-
Metagenomic تسلسل - NGS
ميٽگينوم هڪ مجموعي جينياتي مواد جو هڪ مجموعو آهي، جاندارن جي مخلوط ڪميونٽي، جهڙوڪ ماحولياتي ۽ انساني ميٽاگينوم. ان ۾ پوکڻ جي قابل ۽ غير پوکيل جاندارن جي جينوم شامل آهن. NGS سان شاٽگن ميٽيگينومڪ تسلسل انهن پيچيده جينومڪ منظرن جي مطالعي کي قابل بنائي ٿو جيڪي ماحولياتي نموني ۾ شامل ڪيا ويا آهن ٽيڪونومڪ پروفائلنگ کان وڌيڪ مهيا ڪندي، نسلن جي تنوع، گهڻائي جي متحرڪ، ۽ پيچيده آبادي جي جوڙجڪ ۾ گرينولر بصيرت پڻ ڏئي ٿي. ٽيڪونومڪ مطالعي کان ٻاهر، شاٽگن ميٽاگينومڪس پڻ پيش ڪري ٿو هڪ فنڪشنل جينومڪس نقطه نظر، انڪوڊ ٿيل جين جي ڳولا ۽ ماحولياتي عملن ۾ انهن جي بنيادي ڪردار کي چالو ڪرڻ. آخرڪار، جينياتي عناصر ۽ ماحولياتي عنصر جي وچ ۾ رابطي واري نيٽ ورڪ جو قيام مائڪروبيل برادرين ۽ انهن جي ماحولياتي پس منظر جي وچ ۾ پيچيده مداخلت جي مجموعي سمجھ ۾ مدد ڪري ٿو. نتيجي ۾، metagenomic تسلسل مختلف مائڪروبيل برادرين جي جينومڪ پيچيدگين کي ختم ڪرڻ لاء هڪ اهم اوزار جي طور تي بيٺو آهي، انهن پيچيده ماحولياتي نظام جي اندر جينياتي ۽ ماحوليات جي وچ ۾ گھڻائي رشتي کي روشن ڪري ٿو.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq ۽ DNBSEQ-T7
-
Metagenomic تسلسل-TGS
ميٽگينوم (Metagenome) جاندارن جي مخلوط ڪميونٽي جي جينياتي مواد جو هڪ مجموعو آهي، جهڙوڪ ماحولياتي ۽ انساني ميٽاگينوم. ان ۾ پوکڻ جي قابل ۽ غير پوکيل جاندارن جي جينوم شامل آهن. Metagenomic sequencing انهن پيچيده جينومڪ منظرن جي مطالعي کي قابل بنائي ٿو جيڪي ماحولياتي نموني ۾ شامل ڪيا ويا آهن ٽيڪونومڪ پروفائلنگ کان وڌيڪ مهيا ڪندي. اهو پڻ پيش ڪري ٿو هڪ فنڪشنل جينومڪس نقطه نظر انڪوڊ ٿيل جينز ۽ ماحولياتي عملن ۾ انهن جي بنيادي ڪردار جي ڳولا ڪندي. جڏهن ته Illumina جي ترتيب سان روايتي شاٽگن جي طريقن کي وڏي پيماني تي استعمال ڪيو ويو آهي ميٽاجينومڪ مطالعي ۾، نانوپور جي آمد ۽ PacBio ڊگهي-پڙهندڙ تسلسل فيلڊ کي تبديل ڪري ڇڏيو آهي. Nanopore ۽ PacBio ٽيڪنالاجي ھيٺئين وهڪرو بايو انفارميٽڪ تجزين کي وڌايو، خاص طور تي ميٽگينوم اسيمبلي، وڌيڪ مسلسل اسيمبلين کي يقيني بڻائي. رپورٽون ظاهر ڪن ٿيون ته Nanopore-based ۽ PacBio-based metagenomics ڪاميابيءَ سان مڪمل ۽ بند ٿيل بيڪٽيريا جينومس پيچيده مائڪروبيومس (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020) مان ٺاهيا آهن. نانوپور ريڊس کي ايلومينا ريڊز سان ضم ڪرڻ، نانوپور جي موروثي گھٽ درستگي کي گھٽائڻ، غلطي جي اصلاح لاءِ حڪمت عملي جو رستو مهيا ڪري ٿو. هي هم وقت سازي ميلاپ هر هڪ ترتيب واري پليٽ فارم جي طاقت جو فائدو وٺي ٿو، امڪاني حدن کي ختم ڪرڻ ۽ ميٽاجينومڪ تجزين جي درستگي ۽ اعتبار کي وڌائڻ لاءِ هڪ مضبوط حل پيش ڪري ٿو.
