پروڪريوٽڪ آر اين اي جي ترتيب
خاصيتون
● آر اين اي نموني جي پروسيسنگ ۾ آر آر اين اي جي گهٽتائي شامل هئي جنهن کان پوءِ هدايتي آر اين اي لائبريري تيار ڪئي وئي.
● هڪ حوالي جينوم جي ترتيب تي ٻڌل بايو انفارميٽڪ تجزيو
● تجزيي ۾ جين اظهار ۽ ڊي اي جي شامل آهن پر ٽرانسڪرپٽ جي جوڙجڪ ۽ ايس آر اين اي تجزيو پڻ شامل آهي.
خدمت جا فائدا
●سخت معيار جو ڪنٽرول: اسان نموني ۽ لائبريري جي تياري کان وٺي ترتيب ۽ بايو انفارميٽڪس تائين سڀني مرحلن ۾ بنيادي ڪنٽرول پوائنٽس لاڳو ڪريون ٿا. هي محتاط نگراني مسلسل اعليٰ معيار جي نتيجن جي ترسيل کي يقيني بڻائي ٿي.
●اسٽرينڊ مخصوص ترتيب ڊيٽا: آر اين اي لائبريري جي تياري هدايتي هجڻ جي ڪري، اينٽي سينس ٽرانسڪرپٽس جي سڃاڻپ کي فعال بڻائي ٿي.
●مڪمل تجزيو پروڪريوٽڪ ٽرانسڪرپٽومز جي مطابق: بايو انفارميٽڪ پائپ لائن ۾ نه رڳو جين جي اظهار جو تجزيو شامل آهي پر ٽرانسڪرپٽ جي جوڙجڪ جو تجزيو پڻ شامل آهي، جنهن ۾ اوپيرون، يو ٽي آر ۽ پروموٽرز جي سڃاڻپ شامل آهي. ان ۾ ايس آر اين اي جو تجزيو پڻ شامل آهي، يعني ثانوي جوڙجڪ ۽ هدفن جي تشريح ۽ اڳڪٿي.
●سيلز کان پوءِ جي مدد: اسان جو عزم منصوبي جي مڪمل ٿيڻ کان اڳتي وڌي ٿو، 3 مهينن جي وڪري کان پوءِ جي خدمت جي مدت سان. هن وقت دوران، اسان نتيجن سان لاڳاپيل ڪنهن به سوال کي حل ڪرڻ لاءِ منصوبي جي پيروي، مسئلا حل ڪرڻ ۾ مدد، ۽ سوال ۽ جواب سيشن پيش ڪندا آهيون.
نموني جي گهرج ۽ پهچائڻ
| لائبريري | تسلسل جي حڪمت عملي | تجويز ڪيل ڊيٽا | معيار تي ضابطو |
| آر آر اين اي ختم ٿيل هدايتي لائبريري | ايلومينا پي اي 150 | 1-2 جي بي | Q30≥85٪ |
نموني جون گهرجون:
| ڪنڪ. (ng/μl) | مقدار (μg) | پاڪائي | سالميت |
| ≥ 50 | ≥ 1 | او ڊي 260/280=1.8-2.0 او ڊي 260/230=1.0-2.5 جيل تي محدود يا ڪابه پروٽين يا ڊي اين اي آلودگي نه ڏيکاري وئي آهي. | آر آءِ اين 6.5 |
تجويز ڪيل نموني پهچائڻ
ڪنٽينر: 2 ايم ايل سينٽريفيوج ٽيوب (ٽين ورق جي سفارش نه ڪئي وئي آهي)
نموني ليبلنگ: گروپ + نقل مثال طور A1، A2، A3؛ B1، B2، B3.
پهچ:
1. خشڪ برف: نمونن کي ٿيلهين ۾ پيڪ ڪرڻ ۽ خشڪ برف ۾ دفن ڪرڻ جي ضرورت آهي.
2. آر اين اي اسٽيبلائيزيشن ٽيوب: آر اين اي جا نمونا آر اين اي اسٽيبلائيزيشن ٽيوب (مثال طور آر اين اي اسٽيبلائيزيشن®) ۾ خشڪ ڪري سگهجن ٿا ۽ ڪمري جي حرارت تي موڪلي سگهجن ٿا.
سروس ڪم جو وهڪرو
نموني پهچائڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوءِ جون خدمتون
بايو انفارميٽڪ تجزيو ورڪ فلو
هيٺ ڏنل تجزيو شامل آهي:
● خام ڊيٽا جي معيار جو ڪنٽرول
● ريفرنس جينوم سان ترتيب ڏيڻ
● لائبريري جي معيار جو جائزو: آر اين اي فريگمينٽيشن بي ترتيبي، داخل سائيز ۽ ترتيب جي سنترپتي
● اڳڪٿي ڪيل ڪوڊنگ جينز جي فنڪشنل تشريح
● اظهار جو تجزيو: رابطي ۽ پرنسپل ڪمپونينٽ تجزيو (PCA)
● ڊفرنشل جين ايڪسپريشن (DEGs)
● ڊي اي جيز جي فنڪشنل تشريح ۽ افزودگي
● sRNA تجزيو: اڳڪٿي، تشريح، هدف، ۽ ثانوي جوڙجڪ جي اڳڪٿي
● ٽرانسڪرپٽ جي جوڙجڪ جو تجزيو: اوپيرون، شروعاتي ۽ ختم ٿيندڙ پوزيشن، غير ترجمو ٿيل علائقو (UTS)، پروموٽر، ۽ SNP/InDel تجزيو.
تسلسل جي سنترپتي
ڪوڊنگ جينز جي فنڪشنل تشريح
نمونن جي وچ ۾ لاڳاپو
ڊفرنشل ايڪسپريسڊ جينز (ڊي اي جي) جو تجزيو
فنڪشنل افزودگي جو تجزيو
sRNA تشريح
هن نمايان اشاعت ۾ BMKGene جي نانوپور مڪمل ڊيگهه واري mRNA ترتيب ڏيڻ واري خدمتن پاران سهولت فراهم ڪيل ترقي کي ڳولهيو.
گوان، سي پي ۽ ٻيا (2018) 'سوفوريا الوپيڪوروائيڊس جي ڪل الڪلائيڊس جي جواب ۾ بايو فلم ٺاهڻ واري اسٽيفيلوڪوڪس ايپيڊرميڊس جي عالمي ٽرانسڪرپٽومي تبديليون'،پولش جرنل آف مائڪرو بائيولاجي، 67 (2)، ص. 223. doi: 10.21307/PJM-2018-024.
