجويز ڪيل نموني پهچائڻ

ڪنٽينر:
2 ml سينٽرفيوج ٽيوب (ٽين ورق سفارش نه ڪئي وئي آهي)
نموني ليبلنگ: گروپ + نقل ڪريو مثال طور A1، A2، A3؛B1, B2, B3...

ترسيل:
1. خشڪ برف: نمونن کي بيگز ۾ ڀريل ۽ خشڪ برف ۾ دفن ڪرڻ جي ضرورت آهي.
2.RNAstable tubes: RNA جا نمونا آر اين اي اسٽيبلائيزيشن ٽيوب (مثال طور RNAstable®) ۾ خشڪ ڪري سگھجن ٿا ۽ ڪمري جي حرارت تي موڪليا وڃن ٿا.

سروس ڪم فلو

نموني QC

تجربو ڊيزائن

نموني پهچائڻ

نموني پهچائڻ

پائلٽ تجربو

آر اين اي ڪڍڻ

لائبريري جي تياري

لائبريري جي تعمير

تسلسل

تسلسل

ڊيٽا جو تجزيو

ڊيٽا جو تجزيو

وڪري کان پوء خدمتون

وڪري کان پوء خدمتون


  • اڳيون:
  • اڳيون:

  • بايو انفارميٽڪس

    wps_doc_11

    1. mRNA (denovo) اسيمبليءَ جو اصول

    تثليث جي ذريعي، پڙهائي ننڍن ٽڪرن ۾ ورهايل آهن، جن کي K-mer طور سڃاتو وڃي ٿو.اهي K-mers پوءِ ٻج طور استعمال ڪيا ويندا آهن ڪنٽيگس ۾ وڌايا ويندا آهن ۽ پوءِ ڪنٽيگ اوورليپنگ تي جزو جو بنياد.آخرڪار، De Bruijn هتي لاڳو ڪيو ويو آهي اجزاء ۾ ٽرانسپشن کي سڃاڻڻ لاء.

    mRNA- (De-novo) - تثليث جو جائزو

    mRNA (De novo) تثليث جو جائزو

    2.mRNA (De novo) جين ايڪسپريس ليول جي ورڇ

    RNA-Seq جين اظهار جي انتهائي حساس اندازي حاصل ڪرڻ جي قابل آهي.عام طور تي، ٽرانسڪرپٽ ايڪسپريس FPKM جو پتو لڳائي سگهجي ٿو 10^-2 کان 10^6 تائين

    mRNA-(De-novo)-تقسيم-جي-FPKM-ڪثافت-۾-هر-نمونءَ ۾

    mRNA (De novo) هر نموني ۾ FPKM کثافت جي تقسيم

    3.mRNA (De novo) GO DEGs جي افزائش جو تجزيو

    GO (Gene Ontology) ڊيٽابيس هڪ منظم حياتياتي تشريح وارو نظام آهي جنهن ۾ جين ۽ جين پروڊڪٽس جي ڪمن جي معياري لفظ شامل آهي.اھو گھڻن سطحن تي مشتمل آھي، جتي گھٽ سطح آھي، وڌيڪ مخصوص افعال آھن.

    mRNA-(De-novo)-GO-درجه بندي-جي-DEGs-تي-سيڪنڊ-سطح

    mRNA (De novo) GO ٻئي سطح تي DEGs جي درجه بندي

    BMK ڪيس

    بلب سوجن ۽ پياز ۾ ترقي دوران Sucrose ميٽابولزم جو ٽرانسڪرپٽوم تجزيو (Allium cepa L.)

    شايع ٿيل: پلانٽ سائنس ۾ سرحدون، 2016

    ترتيب واري حڪمت عملي

    Illumina HiSeq2500

    نموني گڏ ڪرڻ

    يوٽا پيلي مٺي اسپين جي ڪلٽيور "Y1351" هن مطالعي ۾ استعمال ڪيو ويو.گڏ ڪيل نمونن جو تعداد هو
    بلب جي سوڄ (DAS) کان پوءِ 15هين ڏينهن (2-سي ايم قطر ۽ 3-4 گرام وزن)، 30هين DAS (5-سي ايم قطر ۽ 100-110 گرام وزن)، ۽ ∼3 40هين DAS تي (7-سي ايم قطر ۽ 260-300 گرام).

    اهم نتيجا

    1. وين ڊراگرام ۾، مجموعي طور تي 146 DEGs دريافت ڪيا ويا سڀني ٽن جوڑوں جي ترقي جي مرحلن ۾
    2. ”ڪاربوهائيڊريٽ ٽرانسپورٽ ۽ ميٽابولزم“ صرف 585 يونيجينز (يعني 7٪ اينٽيٽ ٿيل COG) جي نمائندگي ڪئي وئي هئي.
    3.Unigenes ڪاميابيءَ سان GO ڊيٽابيس ۾ بيان ڪيل بلب ڊولپمينٽ جي ٽن مختلف مرحلن لاءِ ٽن مکيه ڀاڱن ۾ ورهايل هئا.سڀ کان وڌيڪ نمائندگي "حياتياتي عمل" جي پرنسپل درجي ۾ "ميٽابولڪ عمل"، "سيلولر پروسيس" جي پٺيان.”ماليڪيولر فنڪشن“ جي پرنسپل ڪيٽيگري ۾ ٻه ڀاڱا سڀ کان وڌيڪ نمايان هئا ”بائنڊنگ“ ۽ ”ڪيٽيليٽڪ سرگرمي“.

    PB-مڪمل-لمبائي-RNA-Sequencing-ڪيس-مطالعو

    هسٽوگرام آف ڪلسٽرز آف آرٿولوجس گروپ (COG) جي درجه بندي

    PB-مڪمل-لمبائي-RNA-Sequencing-ڪيس-مطالعو

    هسٽوگرام آف جين آنٽولوجي (GO) جي درجه بندي ٽن ترقياتي مرحلن ۾ بلب مان نڪتل يونيجينز لاءِ

    PB-مڪمل-لمبائي-RNA-Sequencing-ڪيس-مطالعو

    وين آريگرام ڏيکاريندي جين کي مختلف طور تي ظاهر ڪيو ويو آهي انين بلب جي ترقي جي ٻن مرحلن ۾

    حوالو

    ژانگ سي، ژانگ ايڇ، زن زي، وغيره.انين ۾ بلب سوجن ۽ ڊولپمينٽ دوران سوڪروز ميٽابولزم جو ٽرانسڪرپٽوم تجزيو (ايليم سيپا ايل.) [J].فرنٽيئرز ان پلانٽ سائنس، 2016، 7:1425-.DOI: 10.3389/fpls.2016.01425

    هڪ اقتباس حاصل ڪريو

    پنهنجو پيغام هتي لکو ۽ اسان ڏانهن موڪليو

    اسان ڏانهن پنهنجو پيغام موڪليو: