16S/18S/ITS ඇම්ප්ලිකන් අනුක්රමණය-PacBio
සේවා විශේෂාංග
● අනුක්රමික වේදිකාව: PacBio Revio
● අනුක්රමික මාදිලිය: CCS (HiFi කියවීම්)
● HiFi SMRT සීනු පුස්තකාල සකස් කිරීමට පෙර ඇම්ප්ලිකන් ටැන්ඩම් සම්බන්ධ කිරීමෙන් පසුව ඉලක්ක කලාපයේ විස්තාරණය
සේවා වාසි
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයඉහළ වර්ගීකරණ විභේදනය: Tහැන් කෙටි-ඇම්ප්ලිකන් අනුක්රමණය,විශේෂ මට්ටමින් ඉහළ OTU වර්ගීකරණ අනුපාත සක්රීය කිරීම.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයඉතා නිවැරදි මූලික ඇමතුම්: PacBio CCS මාදිලි අනුපිළිවෙල (HiFi කියවීම්).
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයහුදකලා-නිදහස්: පාරිසරික සාම්පලවල ක්ෂුද්රජීවී සංයුතිය වේගයෙන් හඳුනා ගැනීම.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයපුළුල් ලෙස අදාළ වේ: විවිධ ක්ෂුද්රජීවී ප්රජා අධ්යයන.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයවිස්තීර්ණ ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය: දත්ත සමුදාය, විවරණ, OTU/ASV අනුව විවිධ විශ්ලේෂණ සහිත නවතම QIIME2 පැකේජය (ක්ෂුද්රජීවී පරිසර විද්යාව පිළිබඳ ප්රමාණාත්මක අවබෝධය).
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයපුළුල් විශේෂඥතාව: වාර්ෂිකව පවත්වනු ලබන ඇම්ප්ලිකන් අනුක්රමික ව්යාපෘති දහස් ගණනක් සමඟින්, BMKGENE දශකයකට වැඩි පළපුරුද්දක්, ඉහළ කුසලතා ඇති විශ්ලේෂණ කණ්ඩායමක්, පුළුල් අන්තර්ගතයක් සහ විශිෂ්ට අලෙවියෙන් පසු සහායක් ගෙන එයි.
සේවා පිරිවිතර
| පුස්තකාලය | අනුපිළිවෙල උපාය මාර්ගය | නිර්දේශිත දත්ත |
| ඇම්ප්ලිකන් | පැක්බයෝ රිවියෝ | 10/30/50 K ටැග් (CCS) |
නියැදි අවශ්යතා
| සාන්ද්රණය (ng/µL) | මුළු ප්රමාණය (µg) | පරිමාව (µL) |
| ≥5 ≥5 | ≥0.3 යනු 0.3% ක් පමණි. | ≥20 |
නිර්දේශිත නියැදි බෙදාහැරීම
සාම්පල පැය 3-4ක් ද්රව නයිට්රජන් වල කැටි කර ද්රව නයිට්රජන් හෝ -80°C දිගු කාලීන වෙන්කිරීමක ගබඩා කරන්න. වියළි අයිස් සමඟ සාම්පල නැව්ගත කිරීම අවශ්ය වේ.
සේවා වැඩ ප්රවාහය
සාම්පල භාරදීම
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
පහත විශ්ලේෂණයන් ඇතුළත් වේ:
● අමු දත්ත තත්ත්ව පාලනය
●OTU පොකුරුකරණය/ශබ්ද ඉවත් කිරීම(ASV)
●OTU විවරණය
●ඇල්ෆා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය: ෂැනන්, සිම්ප්සන් සහ ACE ඇතුළු බහු දර්ශක.
●බීටා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය
●අන්තර් කණ්ඩායම් විශ්ලේෂණය
●සහසම්බන්ධතා විශ්ලේෂණය: පාරිසරික සාධක සහ පිටත සංයුතිය සහ විවිධත්වය අතර
●16S ක්රියාකාරී ජාන පුරෝකථනය
වර්ගීකරණ ව්යාප්තියේ හිස්ටෝග්රෑම්
ප්රජා ව්යාප්ති ෆයිලොජෙනටික් ගස
ඇල්ෆා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය: ACE
දර්ශකය
බීටා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය: PCoA
අන්තර් කණ්ඩායම් විශ්ලේෂණය: ANOVA
සංක්ෂිප්ත ප්රකාශන එකතුවක් හරහා PacBio සමඟ BMKGene හි ඇම්ප්ලිකන් අනුක්රමික සේවාවන් මගින් පහසුකම් සපයන ලද දියුණුව ගවේෂණය කරන්න.
ගාඕ, එක්ස්. සහ වැන්ග්, එච්. (2023) 'ඇල්පයින් තණබිමක වැඩෙන අදියර දෙකක් සහිත ඇල්පයින් මෙරිනෝ බැටළුවන්ගේ විවිධ ෆීනොලොජි (නැවත හරිතකරණය එදිරිව තණකොළ) වලට අනුවර්තනය වීමේදී රූමන් බැක්ටීරියා පැතිකඩ සහ ක්රියාකාරිත්වයන් පිළිබඳ සංසන්දනාත්මක විශ්ලේෂණය', පැසවීම, 9(1), පිටුව 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
Li, S. et al. (2023) 'සංස්කෘතික විද්යාව මත පදනම් වූ මෙටජෙනොමික්ස් සහ අධි-විභේදන විශ්ලේෂණය භාවිතයෙන් කාන්තාර පසෙහි ක්ෂුද්රජීවී අඳුරු පදාර්ථ ග්රහණය කර ගැනීම', npj ජෛව පටල සහ ක්ෂුද්රජීවීන් 2023 9:1, 9(1), පිටු. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu, L. et al. (2022) 'ඇල්ෆල්ෆා, සහල් පිදුරු සහ තිරිඟු නිවුඩ්ඩ සමඟ සකස් කරන ලද මිශ්ර සිලේජ් වල පැසවීමේ ලක්ෂණ, බැක්ටීරියා විවිධත්වය සහ වායුගෝලීය ස්ථායිතාව කෙරෙහි මේද අම්ල ලවණවල බලපෑම්', ආහාර හා කෘෂිකර්ම විද්යාව පිළිබඳ සඟරාව, 102(4), පිටු. 1475–1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
යැං, ජේ. සහ තවත් අය (2023) 'වැඩිහිටි සීබ්රාෆිෂ් තුළ ඔක්සසොලෝන්-ප්රේරිත බඩවැල් ඔක්සිකාරක ආතතියේ සොන්කස් බ්රැකියෝටස් ඩීසී හි නිස්සාරණයන්හි ප්රතිඔක්සිකාරක බලපෑම් වලදී ඔක්සිකාරක ආතති ජෛව සලකුණුකරුවන් සහ බඩවැල් ක්ෂුද්රජීව අතර අන්තර්ක්රියා', ප්රතිඔක්සිකාරක 2023, වෙළුම. 12, පිටුව 192, 12(1), පිටුව. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
