BMKCloud Log in
条形බැනරය-03

නිෂ්පාදන

DNA/RNA අනුක්‍රමණය -PacBio අනුක්‍රමික

PacBio අනුක්‍රමික වේදිකාව දිගු-කියවන අනුක්‍රමික වේදිකාවක් වන අතර එය තුන්වන පරම්පරාවේ අනුක්‍රමික (TGS) තාක්ෂණයන්ගෙන් එකක් ලෙසද හැඳින්වේ.මූලික තාක්‍ෂණය, තනි-අණු තත්‍ය-කාලීන (SMRT), දිග කිලෝ-පාදක දස ගණනක් සමඟ කියවීම් උත්පාදනය බල ගන්වයි."Sequencing-by-Synthesis" පදනම මත, තනි නියුක්ලියෝටයිඩ විභේදනය Zero-mode waveguide (ZMW) මගින් ලබා ගනී, එහිදී (අණු සංශ්ලේෂණ අඩවියේ) පතුලේ සීමිත පරිමාවක් පමණක් ආලෝකමත් වේ.මීට අමතරව, SMRT අනුක්‍රමය බොහෝ දුරට NGS පද්ධතියේ අනුක්‍රමික-විශේෂිත පක්ෂග්‍රාහී වීම වළක්වයි, බොහෝ PCR වර්ධක පියවර පුස්තකාල ඉදිකිරීම් ක්‍රියාවලියේදී අවශ්‍ය නොවේ.

 

වේදිකාව: Sequel II, Revio


සේවා විස්තර

Demo ප්‍රතිඵල

විශේෂාංග

PacBio අනුක්‍රමණයේ අනුක්‍රමික ක්‍රම දෙකක්: අඛණ්ඩ දිගු කියවීම (CLR) සහ චක්‍රලේඛ එකඟතා කියවීම (CCS)

අනුක්‍රමික මාදිලිය පුස්තකාලයේ විශාලත්වය න්යායික දත්තඅස්වැන්න (සෛලයකට) තනි-පාදකනිරවද්යතාව අයදුම්පත්
CLR 20Kb, 30Kb, ආදිය. 80 Gb සිට 130 Gb දක්වා ආසන්න වශයෙන්.85% ද නවෝ, SV ඇමතුම්, ආදිය.
CCS 15-20 කි.බ

14 සිට 40 Gb/Cell (Sequel II)

70 සිට 110 Gb/Cell (Revio)

සාම්පල මත රඳා පවතී

ආසන්න වශයෙන්.99% ද නවෝ, SNP/Indel/SV ඇමතුම්, Iso-Seq,

Revio සහ Sequel II හි කාර්ය සාධනය සහ විශේෂාංග සංසන්දනය කිරීම

කොන්දේසි

අනුක්‍රමික II පද්ධතිය

Revio පද්ධතිය

වැඩි කරන්න

වැඩි ඝනත්වය

ZMW මිලියන 8ක්

ZMW මිලියන 25 කි

3x

ස්වාධීන අදියර

1

4

4x

කෙටි ධාවන කාලය

පැය 30 යි

පැය 24

1.25x

30X HiFi මානව ජෙනෝම / වර්ෂය

88

1,300 කි

1සමස්ත 5x

සේවා වාසි

● විවිධ විශේෂ සහිත සංවෘත ව්‍යාපෘති දහස් ගණනක් සහිත PacBio අනුක්‍රමික වේදිකාවේ වසර 8 කට වැඩි පළපුරුද්ද.

● ප්‍රමාණවත් අනුක්‍රමික ප්‍රතිදානයක් සහතික කිරීම සඳහා නවතම PacBio අනුක්‍රමික වේදිකා සමඟ සම්පුර්ණයෙන්ම සන්නද්ධව ඇත.

● වේගවත් හැරවුම් කාලය, ඉහළ දත්ත අස්වැන්නක් සහ වඩාත් නිවැරදි දත්ත.

● ඉහළ බලපෑමක් ඇති PacBio මත පදනම් වූ ප්‍රකාශන සිය ගණනකට දායක විය.