پليٽ فارم: Nanopore PromethION 48، Illumia ۽ PacBio Revio
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S ۽ 18S rRNA جينس، اندروني ٽرانسڪرائڊ اسپيسر (ITS) علائقي سان گڏ، انتهائي محفوظ ۽ هائپر-متغير علائقن جي ميلاپ جي ڪري اهم ماليڪيولر فنگر پرنٽنگ مارڪرن جي طور تي ڪم ڪن ٿا، انهن کي پروڪريوٽڪ ۽ يوڪريوٽڪ آرگنزم جي خصوصيت لاءِ انمول اوزار بڻائي ٿو. انهن علائقن کي وڌائڻ ۽ ترتيب ڏيڻ مختلف ماحولياتي نظامن ۾ مائڪروبيل ساخت ۽ تنوع جي تحقيق لاءِ هڪ الڳ الڳ طريقي سان پيش ڪن ٿا. جڏهن ته Illumina تسلسل عام طور تي مختصر هائپر ويريبل علائقن کي نشانو بڻائيندو آهي جهڙوڪ 16S ۽ ITS1 جي V3-V4، اهو ظاهر ڪيو ويو آهي ته اعليٰ ٽيڪسونومڪ تشريح 16S، 18S، ۽ ITS جي پوري ڊيگهه کي ترتيب ڏيندي حاصل ڪري سگهجي ٿي. هي جامع طريقي سان نتيجن کي درست طور تي درجه بندي ڪيل ترتيبن جي اعلي سيڪڙو ۾، قرارداد جي سطح حاصل ڪري ٿو جيڪا نسلن جي سڃاڻپ تائين وڌايو وڃي. PacBio جو سنگل ماليڪيول ريئل ٽائم (SMRT) ترتيب ڏيڻ وارو پليٽ فارم انتهائي درست ڊگھي ريڊز (HiFi) مهيا ڪندي بيٺو آهي جيڪو مڪمل ڊگھي ايمپليڪن کي ڍڪي ٿو، Illumina جي ترتيب جي درستگي کي مقابلو ڪري ٿو. اها صلاحيت محققن کي هڪ بي مثال فائدو حاصل ڪرڻ جي اجازت ڏئي ٿي - جينياتي نظارن جو هڪ خوبصورت منظر. وڌايل ڪوريج خاص طور تي نسلن جي تشريح ۾ قرارداد کي بلند ڪري ٿي، خاص طور تي بيڪٽيريا يا فنگل برادرين جي اندر، مائڪروبيل آبادي جي پيچيدگين کي وڌيڪ سمجھڻ جي قابل بڻائي ٿي.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Illumina ٽيڪنالاجي سان امپليڪون ترتيب ڏيڻ، خاص طور تي 16S، 18S، ۽ ITS جينياتي نشانن کي نشانو بڻائڻ، مائڪروبيل برادرين جي اندر phylogeny، Taxonomy، ۽ نسلن جي گهڻائي کي ختم ڪرڻ لاءِ هڪ طاقتور طريقو آهي. ھن طريقي ۾ گھر جي سنڀال جي جينياتي نشانن جي هائپر ويريبل علائقن کي ترتيب ڏيڻ شامل آھي. اصل ۾ هڪ ماليڪيولر فنگر پرنٽ جي طور تي متعارف ڪرايو ويووائيس وغيره1977 ۾، هن ٽيڪنڪ مائڪرو بائيووم پروفائلنگ ۾ انقلاب آڻي ڇڏيو آهي اڪيلائي کان آزاد تجزين کي چالو ڪندي. 16S (بيڪٽيريا)، 18S (فنگ)، ۽ اندروني ٽرانسڪرپٽ اسپيسر (ITS، فنگس) جي ترتيب جي ذريعي، محقق نه رڳو گهڻيون نسلن جي سڃاڻپ ڪري سگھن ٿا پر نادر ۽ اڻڄاتل پڻ. وڏي پيماني تي هڪ اهم اوزار جي طور تي اختيار ڪيو ويو آهي، ايمپليڪن جي ترتيب مختلف ماحول جي وچ ۾ تفاوت مائڪروبيل مرکبات کي سمجهڻ ۾ اوزار بڻجي چڪو آهي، بشمول انساني وات، اندريون، اسٽول، ۽ ان کان ٻاهر.
-
بيڪٽيريا ۽ فنگل سڄو جينوم ٻيهر ترتيب ڏيڻ
بيڪٽيريا ۽ فنگل پوري جينوم کي ٻيهر ترتيب ڏيڻ وارا منصوبا مائڪروبيل جينومڪس کي ترقي ڪرڻ ۽ مائڪروبيل جينومز جي مڪمل ٿيڻ ۽ مقابلي کي چالو ڪرڻ لاءِ اهم آهن. هي خمير انجنيئرنگ، صنعتي عملن جي اصلاح، ۽ ثانوي ميٽابولزم جي رستن جي ڳولا کي آسان بڻائي ٿو. ان کان علاوه، فنگل ۽ بيڪٽيريا جي ٻيهر ترتيب ڏيڻ ماحولياتي موافقت کي سمجهڻ، دٻاء کي بهتر ڪرڻ، ۽ جينياتي ارتقاء جي متحرڪات کي ظاهر ڪرڻ لاء، دوا، زراعت، ۽ ماحولياتي سائنس ۾ وسيع اثرات سان گڏ اهم آهي.
