නිෂ්පාදන

සංසන්දනාත්මක ජාන විද්යාව

සංසන්දනාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව යනු විවිධ විශේෂවල සම්පූර්ණ ප්‍රවේණි අනුපිළිවෙල සහ ව්‍යුහයන් සංසන්දනය කිරීමයි.විවිධ විශේෂයන් හරහා සංරක්‍ෂණය වූ හෝ වෙනස් වූ අනුක්‍රමික ව්‍යුහයන් සහ මූලද්‍රව්‍ය හඳුනා ගැනීමෙන් ප්‍රවේණි මට්ටමින් විශේෂ පරිණාමය, ජාන ක්‍රියාකාරිත්වය, ජාන නියාමන යාන්ත්‍රණය හෙළිදරව් කිරීම මෙම විනය අරමුණු කරයි.සාමාන්‍ය සංසන්දනාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යා අධ්‍යයනයට ජාන පවුල, පරිණාමීය සංවර්ධනය, සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් කිරීම, වරණීය පීඩනය යනාදී විශ්ලේෂණයන් ඇතුළත් වේ.

අපව අමතන්න

සේවා විස්තර

Demo ප්‍රතිඵල

සිද්ධි අධ්‍යයනය

සේවා වාසි

● බහුලව අවශ්‍ය විශ්ලේෂණ අට අඩංගු විස්තීරණ විශ්ලේෂණ පැකේජය

● ප්‍රතිඵල පිළිබඳ සවිස්තරාත්මක සහ පහසුවෙන් තේරුම් ගත හැකි විග්‍රහයක් සහිත විශ්ලේෂණයේ ඉහළ විශ්වසනීයත්වය

● හොඳින් සැලසුම් කර ඇති ප්‍රකාශනයට සූදානම් රූප

● ඉහළ නිපුණතා සහිත ජෛව තොරතුරු කණ්ඩායම විවිධ පුද්ගලීකරණය කළ විශ්ලේෂණ ඉල්ලීම් ඉටු කරයි

● විශ්ලේෂණයේ වැඩි නිරවද්‍යතාවයක් සහිත කෙටි හැරවුම් කාලය

● සමුච්චිත ප්‍රකාශිත බලපෑම් සාධකය 900 ට වඩා වැඩි සාර්ථක සිද්ධීන් 90කට වඩා වැඩි අත්දැකීමක්

සේවා පිරිවිතර

ඇස්තමේන්තුගත හැරවුම් කාලය

විශේෂ ගණන

විශ්ලේෂණය කරයි

වැඩ කරන දින 30 යි

6 - 12

ජාන පවුල් පොකුරු

ජාන පවුලේ ව්යාප්තිය සහ හැකිලීම

Phylogenetic ගස් ඉදිකිරීම

අපසාරී කාලය ඇස්තමේන්තු (ෆොසිල ක්රමාංකනය අවශ්ය)

LTR ඇතුළත් කිරීමේ කාලය (ශාක සඳහා)

සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් කිරීම (ශාක සඳහා)

වරණීය පීඩනය

සංශ්ලේෂණ විශ්ලේෂණය

ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය

● ජාන පවුල

● Phylogenetics

● අපසරන කාලය

● වරණීය පීඩනය

● සංශ්ලේෂණ විශ්ලේෂණය

නියැදි අවශ්‍යතා සහ භාරදීම

නියැදි අවශ්‍යතා:

ජාන අනුක්‍රමණය සහ එකලස් කිරීම සඳහා පටක හෝ DNA

පටක සඳහා

විශේෂ	පටක	මිනුම්	PacBio CCS
සත්ව	අභ්යන්තර පටක	0.5 ~ 1 ග්රෑම්	≥ 3.5g
	මාංශ පේශි පටක		≥ 3.5g
			≥ 5.0g
			≥ 5.0mL
	ක්ෂීරපායී රුධිරය		≥ 5.0mL
	ක්ෂීරපායී රුධිරය		≥ 0.5mL
	කුකුළු මස් / මාළු ලේ		≥ 0.5mL
පැල	නැවුම් කොළ	1 ~ 2 ග්රෑම්	≥ 5.0g
	පෙති / කඳ	1 ~ 2 ග්රෑම්	≥ 10.0g
	මූල / බීජ	1 ~ 2 ග්රෑම්	≥ 20.0g
සෛල	සංස්කෘතික සෛලය	-	≥ 1 x 10⁸

දත්ත

සමීපව සම්බන්ධ විශේෂවල ප්‍රවේණි අනුක්‍රමික ගොනු(.fasta) සහ විවරණ ගොනු (.gff3)

සේවා වැඩ ප්රවාහය

අත්හදා බැලීම් නිර්මාණය

සාම්පල භාරදීම

පුස්තකාල ඉදිකිරීම

අනුපිළිවෙල

දත්ත විශ්ලේෂණය

අලෙවියෙන් පසු සේවා

කලින්: පරිණාමීය ජාන විද්යාව

ඊළඟ: තොග වෙන් කරන ලද විශ්ලේෂණය

*මෙහි පෙන්වා ඇති ආදර්ශන ප්‍රතිඵල සියල්ල Biomarker Technologies සමඟ ප්‍රකාශිත ජෙනෝම වලින් වේ

1.LTR ඇතුළු කිරීමේ කාලය ඇස්තමේන්තු කිරීම: අනෙකුත් විශේෂ හා සසඳන විට, වයිනිං රයි ජෙනෝමය තුළ LTR-RTs ඇතුළත් කිරීමේ වේලාවන්හි අද්විතීය ද්විමාධ්‍ය ව්‍යාප්තියක් රූපයේ දැක්වේ.මෑත කාලීන මුදුන වසර මිලියන 0.5 කට පමණ පෙර දර්ශනය විය.

3LTR-ඇතුළත් කිරීමේ-කාලය-ඇස්තමේන්තුව-හි-වයිනිං-රයි

Li Guang et al.,ස්වභාවික ජාන විද්යාව, 2021

2.චායෝටේ (Sechium edule) මත Phylogeny සහ ජාන පවුල් විශ්ලේෂණය : chayote සහ ජාන පවුලේ අනෙකුත් ආශ්‍රිත විශේෂ 13 විශ්ලේෂණය කිරීමෙන්, Chayote සර්ප කරවිල (Trichosanthes anguina) සමඟ වඩාත් සමීප සම්බන්ධයක් ඇති බව සොයා ගන්නා ලදී.27-45 Mya දී සර්ප කරවිල වලින් ලබාගත් Chayote සහ 25±4 Mya හි chayote හි සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් (WGD) නිරීක්ෂණය කරන ලදී, එය cucuibitaceae හි තුන්වන WGD සිදුවීම වේ.

4 Phylogenetic-tree-of-chayote

Fu A et al.,ගෙවතු වගා පර්යේෂණ, 2021

3.Synteny විශ්ලේෂණය: පලතුරු වර්ධනයේ දී phytohormones සම්බන්ධ සමහර ජාන චයෝටේ, සර්ප කරවිල සහ ස්කොෂ් වල දක්නට ලැබේ.චයෝට් සහ ස්කොෂ් අතර සහසම්බන්ධය චයෝටේ සහ සර්ප කරවිල අතර ඇති සම්බන්ධතාවයට වඩා තරමක් වැඩි ය.

4 Phylogenetic-tree-of-chayote

Fu A et al.,ගෙවතු වගා පර්යේෂණ, 2021

4.ජාන පවුල් විශ්ලේෂණය: G.thurberi සහ G.davidsonii ජෙනෝමවල ජාන පවුල් ව්‍යාප්තිය සහ හැකිලීම පිළිබඳ KEGG සුපෝෂණය මගින් ස්ටෙරොයිඩ් ජෛව සංස්ලේෂණය සහ බ්‍රැසිනොස්ටෙරොයිඩ් ජෛව සංස්ලේෂණය ආශ්‍රිත ජාන පුළුල් වී ඇති බව පෙන්නුම් කරයි.

4 Phylogenetic-tree-of-chayote

Yang Z et al.,BMC ජීව විද්යාව, 2021

5.සම්පූර්ණ ප්‍රවේණි අනුපිටපත් විශ්ලේෂණය: 4DTV සහ Ks බෙදාහැරීමේ විශ්ලේෂණය සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් කිරීමේ සිදුවීම පෙන්වයි.අනුපිටපත් සිදුවීම් පෙන්නුම් කරන අන්තර් විශේෂවල මුදුන්.අන්තර් විශේෂවල උච්ච විශේෂ සිදුවීම් පෙන්වයි.විශ්ලේෂණයෙන් පෙන්නුම් කළේ සමීපව සම්බන්ධ අනෙකුත් විශේෂ තුන සමඟ සසඳන විට, O. europaea වඩාත් මෑතක දී මහා පරිමාණ ජාන අනුපිටපත් කිරීමකට ලක් වූ බවයි.