නියැදි අවශ්යතා


නියැදි වර්ගය ප්රමාණය සාන්ද්රණය (Qubit®) පරිමාව පිරිසිදුකම අන් අය
ජානමය DNA දත්ත අවශ්‍යතා මත රඳා පවතී ≥50 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.2;
OD260/230=1.8-2.5;
260 nm හි පැහැදිලි උපරිමය,දූෂණය නැත
සාන්ද්‍රණය Qubit සහ Qubit/Nanopore = 0.8-2.5 මගින් මැනිය යුතුය.
සම්පූර්ණ RNA ≥1.2μg ≥120 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.5;
OD260/230=0.5-2.5;දූෂණය නැත

RIN අගය ≥7.5

5≥28S/18S≥1

 

සේවා කාර්ය ප්රවාහය

නියැදි පිළියෙල

නියැදි පිළියෙල

පුස්තකාලය සකස් කිරීම

පුස්තකාල ඉදිකිරීම

අනුපිළිවෙල

අනුපිළිවෙල

දත්ත විශ්ලේෂණය

දත්ත විශ්ලේෂණය

සාම්පල QC

ව්යාපෘති භාරදීම


  • කලින්:
  • ඊළඟ:

  • 1.ගෘහස්ථ දත්ත අස්වැන්න

    CCS සෛල 63කින් (විශේෂ 26කින්) දත්ත ජනනය කරන ලදී

    දත්ත-PacBio-CCS-15 Kb සාමාන්යය උපරිම අවම මධ්යස්ථ
    අස්වැන්න - උප කියවා (Gb) 421.12 කි 544.27 කි 221.38 කි 426.58 කි
    Yiled - CCS(Gb) 25.93 කි 38.59 කි 10.86 කි 25.43 කි
    පොලිමරේස් N50 145,651 කි 175,430 කි 118,118 කි 144,689 කි
    උපසිරැසි N50 17,509 කි 23,924 කි 12,485 කි 17,584 කි
    CCS N50 14,490 කි 19,034 කි 9,876 කි 14,747 කි
    සාමාන්ය දිග - පොලිමරේස් 67,995 කි 89,379 කි 49,664 කි 66,433 කි
    සාමාන්‍ය දිග-උපපෙළ 15,866 කි 21,036 කි 11,657 කි 16,012 කි
    සාමාන්‍ය දිග-CCS 14,489 කි 19,074 කි 8,575 කි 14,655 කි

    CLR සෛල 16කින් (විශේෂ 76කින්) දත්ත ජනනය කරන ලදී

    DATA-PacBio-CLR-30Kb සාමාන්යය උපරිම අවම මධ්යස්ථ
    අස්වැන්න - උප කියවා (Gb) 142.20 කි 291.40 කි 50.55 කි 142.49 කි
    පොලිමරේස් N50 39,456 කි 121,191 කි 15,389 කි 35,231 කි
    උපසිරැසි N50 28,490 කි 41,012 කි 14,430 කි 29,063 කි
    සාමාන්ය දිග - පොලිමරේස් 22,063 කි 48,886 කි 8,747 කි 21,555 කි
    සාමාන්‍ය දිග-උපපෙළ 17,720 කි 27,225 කි 8,293 කි 17,779 කි

    2.Data QC – Demoදත්ත අස්වැන්න පිළිබඳ සංඛ්යා ලේඛන

    නියැදිය

    ccs අංකය කියවයි

    මුළු ccs පදනම් (bp)

    ccs කියවීම් N50 (bp)

    ccs මධ්‍යන්‍ය දිග (bp)

    ccs දිගම කියවීම (bp)

    උප කියවීම් පදනම් (bp)

    ccs අනුපාතය (%)

    PB_BMKxxx

    3,444,159 කි

    54,164,122,586 කි

    15,728 කි

    15,726 කි

    36,110 කි

    863,326,330,465

    6.27

     

    උපුටා ගැනීමක් ලබා ගන්න

    ඔබගේ පණිවිඩය මෙහි ලියා අප වෙත එවන්න

    ඔබගේ පණිවිඩය අපට එවන්න: