සංසන්දනාත්මක ජෙනොමික්ස්
සේවා වාසි
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයපුළුල් විශේෂඥතාව සහ ප්රකාශන වාර්තා: සමුච්චිත වීමත් සමඟ, BMKGene සංසන්දනාත්මක ප්රවේණික ව්යාපෘති 90 කට වඩා සම්පූර්ණ කර ඇති අතර, සමුච්චිත බලපෑම් සාධකය 900 දක්වා ළඟා විය.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයජෛව තොරතුරු විද්යාව පිළිබඳ පුළුල් විශ්ලේෂණයක්: විශ්ලේෂණ පැකේජයේ බහුලව අවශ්ය විශ්ලේෂණ අට අඩංගු වන අතර, හොඳින් සැලසුම් කරන ලද ප්රකාශනයට සූදානම් සංඛ්යා සපයන අතර ප්රතිඵල පහසුවෙන් අර්ථ නිරූපණය කිරීමට ඉඩ සලසයි.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයඉහළ කුසලතා ඇති ජෛව තොරතුරු විද්යා කණ්ඩායම සහ කෙටි විශ්ලේෂණ චක්රය: සංසන්දනාත්මක ජෙනෝමික් විශ්ලේෂණයේ විශිෂ්ට අත්දැකීම් ඇති BMKGene කණ්ඩායම කෙටි කාලයක් තුළ විවිධ පුද්ගලාරෝපිත විශ්ලේෂණ ඉල්ලීම් ඉටු කරයි.
● ● ශ්රව්ය දෘශ්යකරණයඅලෙවියෙන් පසු සහාය:අපගේ කැපවීම ව්යාපෘති නිම කිරීමෙන් ඔබ්බට විහිදෙන අතර අලෙවියෙන් පසු සේවා කාලය මාස 3 කි. මෙම කාලය තුළ, ප්රතිඵලවලට අදාළ ඕනෑම ප්රශ්නයක් විසඳීම සඳහා අපි ව්යාපෘති පසු විපරම්, දෝශ නිරාකරණ සහාය සහ ප්රශ්නෝත්තර සැසි පිරිනමන්නෙමු.
සේවා පිරිවිතර
| ඇස්තමේන්තුගත හැරවුම් කාලය | විශේෂ ගණන | විශ්ලේෂණයන් |
| වැඩ කරන දින 30 යි | 6-12 | ජාන පවුල් පොකුරුකරණය ජාන පවුලේ ප්රසාරණය සහ හැකිලීම ෆයිලොජෙනටික් ගස් ඉදිකිරීම අපසරන කාල ඇස්තමේන්තුව (ෆොසිල ක්රමාංකනය අවශ්යයි) LTR ඇතුළු කිරීමේ කාලය (ශාක සඳහා) සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත (ශාක සඳහා) වරණීය පීඩනය සංස්ලේෂණ විශ්ලේෂණය |
ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණ
● ජාන පවුල
● ජාන විද්යාව
● අපසරන කාලය
● වරණීය පීඩනය
● සංස්ලේෂණ විශ්ලේෂණය
නියැදි අවශ්යතා සහ බෙදා හැරීම
නියැදි අවශ්යතා:
ජෙනෝම අනුක්රමණය සහ එකලස් කිරීම සඳහා පටක හෝ DNA
පටක සඳහා
| විශේෂ | පටක | සමීක්ෂණය | පැක්බයෝ සීසීඑස් |
| සත්ව | දෘශ්ය පටක | 0.5 ~ 1 ග්රෑම් | ≥ 3.5 ග්රෑම් |
| මාංශ පේශි පටක | |||
| ≥ 5.0 ග්රෑම් | |||
| ≥ 5.0 මිලි | |||
| ක්ෂීරපායී රුධිරය | |||
| ≥ 0.5 මිලි | |||
| කුකුළු මස්/මාළු ලේ | |||
| ශාකය | නැවුම් කොළ | 1 ~ 2 ග්රෑම් | ≥ 5.0 ග්රෑම් |
| පෙති/කඳ | 1 ~ 2 ග්රෑම් | ≥ 10.0 ග්රෑම් | |
| මුල්/බීජ | 1 ~ 2 ග්රෑම් | ≥ 20.0 ග්රෑම් | |
| සෛල | වගා කරන ලද සෛලය | - | ≥ 1 x 108 |
දත්ත
සමීපව සම්බන්ධ විශේෂවල ජෙනෝම අනුක්රමික ගොනු (.fasta) සහ විවරණ ගොනු (.gff3)
සේවා වැඩ ප්රවාහය
අත්හදා බැලීම් නිර්මාණය
සාම්පල භාරදීම
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
*මෙහි දැක්වෙන නිරූපණ ප්රතිඵල සියල්ලම Biomarker Technologies සමඟ ප්රකාශයට පත් කරන ලද ජෙනෝම වලින් වේ.