4 Phylogenetic-tree-of-chayote

රාඕ ජී සහ අල්.ගෙවතු වගා පර්යේෂණ, 2021

BMK නඩුව

කටු නැති රෝස: තෙතමනය අනුවර්තනයට සම්බන්ධ ජානමය තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය

ප්‍රකාශිත: ජාතික විද්‍යා සමාලෝචනය, 2021

අනුපිළිවෙල උපාය:

'බසිගේකටු නැති(ආර්.විචුරයිනන්) ජෙනෝමය:
ආසන්න වශයෙන්.93 X PacBio + දළ වශයෙන්.90 X Nanopore + 267 X Illumina

ප්රධාන ප්රතිඵල

1.උසස් තත්ත්වයේ R.wichuraiana ජෙනෝමය තනන ලද්දේ දිගු-කියවන අනුක්‍රමික ක්‍රමවේදයන් භාවිතයෙන් වන අතර එමඟින් 530.07 Mb එකලස් කිරීමක් ලබා දෙයි (ඇස්තමේන්තුගත ජෙනෝම ප්‍රමාණය ප්‍රවාහ සයිටෝමිතිය මගින් 525.9 Mb සහ ජාන සමීක්ෂණය මගින් 525.5 Mb පමණ විය). Heterozygosity3% පමණ විය.BUSCO ඇස්තමේන්තුගත ලකුණු 93.9% කි."Old blush" (haploOB) සමඟ සසඳන විට, මෙම ජෙනෝමයේ ගුණාත්මක භාවය සහ සම්පූර්ණත්වය පාදක තනි-පාදක නිරවද්‍යතාවය සහ LTR එකලස් කිරීමේ දර්ශකය (LAI=20.03) මගින් තහවුරු කරන ලදී.R.wichuraiana ජෙනෝමයේ ප්‍රෝටීන් කේතීකරණ ජාන 32,674 ක් අඩංගු වේ.

2.Multi-omics ඒකාබද්ධ විශ්ලේෂණය, සංසන්දනාත්මක ජෙනොමික්ස්, ට්‍රාන්ස්ක්‍රිප්ටොමික්ස්, ප්‍රවේණික ජනගහනය පිළිබඳ QTL විශ්ලේෂණය, R. wichuraiana සහ Rosa chinensis අතර තීරණාත්මක විශේෂණය හෙළිදරව් කරන ලදී.එසේම, QTL හි අදාළ ජානවල ප්‍රකාශන විචලනය කඳේ කටු රටා සමඟ සම්බන්ධ වීමට ඉඩ ඇත.

7KEGG-පොහොසත් කිරීම-ජාන-පවුල-ප්‍රසාරණය-සහ-හැකිලීම

Basye;s Thornless සහ Rosa chinensis අතර සංසන්දනාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව විශ්ලේෂණය, සංශ්ලේෂණ විශ්ලේෂණය, ජාන පවුල් පොකුර, ප්‍රසාරණය සහ හැකිලීම විශ්ලේෂණය, රෝස මල් වල තීරණාත්මක ගති ලක්ෂණ වලට සම්බන්ධ විශාල වෙනස්කම් රාශියක් අනාවරණය කර ඇත.NAC සහ FAR1/FRS ජාන පවුලේ අද්විතීය ව්‍යාප්තිය කළු ලප වලට ප්‍රතිරෝධය සමඟ සම්බන්ධ වීමට බොහෝ දුරට ඉඩ තිබුණි.

81BT-සහ-OB අතර සංසන්දනාත්මක-ජෙනොමික්ස්-විශ්ලේෂණ 82BT-සහ-OB අතර සංසන්දනාත්මක-ජෙනොමික්ස්-විශ්ලේෂණ 83BT-සහ-OB අතර සංසන්දනාත්මක-ජෙනොමික්ස්-විශ්ලේෂණ