مخصوص-لوڪس ايمپليفائيڊ فريگمينٽ تسلسل (SLAF-Seq)
خدمت جا تفصيل
ٽيڪنيڪل اسڪيم
ڪم جي وهڪري
سروس فائدا
اعلي مارڪر دريافت جي ڪارڪردگي- اعليٰ ذريعي ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنالاجي SLAF-Seq کي سڄي جينوم اندر سوين هزارين ٽيگ ڳولڻ ۾ مدد ڪري ٿي.
جينوم تي گهٽ انحصار- اهو جنس تي لاڳو ٿي سگهي ٿو يا ته ريفرنس جينوم سان يا بغير.
لچڪدار اسڪيم ڊيزائن- سنگل اينزائم، ڊبل اينزائم، ملٽي اينزائم ھضم ۽ مختلف قسم جا انزايمز، سڀني کي مختلف تحقيقي مقصد يا نسلن کي پورو ڪرڻ لاءِ چونڊيو وڃي ٿو.سليڪو ۾ اڳ-تشخيص استعمال ڪيو ويندو آهي هڪ بهترين اينزيم ڊيزائن کي يقيني بڻائڻ لاء.
موثر enzymatic هضم- اڳ-تجربو حالتن کي بهتر ڪرڻ لاءِ ڪيو ويو، جيڪو رسمي تجربي کي مستحڪم ۽ قابل اعتماد بڻائي ٿو.ٽڪرا گڏ ڪرڻ جي ڪارڪردگي 95 سيڪڙو کان وڌيڪ حاصل ڪري سگھي ٿي.
برابر طور تي ورهايل SLAF ٽيگ- SLAF ٽيگ سڀني ڪروموزوم ۾ تمام گهڻي حد تائين برابر طور تي ورهايل آهن، سراسري طور تي حاصل ڪري رهيا آهن 1 SLAF في 4 kb.
اثرائتي بچاءُ جي ورجائي- SLAF-Seq ڊيٽا ۾ ورجائيندڙ تسلسل کي 5٪ کان گھٽ ڪيو ويو آهي، خاص طور تي انهن نسلن ۾ جن ۾ اعلي سطحي ورجائي، جهڙوڪ ڪڻڪ، مڪئي وغيره.
وسيع تجربو2000 کان وڌيڪ بند ٿيل SLAF-Seq منصوبا سوين نسلن تي پکڙيل ٻوٽن، ٿنڀن، پکين، حشرات، آبي جاندارن وغيره تي.
خود ترقي يافته بايو انفارميٽ ورڪ فلو- SLAF-Seq لاءِ هڪ مربوط بايو انفارميٽڪ ورڪ فلو BMKGENE پاران تيار ڪيو ويو ته جيئن حتمي پيداوار جي اعتبار ۽ درستگي کي يقيني بڻائي سگهجي.
خدمت جي وضاحت
| پليٽ فارم | اتفاق (ng/gl) | ڪل (ug) | OD260/280 |
| Illumina NovaSeq | >35 | >1.6(جلد>15μl) | 1.6-2.5 |
تجويز ڪيل ترتيب واري حڪمت عملي
ترتيب جي کوٽائي: 10X / ٽيگ
| جينوم سائيز | تجويز ڪيل SLAF ٽيگ |
| < 500 Mb | 100K يا WGS |
| 500 ايم بي - 1 جي بي | 100 K |
| 1 جي بي - 2 جي بي | 200 K |
| وشال يا پيچيده جينوم | 300 - 400K |
| درخواستون
| تجويز ڪيل آدمشماري اسڪيل
| ترتيب واري حڪمت عملي ۽ کوٽائي
| |
| کوٽائي
| ٽيگ نمبر
| ||
| GWAS
| نموني نمبر ≥ 200
| 10X
|
جي مطابق جينوم جي ماپ
|
| جينياتي ارتقا
| هر هڪ جا فرد ذيلي گروپ ≥ 10؛ مجموعي نموني ≥ 30
| 10X
| |
تجويز ڪيل نموني پهچائڻ
ظرف: 2 ml centrifuge ٽيوب
اڪثر نموني لاءِ، اسان سفارش ڪريون ٿا ته ايٿانول ۾ محفوظ نه ڪريو.
نموني ليبلنگ: نمونن کي واضح طور تي ليبل ٿيل هجڻ جي ضرورت آهي ۽ جمع ٿيل نموني معلومات فارم جي هڪجهڙائي.
ترسيل: خشڪ برف: نمونن کي پهرين ٿانو ۾ ڀريو وڃي ۽ خشڪ برف ۾ دفن ڪيو وڃي.
خدمت جو ڪم فلو
نموني QC
پائلٽ تجربو
SLAF - تجربو
لائبريري جي تياري
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوء خدمتون
1. نقشي جا انگ اکر
2. SLAF مارڪر ترقي
3. تغير جي تشريح
| سال | جرنل | IF | عنوان | درخواستون |
| 2022 | فطرت مواصلات | 17.694 | جينوميڪ بنياد گيگا ڪروموزوم ۽ گيگا جينوم جو وڻ پيون پيونيا اوستي | SLAF-GWAS |
| 2015 | نئون Phytologist | 7.433 | گھربل پيرن جا نشان لنگر جينومڪ علائقن ۾ زرعي اهميت وارا علائقا سويابين | SLAF-GWAS |
| 2022 | جرنل آف ايڊوانسڊ ريسرچ | 12.822 | G. hirsutum ۾ Gossypium barbadense جي جينوم-وائڊ مصنوعي مداخلت هڪ ئي وقت ۾ ڪپهه جي فائبر جي معيار ۽ پيداوار جي بهتري لاءِ اعليٰ مقام ظاهر ڪيو خاصيتون | SLAF - ارتقائي جينياتي |
| 2019 | ماليڪيولر پلانٽ | 10.81 | آبادي جينوميڪ تجزيي ۽ ڊي نوو اسيمبلي ويڊي جي اصليت کي ظاهر ڪن ٿا چانور هڪ ارتقائي راند جي طور تي | SLAF - ارتقائي جينياتي |
| 2019 | فطرت جينياتي | 31.616 | جينوم جي ترتيب ۽ عام ڪارپ جي جينياتي تنوع، سائپرنس ڪارپيو | SLAF-لنڪ جو نقشو |
| 2014 | فطرت جينياتي | 25.455 | پوکيل مونگ پھلي جو جينوم legume karyotypes، polyploid ۾ بصيرت مهيا ڪري ٿو ارتقاء ۽ فصل پالڻ. | SLAF-لنڪ جو نقشو |
| 2022 | پلانٽ بايو ٽيڪنالاجي جرنل | 9.803 | ST1 جي سڃاڻپ هڪ چونڊ کي ظاهر ڪري ٿي جنهن ۾ ٻج جي مورفولوجي کي هٽائڻ شامل آهي ۽ سويابين پالڻ دوران تيل جو مواد | SLAF-مارڪر ترقي |
| 2022 | بين الاقوامي جرنل آف ماليڪيولر سائنسز | 6.208 | گندم-ليمس موليس 2Ns (2D) جي سڃاڻپ ۽ ڊي اين اي مارڪر ڊولپمينٽ Disomic Chromosome متبادل | SLAF-مارڪر ترقي |
