-
Metagenomic تسلسل - NGS
Metagenome مان مراد جاندارن جي مخلوط برادري جي ڪل جينياتي مواد جو مجموعو آهي، جهڙوڪ ماحولياتي ميٽاگينوم، انساني ميٽاگينوم، وغيره. ان ۾ پوکڻ جي قابل ۽ غير پوکيل جاندارن جي جينوم شامل آهن.Metagenomic sequencing هڪ ماليڪيولر اوزار آهي جيڪو ماحولياتي نموني مان نڪتل مخلوط جينومڪ مواد جو تجزيو ڪرڻ لاءِ استعمال ڪيو ويندو آهي، جيڪو تفصيلي معلومات مهيا ڪري ٿو نسلن جي تنوع ۽ ڪثرت، آبادي جي جوڙجڪ، فيلوجينيٽڪ رشتي، فنڪشنل جينز ۽ ماحولياتي عنصرن سان رابطي واري نيٽ ورڪ ۾.
پليٽ فارم:Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
Metagenomic تسلسل-نانوپور
Metagenomics هڪ ماليڪيولر اوزار آهي جيڪو ماحولياتي نموني مان نڪتل مخلوط جينومڪ مواد جو تجزيو ڪرڻ لاءِ استعمال ڪيو ويندو آهي، جيڪو تفصيلي معلومات مهيا ڪري ٿو نسلن جي تنوع ۽ گهڻائي، آبادي جي جوڙجڪ، فيلوجينيٽڪ لاڳاپن، فنڪشنل جينز ۽ ماحولياتي عنصرن سان رابطي واري نيٽ ورڪ وغيره. نانوپور ترتيب ڏيڻ واري پليٽ فارم تازو متعارف ڪرايو آهي. metagenomic اڀياس لاء.پڙهڻ جي ڊيگهه ۾ ان جي شاندار ڪارڪردگي وڏي پيماني تي وڌايو ويو هيٺيون وهڪرو ميٽاجينومڪ تجزيي، خاص طور تي ميٽگينوم اسيمبلي.پڙهڻ جي ڊگھائي جا فائدا کڻڻ، نانوپور جي بنياد تي ميٽيگينومڪ مطالعو شاٽ گن ميٽاگينومڪس جي مقابلي ۾ وڌيڪ مسلسل اسيمبلي حاصل ڪرڻ جي قابل آهي.اهو شايع ڪيو ويو آهي ته نانوپور جي بنياد تي ميٽاگينومڪس ڪاميابيء سان مڪمل ۽ بند ٿيل بيڪٽيريا جينوم مائڪروبيومس (Moss، EL، et. al.فطرت جي بايوٽيڪ، 2020)
پليٽ فارم:نانوپور PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S ۽ 18S rRNA تي سبيونٽ ٻنهي انتهائي محفوظ ۽ هائپر-متغير علائقن تي مشتمل آهي پروڪريوٽڪ ۽ يوڪريوٽڪ آرگنزمز جي سڃاڻپ لاءِ هڪ ڀرپور ماليڪيولر فنگر پرنٽ آهي.ترتيب ڏيڻ جو فائدو وٺندي، انهن amplicons کي محفوظ حصن جي بنياد تي نشانو بڻائي سگهجي ٿو ۽ هائپر-متغير علائقن کي مڪمل طور تي خاص ڪري سگهجي ٿو مائڪروبيل سڃاڻپ لاءِ جيڪي مطالعي ۾ حصو وٺندڙ مائڪروبيل تنوع جي تجزيي، ٽيڪنامي، فائيلوجني وغيره. سنگل ماليڪيول ريئل ٽائيم (SMRT) ) PacBio پليٽ فارم جي ترتيب انتهائي درست ڊگھي ريڊز حاصل ڪرڻ جي قابل بنائي ٿي، جيڪا پوري ڊگھائي ايمپليڪن (تقريبن 1.5 Kb) کي ڍڪي سگھي ٿي.جينياتي فيلڊ جي وسيع نظر کي بيڪٽيريا يا فنگي ڪميونٽي ۾ نسلن جي تشريح ۾ قرارداد کي تمام گهڻو وڌايو.