1.LTR ඇතුළත් කිරීමේ කාල ඇස්තමේන්තුව: අනෙකුත් විශේෂ හා සසඳන විට, වෙයිනින් රයි ජෙනෝමය තුළ LTR-RT ඇතුළත් කිරීමේ කාලවල අද්විතීය ද්විමාන ව්යාප්තියක් රූපයේ දැක්වේ. මෑත කාලීන උච්චතම අවස්ථාව වසර මිලියන 0.5 කට පමණ පෙර දර්ශනය විය.
ලී ගුවාං සහ තවත් අය,ස්වභාව ජාන විද්යාව2021, ජූනි 19
2. චයෝට් (සෙචියම් එඩියුල්) පිළිබඳ ෆයිලොජෙනි සහ ජාන පවුල් විශ්ලේෂණය: චයෝට් සහ ජාන පවුලේ අනෙකුත් ආශ්රිත විශේෂ 13 විශ්ලේෂණය කිරීමෙන්, චයෝට් සර්ප කරවිල (ට්රයිකොසැන්තස් ඇන්ගුයිනා) සමඟ වඩාත් සමීපව සම්බන්ධ වන බව සොයා ගන්නා ලදී. චයෝට් 27-45 Mya දී පමණ සර්ප කරවිල වලින් ලබාගත් අතර 25±4 Mya දී චයෝට් හි සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත (WGD) නිරීක්ෂණය කරන ලදී, එය cucuibitaceae හි තුන්වන WGD සිදුවීමයි.
ෆු ඒ සහ තවත් අය,උද්යාන විද්යා පර්යේෂණ2021, ජූනි 19
3. සංස්ලේෂණ විශ්ලේෂණය: පලතුරු වර්ධනයේ ෆයිටෝහෝමෝන වලට අදාළ සමහර ජාන චයෝට්, පතෝල සහ ස්කොෂ් වල දක්නට ලැබුණි. චයෝට් සහ ස්කොෂ් අතර සහසම්බන්ධය චයෝට් සහ පතෝල අතර සම්බන්ධතාවයට වඩා තරමක් වැඩි ය.
ෆු ඒ සහ තවත් අය,උද්යාන විද්යා පර්යේෂණ2021, ජූනි 19
4. ජාන පවුල් විශ්ලේෂණය: G.thurberi සහ G.davidsonii ජෙනෝමවල ජාන පවුල් ප්රසාරණය සහ හැකිලීම පිළිබඳ KEGG පොහොසත් කිරීම මගින් ස්ටෙරොයිඩ් ජෛව සංස්ලේෂණය සහ බ්රැසිනොස්ටෙරොයිඩ් ජෛව සංස්ලේෂණය ආශ්රිත ජාන පුළුල් කර ඇති බව පෙන්නුම් කරන ලදී.
යැං ඉසෙඩ් සහ තවත් අය,BMC ජීව විද්යාව2021, ජූනි 19
5. සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් විශ්ලේෂණය: 4DTV සහ Ks ව්යාප්ති විශ්ලේෂණය මඟින් සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් සිදුවීම පෙන්වයි. අන්තර් විශේෂවල උච්චතම අවස්ථා අනුපිටපත් සිදුවීම් පෙන්වයි. අන්තර් විශේෂවල උච්චතම අවස්ථා විශේෂීකරණ සිදුවීම් පෙන්වයි. විශ්ලේෂණයෙන් පෙන්නුම් කළේ සමීපව සම්බන්ධ වූ අනෙකුත් විශේෂ තුන සමඟ සසඳන විට, O. europaea මෑතකදී මහා පරිමාණ ජාන අනුපිටපතක් හරහා ගිය බවයි.