-
Prokaryotic RNA تسلسل
آر اين اي تسلسل خاص حالتن جي تحت سيلز اندر سڀني آر اين اي ٽرانسڪرپٽس جي جامع پروفائلنگ کي طاقت ڏئي ٿو. هي جديد ٽيڪنالاجي هڪ طاقتور اوزار جي طور تي ڪم ڪري ٿي، مختلف جينياتي عملن سان لاڳاپيل پيچيده جين اظهار جي پروفائلز، جين جي جوڙجڪ، ۽ ماليڪيول ميڪانيزم کي ظاهر ڪندي. بنيادي تحقيق، ڪلينڪل تشخيص، ۽ دوا جي ترقي ۾ وڏي پيماني تي منظور ڪيو ويو آهي، آر اين اي ترتيب پيش ڪري ٿو سيلولر متحرڪ ۽ جينياتي ضابطن جي پيچيدگين ۾. اسان جي پروڪريوٽڪ آر اين اي نموني پروسيسنگ پروڪريوٽڪ ٽرانسڪرومس لاءِ تيار ڪئي وئي آهي، جنهن ۾ آر آر اين اي جي گھٽتائي ۽ هدايت واري لائبريري جي تياري شامل آهي.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq
-
Metatranscriptome تسلسل
Illumina جي ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنالاجي کي استعمال ڪندي، BMKGENE جي ميٽ ٽرانسڪرپٽوم ترتيب ڏيڻ واري خدمت مختلف قسم جي جراثيمن جي متحرڪ جين اظهار کي ظاهر ڪري ٿي، يوڪريوٽس کان پروڪاريوٽس ۽ وائرس تائين، قدرتي ماحول جهڙوڪ مٽي، پاڻي، سمنڊ، اسٽول ۽ گٽ اندر. اسان جي جامع خدمت تحقيق ڪندڙن کي بااختيار بڻائي ٿي پيچيده مائڪروبيل برادرين جي مڪمل جين اظهار جي پروفائلز ۾. ٽيڪونومڪ تجزيي کان ٻاهر، اسان جي ميٽاترين اسڪرپٽ جي ترتيب واري خدمت فنڪشنل افزودگي جي ڳولا کي آسان بڻائي ٿي، مختلف طور تي ظاهر ڪيل جين ۽ انهن جي ڪردار تي روشني وجهي ٿي. حياتياتي بصيرت جي دولت کي دريافت ڪريو جيئن توهان انهن متنوع ماحولياتي طاقن جي اندر جين اظهار، ٽيڪسونومڪ تنوع، ۽ فنڪشنل متحرڪات جي پيچيده منظرنامي کي نيويگيٽ ڪريو.
-
ڊي نوو فنگل جينوم اسيمبلي
BMKGENE فنگل جينومز لاءِ ورسٽائل حل پيش ڪري ٿو، مختلف تحقيق جي ضرورتن کي پورو ڪرڻ ۽ مطلوب جينوم مڪمل ڪرڻ. مختصر-پڙهندڙ Illumina تسلسل کي استعمال ڪرڻ اڪيلو ڊرافٽ جينوم جي نسل کي اجازت ڏئي ٿو. Nanopore يا Pacbio استعمال ڪندي مختصر پڙھڻ ۽ ڊگھي پڙھڻ واري ترتيب کي وڌيڪ سڌريل فنگل جينوم لاءِ ڊگھي ڪنٽيگز سان گڏ ڪيو ويو آھي. ان کان علاوه، Hi-C جي ترتيب کي ضم ڪرڻ جي صلاحيت کي وڌيڪ وڌائي ٿو، مڪمل ڪروموزوم-سطح جينوم جي حاصلات کي چالو ڪري ٿو.
-
ڊي نوو بيڪٽيريل جينوم اسيمبلي
اسان هڪ مڪمل بيڪٽيريا جينوم اسيمبليء جي خدمت مهيا ڪندا آهيون، 0 فرق جي ضمانت. اهو ممڪن آهي ڊگھي پڙهڻ واري ترتيب واري ٽيڪنالاجيز کي ضم ڪرڻ سان، جهڙوڪ نانوپور ۽ PacBio اسيمبليءَ لاءِ ۽ مختصر-پڙهڻ واري ترتيب Illumina سان گڏ اسيمبلي جي تصديق ۽ ONT پڙهڻ جي غلطي جي اصلاح لاءِ. اسان جي خدمت مهيا ڪري ٿي اسيمبلي مان مڪمل بايو انفارميٽڪ ورڪ فلو، فنڪشنل تشريح، ۽ جديد بايو انفارميٽڪ تجزيو، مخصوص تحقيقي مقصدن کي پورو ڪندي. هي خدمت مختلف جينياتي ۽ جينوميڪ مطالعي لاء درست حوالن جينوم جي ترقي کي قابل بنائي ٿو. اضافي طور تي، اهو ايپليڪيشنن لاء بنياد ٺاهي ٿو جهڙوڪ اسٽريٽ آپٽمائيزيشن، جينياتي انجنيئرنگ، ۽ مائڪروبيل ٽيڪنالاجي ڊولپمينٽ، سائنسي بصيرت ۽ بايو ٽيڪنالاجي جدت کي اڳتي وڌائڻ لاء قابل اعتماد ۽ خلا کان آزاد جينومڪ ڊيٽا کي يقيني بڻائي.