پليٽ فارم:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing جو مقصد آھي phylogeny, taxonomy, and species experience in a microbial community ۾ تحقيق ڪندي PCR پروڊڪٽس جي گھر جي سنڀاليندڙ جينياتي نشانن جي جن ۾ تمام گھڻيون ڳالھيون ۽ ھائيپر ويريبل حصا شامل آھن.Woeses et al، (1977) پاران انهن مڪمل ماليڪيولر فنگر پرنٽ جو تعارف اڪيلائي کان آزاد مائڪروبيوم پروفائلنگ کي طاقت ڏئي ٿو.16S (بيڪٽيريا)، 18S (فنگ) ۽ اندروني ٽرانسڪرپٽ اسپيسر (ITS، فنگس) جي تسلسل کي ٻنھي وڏين نسلن سان گڏوگڏ نادر ۽ اڻ ڄاتل جنس جي سڃاڻپ جي اجازت ڏئي ٿي.هي ٽيڪنالاجي هڪ وڏي پيماني تي لاڳو ٿيل ۽ اهم اوزار بڻجي چڪي آهي مختلف ماحول ۾ فرق جي مائڪروبيل ساخت جي سڃاڻپ ڪرڻ ۾، جهڙوڪ انساني وات، آنڊن، مٽي وغيره.
پليٽ فارم:Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
بيڪٽيريا ۽ فنگل سڄو جينوم ٻيهر ترتيب ڏيڻ
بيڪٽيريا ۽ فنگل پوري جينوم جي ٻيهر ترتيب ڏيڻ هڪ اهم اوزار آهي معلوم ٿيل بيڪٽيريا ۽ فنگس جي جينوم کي مڪمل ڪرڻ لاءِ، انهي سان گڏ ڪيترن ئي جينوم جو مقابلو ڪرڻ يا نئين جاندارن جي جينوم کي نقشي ڪرڻ لاءِ.اهو تمام ضروري آهي ته بيڪٽيريا ۽ فنگي جي سڄي جينوم کي ترتيب ڏيڻ لاء صحيح حوالو جينوم پيدا ڪرڻ لاء، مائڪروبيل جي سڃاڻپ ڪرڻ ۽ ٻين تقابلي جينوم مطالعي ڪرڻ لاء.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
Metatranscriptome تسلسل
Metatranscriptome sequencing مائرن جي جين اظهار جي نشاندهي ڪري ٿي (ٻنهي eukaryotes ۽ prokaryotes) قدرتي ماحول ۾ (يعني مٽي، پاڻي، سمنڊ، ٿلهي ۽ گٽ.) خاص طور تي، هي خدمتون توهان کي مڪمل جين ايڪسپريس پروفائلنگ حاصل ڪرڻ جي اجازت ڏئي ٿي پيچيده مائڪروبيل برادرين جي مڪمل جين ايڪسپريس پروفائيلنگ، ٽيڪسونوميڪيشن. نسلن جو، مختلف طور تي ظاهر ڪيل جين جو فنڪشنل افزودگي جو تجزيو، ۽ وڌيڪ.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
فنگل جينوم
بائيو مارڪر ٽيڪنالاجيون مهيا ڪن ٿيون جينوم سروي، فائن جينوم ۽ پين مڪمل جينوم فنگل جي مخصوص تحقيقي مقصد جي بنياد تي.جينوم جي ترتيب، اسيمبلي ۽ فنڪشنل تشريح کي گڏ ڪري حاصل ڪري سگهجي ٿو ايندڙ نسل جي ترتيب + ٽئين نسل جي ترتيب کي اعلي سطحي جينوم اسيمبلي حاصل ڪرڻ لاء.ڪروموزوم سطح تي جينوم اسيمبليءَ کي آسان ڪرڻ لاءِ هاءِ-سي ٽيڪنالاجي پڻ استعمال ڪري سگهجي ٿي.
پليٽ فارم:PacBio Sequel II
نانوپور PromethION P48
Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
بيڪٽيريا مڪمل جينوم
بائيو مارڪر ٽيڪنالاجيز صفر خال سان بيڪٽيريا جي مڪمل جينوم جي تعمير تي ترتيب ڏيڻ جي خدمت مهيا ڪري ٿي.بيڪٽيريا جي مکيه ڪم فلو مڪمل جينوم تعمير ۾ شامل آهي ٽئين نسل جي ترتيب، اسيمبلي، فنڪشنل تشريح ۽ ترقي يافته بايو انفارميٽيڪل تجزيو مخصوص تحقيق جي مقصدن کي پورو ڪرڻ.بيڪٽيريا جينوم جي وڌيڪ جامع پروفائيلنگ انهن جي حياتياتي عملن جي بنيادي ميکانيزم کي ظاهر ڪرڻ جي طاقت ڏئي ٿي، جيڪا اعلي يوڪريوٽڪ نسلن ۾ جينوميڪ تحقيق لاء قيمتي حوالو پڻ فراهم ڪري سگهي ٿي.
پليٽ فارم:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq پليٽ فارم
PacBio Sequel II