රාඕ ජී සහ තවත් අය,උද්යාන විද්යා පර්යේෂණ2021, ජූනි 19
BMK නඩුව
කටු රහිත රෝස: තෙතමනය අනුවර්තනයට සම්බන්ධ ජානමය අවබෝධය.
ප්රකාශිත: ජාතික විද්යා සමාලෝචනය2021, ජූනි 19
අනුපිළිවෙල උපාය:
'බේසි'ගේකටු රහිත' (ආර්.විචුරයිනන්) ජෙනෝමය:
ආසන්න වශයෙන්. 93 X PacBio + ආසන්න වශයෙන්. 90 X නැනෝපෝර් + 267 X ඉලුමිනා
ප්රධාන ප්රතිඵල
1. උසස් තත්ත්වයේ R.wichuraiana ජෙනෝමය දිගු කියවීමේ අනුක්රමික ශිල්පීය ක්රම භාවිතයෙන් ඉදිකරන ලද අතර එමඟින් 530.07 Mb එකලස් කිරීමක් ලබා දෙයි (ඇස්තමේන්තුගත ජෙනෝම ප්රමාණය ප්රවාහ සයිටෝමෙට්රි මගින් ආසන්න වශයෙන් 525.9 Mb සහ ජෙනෝම සමීක්ෂණය මගින් 525.5 විය; විෂමජජෝතිත්වය 1.03% පමණ විය). BUSCO ඇස්තමේන්තුගත ලකුණු 93.9% ක් විය. “පැරණි බ්ලෂ්” (haploOB) සමඟ සසඳන විට, මෙම ජෙනෝමයේ ගුණාත්මකභාවය සහ සම්පූර්ණත්වය පාදක තනි-පාදක නිරවද්යතාවය සහ LTR එකලස් කිරීමේ දර්ශකය (LAI=20.03) මගින් තහවුරු කරන ලදී. R.wichuraiana ජෙනෝමය ප්රෝටීන් කේතීකරණ ජාන 32,674 ක් අඩංගු වේ.
2. සංසන්දනාත්මක ජෙනෝමික්ස්, ට්රාන්ස්ක්රිප්ටොමික්ස්, ජාන ජනගහනයේ QTL විශ්ලේෂණයන්ගෙන් සමන්විත බහු-ඔමික්ස් ඒකාබද්ධ විශ්ලේෂණය, R. විචුරියානා සහ රෝසා චයිනෙන්සිස් අතර තීරණාත්මක විශේෂණය හෙළි කළේය. තවද, QTL හි අදාළ ජානවල ප්රකාශන විචලනය කඳ කටු රටා සමඟ සම්බන්ධ වීමට ඉඩ තිබුණි.
බාසියේගේ තෝන්ලස් සහ රෝසා චයිනෙන්සිස් අතර සංශ්ලේෂණ විශ්ලේෂණය, ජාන පවුල් පොකුර, ප්රසාරණය සහ හැකිලීමේ විශ්ලේෂණය ඇතුළුව සංයුති විශ්ලේෂණය, රෝස මල් වල තීරණාත්මක ලක්ෂණ හා සම්බන්ධ විශාල වෙනස්කම් සංඛ්යාවක් අනාවරණය කළේය. NAC සහ FAR1/FRS ජාන පවුලේ අද්විතීය ප්රසාරණය කළු ලප වලට ප්රතිරෝධය සමඟ සම්බන්ධ වීමට බොහෝ දුරට ඉඩ තිබුණි.
BT සහ haploOB ජෙනෝම අතර සංසන්දනාත්මක ජෙනෝමික් විශ්ලේෂණය.
ෂොං, එම්., සහ තවත් අය. "කටු නොමැතිව රෝස: තෙතමනය අනුවර්තනයට සම්බන්ධ ජානමය අවබෝධය"ජාතික විද්යා සමාලෝචනය, 2021;, nwab092.
